BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,997	G→C	13.0%	T220T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	221,997	0	G→C	13.0%	0.0 ‑3.1 0.0	1816	T220T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (108/135): ref base (808/765): total (916/900)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.58e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 4043 total aligned reads displayed.


TGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221897‑222097


ccgtgggatcggtcgtgtccgtgggatcggccgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                                      >  2:5330570‑M1/60‑101 (MQ=255)


ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgcgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                                      <  2:261793‑M1/42‑1 (MQ=255)


  gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                                                                                                    <  1:5224219‑M1/44‑1 (MQ=255)


   gcAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                                   <  2:2804174/100‑1 (MQ=255)


         cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATcc                                                                                             <  2:832998‑M1/51‑1 (MQ=255)


          ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCg                                                                                            <  1:78337‑M1/52‑1 (MQ=255)


                gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGgac                                                                                      <  1:1138735‑M1/58‑2 (MQ=255)


                  ggcgcTCATCGACGGTGAGCGTCGGATGCGGGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                    <  1:8647921/100‑1 (MQ=255)


                    gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGgatcgag                                                                                  <  1:1310408‑M1/62‑3 (MQ=255)


                    gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                  <  1:7672825‑M1/62‑1 (MQ=255)


                     gcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                 <  1:4591481/101‑1 (MQ=255)


                      gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                <  1:5025325‑M1/64‑1 (MQ=255)


                       ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                               >  2:2443150‑M1/37‑101 (MQ=255)


                          tcggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                            >  1:5554834‑M1/34‑101 (MQ=255)


                                cgatccgtggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                      >  2:7672498‑M1/28‑101 (MQ=255)


                                  gtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                    >  2:6190392‑M1/26‑101 (MQ=255)


                                   tccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                   >  2:1515169‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                   tccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                   <  2:3862880‑M1/77‑1 (MQ=255)


                                    ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                  >  1:8186910‑M1/24‑101 (MQ=255)


                                    ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                  >  1:7286377‑M1/24‑101 (MQ=255)


                                     cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                 >  1:1774574‑M1/23‑101 (MQ=255)


                                           atcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGggtcgggcggct                                                           <  2:1668628‑M1/85‑3 (MQ=255)


                                           aTGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                           >  1:8328160/1‑101 (MQ=255)


                                            tGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                          <  1:6864874/101‑1 (MQ=255)


                                            gtcGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGGGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTc                                                          <  1:4116648/99‑1 (MQ=2)


                                             cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                         <  1:1459990‑M1/87‑1 (MQ=255)


                                              ggtgccagcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                        <  1:2826597/93‑1 (MQ=255)


                                              ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                        <  2:6836905‑M1/88‑1 (MQ=255)


                                                  gggtcgggcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg                                                    <  1:1000386/98‑1 (MQ=11)


                                                  ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                    >  2:7272727/10‑101 (MQ=11)


                                                   gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                   <  2:4506346/93‑1 (MQ=11)


                                                    gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                  >  2:5630284‑M1/8‑101 (MQ=255)


                                                    gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCgtggggg                                                  <  2:7854561‑M1/94‑3 (MQ=255)


                                                     tccctggcggcggtcggcgtcgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc                                                 <  2:33504/91‑1 (MQ=14)


                                                      ccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                <  1:4437678/93‑1 (MQ=11)


                                                      ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATccgtggggtcc                                                >  1:6707730‑M1/6‑97 (MQ=255)


                                                         tgtgatcggtggggtgcgttggttgggtcgggtccgtggGCTCGATCGGACCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                             <  2:6381878/98‑1 (MQ=11)


                                                         tggggtcggtcgggtgcgtggggtccgtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                             <  1:5676870/96‑1 (MQ=11)


                                                         tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTgggggccgtc                                             >  1:33504/3‑94 (MQ=11)


                                                         tgggatcggtcggctccgtcggatcgggcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                             <  2:1179655/99‑1 (MQ=11)


                                                         tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAccggtc                                             >  1:3693544/3‑101 (MQ=11)


                                                           ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtggg                                           >  1:6256852‑M2/1‑90 (MQ=255)


                                                           ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtggg                                           <  1:6074630‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                           ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGACGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTGCGTGGAATCGGTCGGGGCCCAGGGGtcggtcgg                                           >  2:2295583/1‑101 (MQ=11)


                                                           ggatcggggggatccggggggtgggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                           <  1:3057607/101‑1 (MQ=11)


                                                            ggtcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTTGGATCGGCCGGATCCGTGGGAtcggtcgga                                          <  2:4170094/99‑2 (MQ=11)


                                                            ggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTGGGGTCCGGTGGATCGGTCggg                                          >  2:5170382/6‑101 (MQ=11)


                                                            gatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtacggcggg                                          >  2:8485001/1‑93 (MQ=11)


                                                               cgggcggcttcgggggatcggtcggttccgcgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                       <  1:2295650/101‑1 (MQ=11)


                                                               aggtgttatccgtgggatcgggcgggtcagtgggatcggtcagATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                       <  1:3198459/93‑1 (MQ=14)


                                                                ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGCGGGGTCGGTCGGATCCg                                      >  2:4357464/1‑101 (MQ=14)


                                                                  tcgggtccgtgggatccgtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                    >  2:2017212‑M2/1‑100 (MQ=255)


                                                                   cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGGgccgtcggagccgggg                                   >  2:6965973/1‑93 (MQ=11)


                                                                   cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCCTgg                                   <  2:8188697‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                                                   cgggtccggggggtcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                   <  1:4291193/101‑3 (MQ=14)


                                                                   cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                   <  1:3983211‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                                                   cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                                   >  1:245908/1‑99 (MQ=11)


                                                                    gggtccttgggagcggtcgggtgcgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtggc                                  <  2:6533018/101‑4 (MQ=14)


                                                                    gggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                  >  1:4859611/1‑101 (MQ=11)


                                                                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                  >  2:1010105‑M2/1‑98 (MQ=255)


                                                                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                  <  2:866299/101‑1 (MQ=11)


                                                                    gggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                  >  1:8054229‑M2/1‑98 (MQ=255)


                                                                    ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                  >  1:1618735‑M2/1‑98 (MQ=255)


                                                                     ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCggggga                                 >  1:7503841/1‑96 (MQ=14)


                                                                     ggtccatgggatcggtcgggtccgtggggtacgtcgGATCCGTGGGTTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGAAGGATCCGGCGGATCGGCAGGGACCGTGggt                                 >  2:581747/1‑100 (MQ=2)


                                                                      gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                <  2:5974267‑M2/101‑6 (MQ=255)


                                                                      agccgggggatcggcggggccaggaggatcggtcggGTGCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                <  2:9009919/99‑1 (MQ=2)


                                                                       tccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                               <  1:9143757‑M2/101‑7 (MQ=255)


                                                                       tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                               >  1:7146842‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                                                        ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                              >  2:4023190‑M2/1‑94 (MQ=255)


                                                                         cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCGGTGGGGtcgg                             >  1:6567042/1‑101 (MQ=11)


                                                                          gtgggttcggtcgggtccgtgggttccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                            <  2:7121178/101‑1 (MQ=11)


                                                                          gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGAGCCGTGGGagggac                            >  2:352794/1‑96 (MQ=11)


                                                                          gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGACGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCTGGGGGATCGGTCGGGATCGTGGGAtcggt                            >  2:3181394/1‑101 (MQ=14)


                                                                           tgggctcgggggggtccgtgggatcggtgggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                           <  1:7011733/101‑1 (MQ=11)


                                                                           tgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc                           <  1:8801261‑M2/101‑11 (MQ=255)


                                                                            ggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggccg                          >  1:589534/1‑101 (MQ=11)


                                                                            gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgggcg                          >  2:181531/1‑101 (MQ=11)


                                                                            gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                          <  2:8809831‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                                              gatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggg                        <  1:4739689‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                                                               gtcggtcgggtccgtggggtgcgtcggATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt                       <  1:3539599/100‑1 (MQ=11)


                                                                               gtcggtcgggtccgtgggatccggcggGTCCGTGGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt                       <  1:8466406/100‑1 (MQ=11)


                                                                                 ctgtcggatccgtgggatcggtcggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                     >  2:467515‑M2/3‑85 (MQ=255)


                                                                                      gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg                <  1:898536‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                                                      gggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGTCGgtcgggtcgggggg                >  2:6677953/1‑95 (MQ=11)


                                                                                      gggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGCGGCCGTGGGATCGgtcggggccgtggg                >  2:1331638/1‑101 (MQ=11)


                                                                                       ggtgcgtgggatgggctggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCgtcggatccgtggga               <  2:3688440/101‑2 (MQ=11)


                                                                                        gtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt              >  1:1960709‑M2/1‑61 (MQ=255)


                                                                                         tccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc             <  2:4773077‑M2/101‑42 (MQ=255)


                                                                                          ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcg            >  1:2624905/1‑100 (MQ=255)


                                                                                          ccgggggaccgggcggGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtcc            <  1:6420552/101‑1 (MQ=11)


                                                                                           cgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGCCCGTCGGATCGggcggatccgtggggtcgg           >  1:382839/1‑99 (MQ=11)


                                                                                              gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgggggatcggtcg        <  2:804914‑M2/101‑30 (MQ=255)


                                                                                              aggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTgg        >  1:2139080/2‑101 (MQ=14)


                                                                                               ggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTggg       >  2:4911734/1‑101 (MQ=14)


                                                                                                 atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGGTCCGTGGGAt     >  2:5492668/1‑101 (MQ=14)


                                                                                                 atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt     >  2:30514/1‑101 (MQ=14)


                                                                                                  tcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatc    >  2:7483250‑M2/1‑51 (MQ=255)


                                                                                                   tggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc   >  1:5389757‑M2/2‑67 (MQ=255)


                                                                                                    ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcgg  <  2:2148843‑M2/101‑53 (MQ=255)


TGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221897‑222097

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 41 ≤


ATCG