| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 2,304,900 | 2 bp→CA | 100% | coding (2674‑2675/2808 nt) | RCAP_rcc02139 ← | methyl‑accepting chemotaxis protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 2,304,900 | 0 | A→C | 100.0% | 1050.0 | 299 | V892G (GTA→GGA) | RCAP_rcc02139 | methyl‑accepting chemotaxis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (126/173): ref base (0/0): total (126/173) | ||||||||||
| * | NC_014034 | 2,304,901 | 0 | C→A | 100.0% | 1040.0 | 298 | V892L (GTA→TTA) | RCAP_rcc02139 | methyl‑accepting chemotaxis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (123/173): ref base (2/0): total (125/173) | ||||||||||
Only 100 of 305 total aligned reads displayed.
TAATCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCGCCCTGCATGC.GAAGACCG.CGTACGCTCCCGCA.GGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTG > NC_014034/2304810‑2304988
||
aTCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.g > 2:3582342/1‑101 (MQ=255)
aTCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.g > 2:2190018/1‑101 (MQ=255)
tCTTGCGCAAAACCGGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.gg < 2:4716069/101‑1 (MQ=255)
ttGCGCAAACCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.gggt < 2:5456861/101‑3 (MQ=255)
ttGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.gggt < 2:8776881/101‑3 (MQ=255)
tGCGCAAACCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.gggtc < 1:1672725/101‑4 (MQ=255)
gcgcAAACCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGCCCGCCGTCAGCTCCCGCA.gggtct < 2:6101454/101‑5 (MQ=255)
gcAAAACGCGGCCGGACCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTgc < 2:6708216/101‑1 (MQ=255)
caaaccggggCCGGATCCGGCCGGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTgcg < 2:7211964/93‑1 (MQ=255)
aaaaCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTgcgc > 2:3779363/1‑101 (MQ=255)
aaccTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGcc < 2:1509453/98‑1 (MQ=255)
aaaCTCGGCCGGATCCGGACTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGcc < 1:102150/101‑1 (MQ=255)
aaCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGccc > 2:8888005/1‑100 (MQ=255)
aaCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCt > 1:8216672/1‑101 (MQ=255)
ccccGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTc < 1:8425290/98‑1 (MQ=255)
cgcGGCCGGATCCGGCCTGCCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCg < 1:1878866/99‑1 (MQ=255)
cTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCg > 1:2810565/1‑101 (MQ=255)
cGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGcc > 2:1686357/1‑101 (MQ=255)
ggCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCCGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGccc > 1:5874127/1‑101 (MQ=255)
ggCCGGACCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGccc < 1:2257703/101‑1 (MQ=255)
gcccgtctCCGGCCGGACAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGccc < 2:5666626/94‑1 (MQ=255)
cccGGAGCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCca < 2:8965645/100‑1 (MQ=255)
ccGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcag > 2:1208074/1‑101 (MQ=255)
ccGAATCGGGCCTGGCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcag < 1:3856089/101‑1 (MQ=255)
cGGACCCGGCCGGTCGGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagc < 2:8070533/101‑1 (MQ=255)
ggATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagca > 1:1475166/1‑101 (MQ=255)
ggATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagca > 2:7942336/1‑101 (MQ=255)
ggACCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagca < 2:3028140/101‑1 (MQ=255)
gccccGGCCTGCCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagcag < 2:5153422/98‑1 (MQ=255)
gATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagcag < 2:2852301/101‑1 (MQ=255)
gATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagcag > 1:1719535/1‑101 (MQ=255)
gATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagcag > 1:7032418/1‑101 (MQ=255)
gATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagcac > 2:3304048/1‑100 (MQ=255)
aTCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCagcagc > 1:4557939/1‑101 (MQ=255)
aTCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCagcagc > 1:5194524/1‑101 (MQ=255)
cGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAACACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGcc > 1:6405331/1‑101 (MQ=255)
cTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGGCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCg > 1:8960226/1‑101 (MQ=255)
gccAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTc < 2:268672/99‑1 (MQ=255)
gccAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTc < 1:9043996/99‑1 (MQ=255)
gTCGGCCGCCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTc < 2:4005765/101‑1 (MQ=255)
gTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTc < 2:4456656/101‑1 (MQ=255)
gTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTc > 1:992621/1‑101 (MQ=255)
gTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTCGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTc < 1:6259580/101‑1 (MQ=255)
tCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcg < 1:8626392/101‑1 (MQ=255)
cAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcgc < 1:3726351/101‑1 (MQ=255)
cgCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcgcg < 1:752600/100‑1 (MQ=255)
aGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcgcg > 2:6657045/1‑101 (MQ=255)
cGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGcc < 1:1979054/101‑1 (MQ=255)
tGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCCGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGtt > 2:5234089/1‑101 (MQ=255)
gCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGttt > 2:6435838/1‑101 (MQ=255)
gCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGttt < 2:4927590/101‑1 (MQ=255)
gCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGttt < 2:1177732/101‑1 (MQ=255)
ccGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGtttt < 1:2190080/101‑1 (MQ=255)
ccGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGtttt < 1:7598629/101‑1 (MQ=255)
cGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTc < 1:77916/101‑1 (MQ=255)
cAACGGCGGCTCTGGTGGCG.CCTGCATGCGGAGGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCt < 2:5310792/101‑1 (MQ=255)
aaCGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTTCTc > 2:2752897/1‑101 (MQ=255)
aaCGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTc < 1:7468476/101‑1 (MQ=255)
aaCGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTc < 1:5275102/101‑1 (MQ=255)
aCGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCg < 1:7194114/101‑1 (MQ=255)
aCGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCg < 1:668491/101‑1 (MQ=255)
cggcggCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGa < 1:5542778/101‑1 (MQ=255)
cgccggcgCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGa < 2:7481938/98‑1 (MQ=255)
gcggcgCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAAc > 2:7875761/1‑101 (MQ=37)
cggcgCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACa < 1:788204/101‑1 (MQ=255)
cggcgCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGGTTTCCTCGAACa > 2:1906236/1‑101 (MQ=255)
ggcgCCGGTGGCG.TCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACAt < 2:1414322/101‑1 (MQ=255)
ggcgCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACAt < 2:6810175/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATc < 1:4989752/101‑1 (MQ=25)
gcgcCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATc < 2:7650710/101‑1 (MQ=25)
gcgcCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATc < 1:8871823/101‑1 (MQ=25)
gcCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgc > 2:4611261/1‑101 (MQ=25)
gcCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgc < 2:9162087/101‑1 (MQ=25)
cGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgccg > 2:2345715/1‑101 (MQ=25)
cGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgccg < 1:9182733/101‑1 (MQ=25)
cGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgccg < 1:297571/101‑1 (MQ=25)
ggTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgccgc < 2:7035618/101‑1 (MQ=25)
gTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCa > 2:2487055/1‑101 (MQ=25)
gTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCa < 1:2661472/101‑1 (MQ=25)
gTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCa > 2:3186010/1‑101 (MQ=25)
gTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCa > 1:1530634/1‑101 (MQ=25)
ggcgccTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCAtt < 1:8053462/97‑1 (MQ=25)
gcgccTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATtg < 1:8058402/98‑1 (MQ=25)
cgccTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATtgt < 1:1608924/99‑1 (MQ=25)
gccTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATtgtg < 2:6571121/100‑1 (MQ=25)
gccTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATtgtg > 2:6334552/2‑101 (MQ=21)
ccTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGc > 2:8257427/1‑101 (MQ=21)
ccTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGc < 2:3481641/101‑1 (MQ=25)
ccTGCAGGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGGCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGc < 1:4263895/101‑1 (MQ=21)
cTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGGCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCt < 1:6173412/101‑1 (MQ=21)
gCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTgg > 1:5858251/1‑101 (MQ=21)
gCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTgg > 1:3517969/1‑101 (MQ=21)
gCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTgg < 2:5997250/101‑1 (MQ=25)
gCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTgg > 1:1128465/1‑101 (MQ=21)
tgcggAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTg < 1:3627793/97‑1 (MQ=25)
gcggAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGa < 2:5873892/98‑1 (MQ=21)
ggAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGAcc < 2:4189382/100‑1 (MQ=25)
gAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGTCGCATTGGGCTGGGTGACCt < 1:6647416/101‑1 (MQ=21)
gAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCt < 2:7808071/101‑1 (MQ=25)
aaGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTg > 2:5081286/1‑101 (MQ=21)
||
TAATCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCGCCCTGCATGC.GAAGACCG.CGTACGCTCCCGCA.GGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTG > NC_014034/2304810‑2304988
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|