Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,823,740 | +C | 100% | intergenic (+25/‑148) | RCAP_rcc01687 → / → RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,823,740 | 1 | .→C | 100.0% | 87.5 | 191 | intergenic (+25/‑148) | RCAP_rcc01687/RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (108/55): ref base (0/28): total (108/83) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.37e-12 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.98e-01 |
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
CTATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.C.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCCCG > NC_014034/1823640‑1823837
|
ctATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.a.a > 2:1384787/1‑101 (MQ=255)
tATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.c > 2:4788886/1‑101 (MQ=255)
gCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.c.c.cc < 2:2388593/101‑2 (MQ=255)
gCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.c.c.cc < 2:4630518/101‑2 (MQ=255)
gAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.c.c.ccgg < 1:1767085/101‑4 (MQ=255)
gAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.c.c.ccgg < 1:34206/101‑4 (MQ=255)
gAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.c.c.ccgg > 1:4208149/1‑98 (MQ=255)
aGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.c.c.ccggc < 2:2265635/101‑5 (MQ=255)
aaGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTgc < 1:1683964/101‑1 (MQ=255)
aGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTGGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGG.A.ACC.C.C.GGCTgcc > 1:1900821/1‑101 (MQ=255)
gggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTgccgcc > 1:1201357/1‑101 (MQ=255)
gggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTgccgcc > 1:4180810/1‑101 (MQ=255)
tGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTTTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGGGAAGGGGCC.GGGGGC.A.C.C.CGC.GGCTGCCGCCGGt < 2:3632919/101‑1 (MQ=255)
tGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGt > 1:3896654/1‑101 (MQ=255)
gggCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGtt < 1:2258892/101‑1 (MQ=255)
ggcggcGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTc < 1:2622791/101‑1 (MQ=255)
gcggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCg < 1:3060131/101‑1 (MQ=255)
cggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGc < 1:5748727/101‑1 (MQ=255)
gcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCg < 1:2054373/101‑1 (MQ=255)
cgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGTGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCgg < 2:821188/101‑1 (MQ=255)
cgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCgg < 1:2492291/101‑1 (MQ=255)
cgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCgg > 2:1733185/1‑101 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCggg > 2:2866406/1‑100 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGt < 1:5217829/101‑1 (MQ=255)
aTGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTc > 1:657972/1‑101 (MQ=255)
aTGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTc < 1:5153479/101‑1 (MQ=255)
tGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcg < 2:3189559/101‑1 (MQ=255)
tGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcg > 1:4261229/1‑101 (MQ=255)
gTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.CAC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGCcgg > 2:5162487/1‑101 (MQ=255)
tCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGCAA.A.C.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcggg > 1:2724098/1‑101 (MQ=255)
cAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggc > 1:4852547/1‑101 (MQ=255)
aTTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGggcgggcg < 1:1527022/101‑1 (MQ=255)
aTTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGggcgggcg > 2:1842626/1‑101 (MQ=255)
ttCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcg > 1:4021594/1‑101 (MQ=255)
cgccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcggg > 1:111674/1‑101 (MQ=255)
gccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcgggc > 1:53462/1‑101 (MQ=255)
gccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGGCGGgcgggcgcgggc > 1:4914595/1‑101 (MQ=255)
cgcgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCtt > 1:5583936/1‑101 (MQ=255)
cgcgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCtt < 1:1014338/101‑1 (MQ=255)
gcgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.C.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTc < 1:89656/101‑1 (MQ=255)
gcgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGGGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGACGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTc > 2:5252640/1‑101 (MQ=255)
aTCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCgg < 1:366544/101‑1 (MQ=255)
tCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCCGc > 1:2926097/1‑101 (MQ=255)
cAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGcc > 1:1309448/1‑101 (MQ=255)
cAAGCTGTGGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.C.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGcc < 2:2130929/101‑1 (MQ=255)
aaGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCg > 1:5531306/1‑101 (MQ=255)
aGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGc > 2:3689037/1‑101 (MQ=255)
gCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.C.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCt < 2:1084170/101‑1 (MQ=255)
cTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGGCGGTCGGGCGGGGGCGGGCTTCCGGCCGCTg > 2:4221594/1‑101 (MQ=255)
cTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTg > 1:3532695/1‑101 (MQ=255)
cTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTg < 2:3811765/101‑1 (MQ=255)
cTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTg < 1:2181404/101‑1 (MQ=255)
cTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTg < 2:5274824/101‑1 (MQ=255)
tGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGc > 1:5775223/1‑101 (MQ=255)
gTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGcc < 1:5274427/101‑1 (MQ=255)
gTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGcc < 1:1380626/101‑1 (MQ=255)
gAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAg > 2:1658147/1‑101 (MQ=255)
tttGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgc > 2:4509190/1‑101 (MQ=255)
tttGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgc < 1:445155/101‑1 (MQ=255)
tttGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgc > 1:3323550/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.C.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctc < 2:3509746/101‑1 (MQ=255)
tGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctc > 2:1409564/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctc > 1:3990587/1‑101 (MQ=255)
gccgccTCGTAACGGGCGGTGAGGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctcc < 2:2671344/101‑1 (MQ=255)
gccgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctcc > 2:1233035/1‑101 (MQ=255)
ccgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.C.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccc < 2:2166029/101‑1 (MQ=255)
ccgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccc > 1:2106718/1‑101 (MQ=255)
cgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccct < 2:4357018/101‑1 (MQ=255)
cgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGGCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctcccc > 2:4984782/1‑100 (MQ=255)
gccTCGTACCGGGGCGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.C.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctc < 1:4995857/101‑1 (MQ=255)
gccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctc < 2:3523590/101‑1 (MQ=255)
gccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctc > 1:3485473/1‑101 (MQ=255)
tCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgt > 2:557924/1‑101 (MQ=255)
cGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtc > 1:2402133/1‑101 (MQ=255)
cGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtc < 1:1549020/101‑1 (MQ=255)
gTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.C.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc < 1:4379781/101‑1 (MQ=255)
gTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTGCGGCCGCTGCCTTGCTGCTCCCtccggcc > 2:2207804/1‑101 (MQ=255)
taggcggCGGGGAACGGGCC.GGGGGA.A.A.C.C.CGGGCTACCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtccg < 1:5267956/96‑1 (MQ=255)
aaCGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcccc > 2:4884370/1‑99 (MQ=255)
aaCGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGa > 2:3057834/1‑101 (MQ=255)
aCGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.C.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAg < 2:5774928/101‑1 (MQ=255)
aCGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAg < 2:111654/101‑1 (MQ=255)
aCGGGCGGGAAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAg < 1:2866567/101‑1 (MQ=255)
cGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGt > 1:2005099/1‑101 (MQ=255)
cGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGt > 1:4531412/1‑101 (MQ=255)
cGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGt > 1:854624/1‑101 (MQ=255)
gggGGGGGAGGGGGCG.GGGGGC.ACC.C.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTg < 1:3922818/101‑1 (MQ=255)
gggCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTg < 1:2463093/101‑1 (MQ=255)
ggCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTgg > 2:4204345/1‑101 (MQ=255)
ggTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCgg > 1:4632255/1‑101 (MQ=255)
gTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTACCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCggg > 2:3406465/1‑100 (MQ=255)
gggaGGGGCCGGGGGGC.A.C.C.C.CGGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGt < 2:3990343/98‑1 (MQ=255)
gAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGc > 2:669496/1‑101 (MQ=255)
aaGGGGCC.GGGGGC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCg > 1:1449909/1‑101 (MQ=255)
cc.GGGGGC.ACC.C.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCt < 2:3018976/101‑1 (MQ=255)
cggggggC.A.C.C.C.CGGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCt < 2:4813750/99‑1 (MQ=255)
c.GGGGGC.ACC.C.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTg < 1:4793833/101‑1 (MQ=255)
ggggggC.A.CCC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTg < 1:3112422/100‑1 (MQ=255)
gggggC.A.ACC.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTgc > 2:2295912/1‑101 (MQ=255)
c.A.A.C.C.CGGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCCCg < 2:3261154/101‑1 (MQ=255)
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CTATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.C.C.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCCCG > NC_014034/1823640‑1823837
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
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