Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 2,123,403 | Δ1 bp | 97.2% | coding (769/1077 nt) | wza ← | polysaccharide export protein Wza |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 2,123,403 | 0 | A→. | 97.2% | 20.9 ‑1.3 ‑1.6 | 253 | coding (769/1077 nt) | wza | polysaccharide export protein Wza |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (128/118): ref base (2/5): total (130/123) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.70e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.66e-02 |
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
ACGAAGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGAAGGGCTTGAC.ATTTGGGCCAACAA.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGTTGTTGGCGC > NC_014034/2123303‑2123498
|
aCGAAGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGa > 2:2350482/1‑101 (MQ=255)
aCGAAGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGa < 1:2212744/101‑1 (MQ=255)
gAAGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGagg > 1:5543535/1‑99 (MQ=255)
aaGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGAGgg < 1:1278921/101‑1 (MQ=255)
aGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGAGggc < 1:992159/101‑2 (MQ=255)
aTGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCtt < 2:353640/101‑1 (MQ=255)
aTGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCtt > 2:3013027/1‑101 (MQ=255)
aTGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCtt < 1:1753068/101‑1 (MQ=255)
aTGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCtt < 1:4276100/101‑1 (MQ=255)
gCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGa > 1:5199593/1‑101 (MQ=255)
gCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGa < 2:5160555/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAc > 2:3864445/1‑101 (MQ=255)
ccGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAc < 1:750901/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAc < 1:4564653/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAc > 1:3234663/1‑101 (MQ=255)
cgcgGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACTCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcg < 2:4586068/101‑2 (MQ=255)
cgcgGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcg < 1:2776037/101‑2 (MQ=255)
cgcgGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcg < 2:4078697/101‑2 (MQ=255)
gcgGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGGGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcga < 2:2847855/101‑3 (MQ=255)
ggCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatct < 1:2574247/101‑6 (MQ=255)
ggCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatct < 1:2326498/101‑6 (MQ=255)
ggCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatct < 1:229341/101‑6 (MQ=255)
gCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatctg < 2:5401778/101‑7 (MQ=255)
cATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatctgg < 1:3707927/101‑8 (MQ=255)
aTCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCGGGGTCAGGGTGATGTTTTCGAGAGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGAcgatctggc > 1:4944651/1‑93 (MQ=255)
gCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGcctc < 1:1493292/101‑1 (MQ=255)
ccAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGcctcc > 2:2522297/1‑101 (MQ=255)
ccAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGcctcc < 2:2914025/101‑1 (MQ=255)
ccAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGcctcc < 2:3691471/101‑1 (MQ=255)
cAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGcctcct < 1:3927477/101‑1 (MQ=255)
cAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGcctcct < 2:1561473/101‑1 (MQ=255)
cAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGcctcct < 2:2753136/101‑1 (MQ=255)
aGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTg < 1:1951160/101‑1 (MQ=255)
gACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGc < 2:4322441/101‑1 (MQ=255)
gccgccgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCa < 1:1649215/100‑1 (MQ=255)
aCCGCTGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGCTCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCa < 1:4897786/101‑1 (MQ=255)
aCCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCa < 1:1083238/101‑1 (MQ=255)
aCCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCa < 1:1022493/101‑1 (MQ=255)
cgccgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCAcc > 2:140954/1‑101 (MQ=255)
gccgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCg < 1:2927984/101‑1 (MQ=255)
gccgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCg > 2:4680500/1‑101 (MQ=255)
cgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTc > 2:3908595/1‑101 (MQ=255)
cgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTc > 1:4682626/1‑101 (MQ=255)
cgcgGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTgc < 1:4494895/101‑1 (MQ=255)
cgGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTgccg < 2:114024/101‑1 (MQ=255)
cgGGTGATCGCCTGGGGCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTgccg < 1:3464159/101‑1 (MQ=255)
gggTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTgccgc > 1:671155/1‑101 (MQ=255)
ggTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTgccgcc > 2:3273422/1‑101 (MQ=255)
ggTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTgccgcc < 1:312458/101‑1 (MQ=255)
ggTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTgccgcc < 2:2971730/101‑1 (MQ=255)
tGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCg > 1:1029573/1‑101 (MQ=255)
gATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGa < 2:5090268/101‑1 (MQ=255)
aTCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGAc < 1:2511879/101‑1 (MQ=255)
cGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGc > 2:1393240/1‑101 (MQ=255)
cGCCTGGGTCAGGGAGATGTTTTCCAGCGTCAGCTCGATCGTCG.AGGGCTTGAC.GATTGGGCCCAGAAGAACGGCCTCCTGTACCGGCTG.CGCCCGatcgc > 2:3806254/1‑97 (MQ=255)
ccTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTg < 2:1885617/101‑1 (MQ=255)
cTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTga > 1:515861/1‑101 (MQ=255)
tGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTgac < 1:3328851/101‑1 (MQ=255)
tGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTgac > 2:2591096/1‑101 (MQ=255)
gggTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTgacg > 2:1089816/1‑101 (MQ=255)
gggTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTgacg > 2:3191941/1‑101 (MQ=255)
tCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACa > 1:924952/1‑101 (MQ=255)
tCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACa > 1:3430941/1‑101 (MQ=255)
tCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACa > 1:620881/1‑101 (MQ=255)
tCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACa > 1:5621569/1‑101 (MQ=255)
cAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACAt > 1:5353952/1‑101 (MQ=255)
cAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACAt < 1:4556604/101‑1 (MQ=255)
aGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATc > 1:1599390/1‑101 (MQ=255)
aGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATc > 1:2468096/1‑101 (MQ=255)
gggTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCg < 1:1430891/101‑1 (MQ=255)
ggTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGc < 1:1878427/101‑1 (MQ=255)
gTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGcc > 1:5748159/1‑101 (MQ=255)
gTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGcc > 2:3299470/1‑101 (MQ=255)
gTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGcc < 2:671098/101‑1 (MQ=255)
gATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGt > 2:3984523/1‑101 (MQ=255)
gTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGtttt > 2:5235931/1‑101 (MQ=255)
ttttCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTg < 2:5747864/101‑1 (MQ=255)
tttCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCCCAGTCTGCCGCCCGAAGCTGACGACATCGCCGGTTTga > 2:1228052/1‑100 (MQ=255)
tttCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgc > 2:4171144/1‑101 (MQ=255)
ttCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgca > 2:2311080/1‑101 (MQ=255)
ttCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgca < 2:1041220/101‑1 (MQ=255)
ttCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGATTTgca > 2:5520196/1‑101 (MQ=255)
tCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgcag > 2:3609127/1‑101 (MQ=255)
ccAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGCCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgcagc < 2:4942012/101‑1 (MQ=255)
cAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgcagca > 1:522635/1‑101 (MQ=255)
cAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgcagca > 2:4454714/1‑101 (MQ=255)
gTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCgg > 2:4878064/1‑101 (MQ=255)
cAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgt < 2:2195540/101‑1 (MQ=255)
gatcgatcGTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgttg < 2:1797095/101‑1 (MQ=255)
atcgatcgTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgttgt > 1:404530/1‑101 (MQ=255)
cgatcgTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCGCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGttgttg > 1:2296023/1‑101 (MQ=255)
cgatcgTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGttgttg < 2:4096062/101‑1 (MQ=255)
cgatcgTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGttgttg > 2:5335903/1‑101 (MQ=255)
cgatcgTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGttgttg < 1:3449827/101‑1 (MQ=255)
cgatcgTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGttgttg > 2:2681059/1‑101 (MQ=255)
gatcgTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGTTGTTgg > 1:3584622/1‑101 (MQ=255)
gatcgTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACAGGgttgttag > 1:2862736/1‑99 (MQ=255)
atcgTCG.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGTTGTTGgc > 2:2019232/1‑101 (MQ=255)
tcgtcg.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGTTGTTGgcg < 2:725861/101‑1 (MQ=255)
cgtcg.AGGGCTTGACGATCTGGCCCAGCAG.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGGTGTTGgcgc > 2:4389456/1‑101 (MQ=255)
|
ACGAAGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGAAGGGCTTGAC.ATTTGGGCCAACAA.ATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGTTGTTGGCGC > NC_014034/2123303‑2123498
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 30 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|