| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 3,269,820 | +C | 1.8% | coding (172/1287 nt) | RCAP_rcc03077 → | capsule polysaccharide modification protein family |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 3,269,820 | 1 | .→C | 1.8% | 4.4 0.0 ‑0.9 | 222 | coding (172/1287 nt) | RCAP_rcc03077 | capsule polysaccharide modification protein family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/2): ref base (108/110): total (110/112) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.26e-01 | ||||||||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CGCCATGCTGCGCGCCGCCGGGGCCGGGGTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGACACAAGGCCCGTTCATGCACA > NC_014034/3269720‑3269920
|
cccATGCTGCGCGCCGCCGGGGGCGGGGTCTGGCGGGTGGTCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATTCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.c < 2:5677195/100‑1 (MQ=255)
aTGCTGCGCGCCGCCGGGGCCGGGGTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.cccc < 1:4153306/101‑1 (MQ=255)
aTGCTGCGCGCCGCCGGGGCCGGGGTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.cccc < 1:4052922/101‑1 (MQ=255)
ctgcGCGCCGCCGGGGCCGGGGTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.ccccccc < 2:1678542/101‑1 (MQ=255)
ctgcGCGCCGCCGGGGCCGGGGTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.ccccccc > 1:2340075/1‑101 (MQ=255)
ctgcGCGCCGCCGGGGCCGGGGTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGCGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.ccccccc > 2:3126935/1‑101 (MQ=255)
cgcgcCGCCGGGGCCGGGGTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCcgc < 2:504415/101‑1 (MQ=255)
gccgccGGGGCCGGGGTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGa > 1:2645658/1‑101 (MQ=255)
gccgccGGGGCCGGGGTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGa < 1:1273297/101‑1 (MQ=255)
ccgccgGGGCCGGGGTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGAt < 1:1928251/101‑1 (MQ=255)
cgccgGGGCCGGGGTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGAtt > 2:3389576/1‑101 (MQ=255)
cgccgGGGCCGGGGTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGAtt < 1:4583317/101‑1 (MQ=255)
cgccgGGGCCGGGGTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGAtt < 2:5360790/101‑1 (MQ=255)
ggggccggggTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGgcc < 2:1453120/101‑1 (MQ=255)
ggccggggTCTGGCGGGTGGGATTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGgcccg > 2:1667892/1‑101 (MQ=255)
cggggTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGGTCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGgcccgccc > 2:4143121/1‑101 (MQ=255)
ggggTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGcccgcccg < 1:4090006/101‑1 (MQ=255)
ggggTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGcccgcccg > 1:594913/1‑101 (MQ=255)
ggggTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGcccgcccg < 1:3123860/101‑1 (MQ=255)
ggggTCGGGCGGGTGGGCTTCACCCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGcccgcccg < 2:4845480/101‑1 (MQ=255)
gggTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCgg > 1:2129938/1‑101 (MQ=255)
gTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGAt < 1:4409232/101‑1 (MQ=255)
gTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGAt < 2:5130487/101‑1 (MQ=255)
ctgcggggTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCg < 2:656384/96‑1 (MQ=255)
tGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGa < 1:4731385/101‑1 (MQ=255)
ggCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAg > 2:3264029/1‑101 (MQ=255)
ggCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAg > 1:2791072/1‑101 (MQ=255)
gCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAgg > 2:1216517/1‑101 (MQ=255)
cGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGgc > 1:980029/1‑101 (MQ=255)
cGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGgc > 1:1805718/1‑101 (MQ=255)
gggTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGgcg > 2:181533/1‑101 (MQ=255)
gggTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGgcg > 1:4284367/1‑101 (MQ=255)
gggTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGgcg < 1:3657599/101‑1 (MQ=255)
gggCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGa > 1:1008240/1‑101 (MQ=255)
gggCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGa < 2:1988141/101‑1 (MQ=255)
ggCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGAt > 1:4309203/1‑101 (MQ=255)
ggCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGAt > 1:5649630/1‑101 (MQ=255)
cacccGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCgggg < 2:2419412/98‑1 (MQ=255)
cAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCgggg < 1:3575689/101‑1 (MQ=255)
cAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCgggg < 1:4876673/101‑1 (MQ=255)
aaCCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGa < 2:1300294/101‑1 (MQ=255)
aaCCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGa < 1:2503088/101‑1 (MQ=255)
aaCCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGa < 1:3311585/101‑1 (MQ=255)
aaCCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGACCCCGCCACCTGCATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGa < 1:1455859/101‑1 (MQ=255)
aCCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGaa < 2:2339949/101‑1 (MQ=255)
aCCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGaa < 2:4292397/101‑1 (MQ=255)
gcggcgACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGaaaaa < 2:4280293/101‑1 (MQ=255)
cggcgACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAAt < 1:2393034/101‑1 (MQ=255)
ggcgACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATc < 1:3390337/101‑1 (MQ=255)
gcgACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG..CCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCg > 2:4600634/1‑101 (MQ=255)
gacgaGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGt < 1:2955161/101‑1 (MQ=255)
gacgaGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGt > 2:4914716/1‑101 (MQ=255)
cgaGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCACGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTcc > 2:4057636/1‑100 (MQ=255)
ggggTCTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACC.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCAc < 1:5711331/99‑1 (MQ=255)
aGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCAcc > 2:2088058/1‑101 (MQ=255)
tgtTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGAt < 1:911226/101‑1 (MQ=255)
gtTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGGTc > 2:2364394/1‑101 (MQ=255)
gtTCTCGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATc < 2:1112741/101‑1 (MQ=255)
ttCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAAACCGTCACCGATCt > 2:875879/1‑101 (MQ=255)
tttGGGCCGATCCCCCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTg < 2:2526808/99‑1 (MQ=255)
tCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTg < 2:612372/101‑1 (MQ=255)
tCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTg < 1:5376832/101‑1 (MQ=255)
ttGGGCGGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTgg < 2:476789/100‑1 (MQ=255)
cTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTgg < 1:3486553/101‑1 (MQ=255)
tGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTggg > 2:3604117/1‑100 (MQ=255)
tGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGt < 2:3430296/101‑1 (MQ=255)
tGGGCCAATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGt < 2:2750401/101‑1 (MQ=255)
ggCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTGACCGATCTGGTGc < 2:3468727/101‑1 (MQ=255)
gCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCCCCGATCTGGTGCt > 2:2909128/1‑101 (MQ=255)
cGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCttt < 2:3964216/101‑1 (MQ=255)
gATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTa > 1:3020160/1‑101 (MQ=255)
gtCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTTGCTCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTAc < 2:2822854/100‑1 (MQ=255)
aTCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTAc < 1:3889641/101‑1 (MQ=255)
aTCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTAc > 1:2740449/1‑101 (MQ=255)
aTCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTAc < 2:1927899/101‑1 (MQ=255)
aTCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGGGCTTTAc > 2:5531513/1‑101 (MQ=255)
cccGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACgg > 1:5577548/1‑101 (MQ=255)
cccGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCCCCCGGATCGAGGCGCCGATCGGGGAAAAAAACGTCACCGATCTGGTGCTTTAcag > 2:3001906/1‑99 (MQ=255)
ccGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGc < 2:4467647/101‑1 (MQ=255)
gCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTCCGGCGa > 1:1049425/1‑101 (MQ=255)
gCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGa > 1:2050082/1‑101 (MQ=255)
ccAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGac > 1:1207779/1‑101 (MQ=255)
cAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGaca < 2:4547983/101‑1 (MQ=255)
cAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGaca < 1:1757481/101‑1 (MQ=255)
cAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGaca > 2:2656370/1‑101 (MQ=255)
gCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGAcaca < 1:646231/101‑1 (MQ=255)
gCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGAcaca < 2:3059638/101‑1 (MQ=255)
cTACATCCGCTTTGACGCCCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGAcaca < 1:5169470/101‑1 (MQ=255)
cTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCAGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGACACaa > 1:2213079/1‑101 (MQ=255)
aCATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGGTCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTCGTGCGTTACGGCGACACAAgg > 2:5223175/1‑101 (MQ=255)
aCATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGACACAAgg > 1:762173/1‑101 (MQ=255)
cATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGACACAAGGc > 1:1651470/1‑101 (MQ=255)
ccGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGACACAAGGCCCg > 1:4631795/1‑101 (MQ=255)
cGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGACACAAGGCCCGt > 2:218463/1‑101 (MQ=255)
gCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGACACAAGGCCCGtt > 2:1157380/1‑101 (MQ=255)
gCTTTGACG..CCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGACACAAGGCCCGTTc > 2:3746294/1‑101 (MQ=255)
ttGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGACACAAGGCCCGTTCAt < 1:2033093/101‑1 (MQ=255)
ttGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGACACAAGGCCCGTTCAt < 1:5315815/101‑1 (MQ=255)
tGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGACACAAGGCCCGTTCATg > 2:465223/1‑101 (MQ=255)
g.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGACACAAGGCCCGTTCATGcaca < 1:4516920/101‑1 (MQ=255)
|
CGCCATGCTGCGCGCCGCCGGGGCCGGGGTCTGGCGGGTGGGCTTCAACCGCGGCGACGAGGTGTTCTGGGCCGATCCCGCCAGCTACATCCGCTTTGACG.CCCCCCCCGCGGATTGGCCCGCCCGGATCGAGGCGCTGATCGGGGAAAAATCCGTCACCGATCTGGTGCTTTACGGCGACACAAGGCCCGTTCATGCACA > NC_014034/3269720‑3269920
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 25 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|