BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	221,979	G→C	7.4%	T226T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	221,979	0	G→C	7.4%	184.7 ‑1.3 ‑0.7	1402	T226T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (49/61): ref base (646/646): total (695/707)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.77e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.96e-01

Only 100 of 3704 total aligned reads displayed.


CCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCG  >  NC_014034/221879‑222079


   tggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtg                                                                                                   <  1:2610547‑M1/27‑2 (MQ=255)


        tcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                                                              >  1:1909118‑M1/70‑101 (MQ=255)


         cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtcc                                                                                             >  2:5851331‑M1/69‑101 (MQ=255)


            tgtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                                                                                          >  2:5532364/1‑101 (MQ=255)


              ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                                                        >  1:5468596‑M1/64‑101 (MQ=255)


               gatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggga                                                                                       <  2:6187262‑M1/39‑1 (MQ=255)


                atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggat                                                                                      >  1:7034424‑M1/62‑101 (MQ=255)


                  ccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                    <  1:2256651‑M1/42‑1 (MQ=255)


                   cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                                   <  1:8992562‑M1/43‑1 (MQ=255)


                    gtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                                  >  2:6525336‑M1/58‑101 (MQ=255)


                    gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgt                                                                                  >  1:6630668‑M1/58‑95 (MQ=255)


                      gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcg                                                                                <  2:8058997‑M1/46‑4 (MQ=255)


                       ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                               <  2:4769584‑M1/47‑1 (MQ=255)


                        gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGa                                                                              <  2:5152112‑M1/48‑1 (MQ=255)


                         gtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                                             <  1:1608680‑M1/49‑1 (MQ=255)


                           ccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATcc                                                                           <  1:409697‑M1/51‑1 (MQ=255)


                                gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTggg                                                                      <  1:4806633‑M1/56‑1 (MQ=255)


                                 gATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                     <  2:7500611/101‑1 (MQ=255)


                                       tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                               <  2:4502957‑M1/63‑1 (MQ=255)


                                        gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgcgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                              <  1:3285342‑M1/64‑1 (MQ=255)


                                         ggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                             <  1:4951852‑M1/65‑1 (MQ=255)


                                          gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg                                                            >  1:8322769‑M1/36‑101 (MQ=255)


                                            tgggacggttgCGTCGGATGAATCGGGTCCATCCGATCGCTCGGGTCCGTAGGAGCGGTCCGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                          <  2:1550486/91‑1 (MQ=2)


                                            tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                          >  2:8198508‑M1/34‑101 (MQ=255)


                                             tggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                         >  1:3933001‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                             cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                         <  1:5592678‑M1/69‑1 (MQ=255)


                                             cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                         <  1:1312118‑M1/69‑1 (MQ=255)


                                                  ggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                    >  1:687663‑M1/28‑101 (MQ=255)


                                                  gTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                    >  1:174172/1‑101 (MQ=255)


                                                  cgatccgtggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                    >  2:7672498‑M1/28‑101 (MQ=255)


                                                   gatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                   <  1:768705‑M1/75‑1 (MQ=255)


                                                     tccgtgggatcggtcgtgtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                 >  2:565208‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                                     tccgggggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                 >  2:2484563‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                                     ggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                 >  2:1683124/1‑101 (MQ=255)


                                                      ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                <  2:6659204‑M1/78‑1 (MQ=255)


                                                      ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                <  1:1144863‑M1/78‑1 (MQ=255)


                                                      ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                >  1:7286377‑M1/24‑101 (MQ=255)


                                                       cgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                               >  2:3087675‑M1/23‑101 (MQ=255)


                                                         tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                             >  1:7156533‑M1/21‑101 (MQ=255)


                                                          gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                            <  2:8816303‑M1/82‑1 (MQ=255)


                                                          gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                            <  2:3450376‑M1/82‑1 (MQ=255)


                                                          gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                            >  1:7514022‑M1/20‑101 (MQ=255)


                                                           ggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                           <  1:6454260‑M1/83‑1 (MQ=255)


                                                               cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                       <  2:6815068‑M1/87‑1 (MQ=255)


                                                               cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                       <  1:1459990‑M1/87‑1 (MQ=255)


                                                                  tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                    >  2:6949675/1‑101 (MQ=255)


                                                                   cgggtgcgtcggGTCGGGCGGGGCCGTGGGATCGGTGGGGTCCTTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                   <  1:4246354/94‑1 (MQ=11)


                                                                   cgggtcggtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTgg                                   <  1:2087993/97‑1 (MQ=11)


                                                                    gggtcgggcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg                                  <  1:1000386/98‑1 (MQ=11)


                                                                    ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                  >  2:7272727/10‑101 (MQ=11)


                                                                     ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGa                                 >  1:5729226/9‑101 (MQ=11)


                                                                       tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                               <  1:4551414/101‑1 (MQ=255)


                                                                       tccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                               >  1:3140366‑M1/7‑101 (MQ=255)


                                                                       tccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCTGGCCCGTGGGAtc                               >  1:2423885/4‑101 (MQ=11)


                                                                       tccgggGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                               >  1:5098700‑M1/7‑101 (MQ=255)


                                                                        tcgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg                              <  1:6276675/99‑1 (MQ=11)


                                                                         cgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcgg                             <  2:6345773/91‑1 (MQ=11)


                                                                           tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATAGGTCGGCTCCGTGGGGtcggtc                           >  2:4116529/3‑101 (MQ=11)


                                                                           tgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                           <  1:5296988/99‑1 (MQ=11)


                                                                            gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGAtcggtag                          >  2:7871981/2‑99 (MQ=11)


                                                                            gggatcggtcgggcccgggggatccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                          <  2:8343452/100‑1 (MQ=14)


                                                                            gGGATAGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggatccgtggggtccgtgg                          <  2:5995903‑M1/100‑9 (MQ=255)


                                                                                tcgctctgtcccgtgggatggagcgggtccgtgggatcggtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                      <  2:3767009/91‑1 (MQ=11)


                                                                                tccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtccgtcggatc                      >  2:8486090‑M2/1‑87 (MQ=255)


                                                                                gcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                      <  2:8658431/100‑1 (MQ=11)


                                                                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTcc                     >  2:204858/1‑101 (MQ=14)


                                                                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGCTCGGTCGGACCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                     >  1:2994970/1‑101 (MQ=11)


                                                                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTACGTGGGATGGGTCGGGTcg                     >  2:9031388/1‑100 (MQ=11)


                                                                                  ggtcgggtccgtgggatcggccgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggacccg                    <  1:8810236/101‑6 (MQ=11)


                                                                                  ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                    <  2:3983096/101‑1 (MQ=11)


                                                                                   gtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGACGGGTCCga                   >  2:7124888/7‑100 (MQ=11)


                                                                                   gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                   <  1:2793140/101‑1 (MQ=11)


                                                                                    tcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                  >  2:2650056‑M2/1‑100 (MQ=255)


                                                                                     cgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCgggg                 >  2:1186170/1‑98 (MQ=11)


                                                                                     cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTGCGtgg                 >  2:4336783/1‑99 (MQ=11)


                                                                                     cgggtccatgggatcggtcggctccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                 <  2:4903379/101‑3 (MQ=11)


                                                                                      gggtcggggggatcggtcggatccgggggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGgg                <  1:3470823/101‑1 (MQ=11)


                                                                                      gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgg                <  1:377566‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                                                                      ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                >  1:3641813/4‑101 (MQ=11)


                                                                                       ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgagggg               >  2:2202553/1‑96 (MQ=11)


                                                                                       ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcggg               >  2:1369106‑M2/1‑80 (MQ=255)


                                                                                       ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcggg               >  1:4712428‑M2/1‑80 (MQ=255)


                                                                                       gatccgtgggaacgggcggatcggtgggatcggtcggAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa               <  1:8059106/99‑1 (MQ=14)


                                                                                       gagccgtgggatcggtcggatccgtaggatcgggcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGa               <  2:5350304/98‑1 (MQ=11)


                                                                                        ggccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt              <  1:6722458/99‑1 (MQ=11)


                                                                                         gccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc             >  2:2824629‑M2/2‑95 (MQ=255)


                                                                                            gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt          <  2:1857566‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                                            gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGAccggc          >  1:6098659/1‑100 (MQ=14)


                                                                                             tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtc         >  2:3247586‑M2/1‑91 (MQ=255)


                                                                                             tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtc         >  1:8653266‑M2/1‑91 (MQ=255)


                                                                                              gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCgggatcggtcg        <  1:915435‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                                                              gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg        >  1:4416835‑M2/1‑90 (MQ=255)


                                                                                               ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgg       >  2:4648437‑M2/1‑89 (MQ=255)


                                                                                                 gtcggtcgggtccgtgggatccggcggGTCCGTGGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt     <  1:8466406/100‑1 (MQ=11)


                                                                                                 gtcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt     <  2:2325711/100‑1 (MQ=11)


                                                                                                 atcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggat     <  2:1016548‑M2/101‑15 (MQ=255)


                                                                                                  tcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc    <  1:7841110/101‑1 (MQ=11)


                                                                                                  gcggtcggctccgtcggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc    <  2:3615707/100‑1 (MQ=11)


                                                                                                  gcgggcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc    <  1:5928722/100‑1 (MQ=11)


                                                                                                   cggtcggatgcgtgggatcggtcggATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc   >  1:8188819‑M2/1‑85 (MQ=255)


CCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCG  >  NC_014034/221879‑222079

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 17 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 32 ≤


ATCG

< 41 ≤


ATCG