| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 925,909 | +C | 100% | intergenic (+162/+12) | RCAP_rcc00838 → / ← glcB | DnaJ domain‑containing protein/malate synthase |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 925,909 | 1 | .→C | 100.0% | 43.7 | 233 | intergenic (+162/+12) | RCAP_rcc00838/glcB | DnaJ domain‑containing protein/malate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (133/83): ref base (9/8): total (142/91) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.07e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.33e-03 | ||||||||||
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
ACCCCCCGGGATATTTGGGGCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CG.C.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTGGATCCGGGCGAGGAA > NC_014034/925809‑926004
|
aCCCCCCGGGATATTTGGGGCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAg..cg > 1:3567560/1‑101 (MQ=255)
cccccGGGATATTTGGGGCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CG.c.c > 1:403856/1‑101 (MQ=255)
ccccGGGATATTTGGGGCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CG.c.cc < 1:1404321/101‑1 (MQ=255)
cccGGGATATTTGGGGCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CG.c.ccc < 1:587267/101‑1 (MQ=255)
cccGGGATATTTGGGGCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CG.c.ccc > 1:2274651/1‑101 (MQ=255)
ccGGGATATTTGGGGCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CG.c.ccc.c < 2:4631152/101‑1 (MQ=255)
gggATATTTGGGGCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CG.g.ccc.ccc > 2:331830/1‑101 (MQ=255)
gATATTTGGGGCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CG.c.ccc.cccct > 2:2786140/1‑99 (MQ=255)
atatTTGGGGCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CG.C.CCC.CCCctt < 2:3361043/101‑1 (MQ=255)
tttttGTGGCAGGGTAAAAGCATGCCGCTCTCCCCTTTCCTCTTCCCCCCAG.TTCCCCGGGGGGAGACCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CG.C.CCC.CCCcttt < 1:4809857/99‑2 (MQ=9)
atTTGGGGCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CG.C.CCC.CCCctttc < 1:5248837/101‑3 (MQ=255)
atTTGGGGCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CG.C.CCC.CCCctttc > 1:514079/1‑99 (MQ=255)
tttGGGGCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCt > 1:901279/1‑101 (MQ=255)
ttGGGGCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCtt < 1:2394023/101‑1 (MQ=255)
ttGGGGCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCtt > 1:2677237/1‑101 (MQ=255)
tGGGGCAGGGTTAAAGCAGTCCTTTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.GTTCCCGGGGGGAGTCCTCTTGCGGACGGGGGGCAG..CT.CTCCC.CCCTTTCTTa < 1:989669/101‑1 (MQ=18)
ggggCAGGGGAAGAGCGGGCCGCTTTCCCCTTTCCCTTTCCCCCAAACTCCCCGGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTa < 2:1078416/101‑1 (MQ=2)
ggggCAAGGTGAAACCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTAt < 2:1211302/101‑1 (MQ=255)
gggCAAGGTGAAAGCAGTCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATg < 2:3810298/101‑1 (MQ=255)
gggCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTGTCTTATg > 1:5404112/1‑101 (MQ=255)
cAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCtt < 1:4714430/101‑1 (MQ=255)
cAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCtt < 2:3614236/101‑1 (MQ=255)
cAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCtt > 2:3443901/1‑101 (MQ=255)
aaGGTGAAAGCAGGCCTCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCttt < 1:718388/101‑1 (MQ=255)
aaGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCttt < 1:3746414/101‑1 (MQ=255)
aGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTg > 2:2473907/1‑101 (MQ=255)
aGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTg < 1:5527465/101‑1 (MQ=255)
ggTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTgg > 2:292215/1‑101 (MQ=255)
gttaaaGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTggc < 2:4349971/98‑1 (MQ=255)
tGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTggcg > 2:2169675/1‑101 (MQ=255)
gAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTggcgg > 1:1529917/1‑101 (MQ=255)
aaaGCAGCCCGCTTTCCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTggcggc < 2:1452829/101‑1 (MQ=18)
aGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCt > 2:2247949/1‑101 (MQ=255)
gCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCtt < 1:2794342/101‑1 (MQ=255)
gCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCtt < 2:1262888/101‑1 (MQ=255)
cAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGTAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTc < 1:1767235/101‑1 (MQ=255)
cAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTc > 2:270266/1‑101 (MQ=255)
aGGCCGGTTTGCCCTTTCATCTTGCCCGAAA.TATCCGGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCa < 2:4837068/101‑1 (MQ=21)
aGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCa > 1:1214183/1‑101 (MQ=255)
aGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCa > 2:5168347/1‑101 (MQ=255)
cGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTg > 2:3725217/1‑101 (MQ=255)
cGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCAAAA.TCTCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTg < 2:2666971/101‑1 (MQ=21)
gCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTgc > 2:3971853/1‑101 (MQ=255)
gCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTgc > 2:4215203/1‑101 (MQ=255)
gCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTgc > 2:576712/1‑101 (MQ=255)
gCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTgc < 2:5287920/101‑1 (MQ=255)
cTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTgcg > 1:5565989/1‑101 (MQ=255)
tttGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTgcgc > 2:5251802/1‑101 (MQ=255)
tttGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTgcgc > 2:79841/1‑101 (MQ=255)
tttGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTgcgc > 1:1952258/1‑101 (MQ=255)
ttGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGcc > 1:5230984/1‑101 (MQ=255)
ttGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGcc > 1:1629199/1‑101 (MQ=255)
tGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGccc < 2:2852467/101‑1 (MQ=255)
tGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGccc < 2:5497671/101‑1 (MQ=255)
gCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCg > 1:5698610/1‑101 (MQ=255)
gCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCg < 1:3708896/101‑1 (MQ=255)
gCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCg > 1:2700680/1‑101 (MQ=255)
cccTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCgg < 1:3959012/101‑1 (MQ=255)
cTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCCG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCCGCGCCCTgcg > 2:5323513/1‑101 (MQ=18)
ttCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCt < 1:285450/101‑1 (MQ=255)
ttCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCt > 2:2328085/1‑101 (MQ=255)
aTCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGt > 1:2177060/1‑101 (MQ=255)
tCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTg > 1:3483150/1‑101 (MQ=255)
ccccAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGAGCTGGTgcagca > 2:3069193/1‑101 (MQ=255)
ccAAA.TGCCCCGGGGGGGCCCCCCTTGGGGGGGGGGGGCCGCCCC.C.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCAc < 1:948416/101‑1 (MQ=255)
cAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCg > 1:4594634/1‑101 (MQ=255)
cAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCg > 1:3016348/1‑101 (MQ=255)
aa.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGc > 2:2039807/1‑101 (MQ=255)
aa.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGc > 2:5465636/1‑101 (MQ=255)
a.tatCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCt > 1:3041683/1‑101 (MQ=255)
tggccggggggaAGCCCGCTCGCGACGGGGGGGCAG..CG.C.CCCGCCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTc < 2:1899946/95‑1 (MQ=255)
tatCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTc > 1:430556/1‑101 (MQ=255)
tatCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTc < 1:2840598/101‑1 (MQ=255)
tatCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTc > 1:5308545/1‑101 (MQ=255)
ccGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGGGCAGCACCGGCTCGGtt > 1:2358804/1‑100 (MQ=255)
ggggggAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGgata > 2:4466671/1‑101 (MQ=255)
ggggggAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGgata > 2:3116130/1‑101 (MQ=255)
gggAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGcc < 1:3658506/101‑1 (MQ=255)
gAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGGATAGctcc > 2:4880381/1‑98 (MQ=37)
gTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCTCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGGATAGCCCGAg > 1:4519089/1‑101 (MQ=37)
tCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAgg < 1:2071533/101‑1 (MQ=255)
cTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCTCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGTTCGGTCTACGCCCAGGTCTg > 1:549659/1‑101 (MQ=25)
cTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTg > 1:3912379/1‑101 (MQ=255)
cTTGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCATTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTg > 2:3900664/1‑101 (MQ=255)
ttGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTgg < 2:3567343/101‑1 (MQ=255)
ttGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTgg > 1:5411269/1‑101 (MQ=255)
tGCGGACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTGGa < 2:5023605/101‑1 (MQ=255)
ggACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCTGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTGGATcc > 1:4988016/1‑101 (MQ=255)
ggACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTGGATcc < 1:1105620/101‑1 (MQ=255)
ggACGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTGGATcc < 1:3104798/101‑1 (MQ=255)
aCGGGGGGCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTGGATCCgg > 2:1781081/1‑101 (MQ=255)
ggggggCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTGGATCCGGGc > 1:4349319/1‑101 (MQ=255)
gggggCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTGTAGCCCGAGGGCAGGGTACGGGCg > 2:638724/1‑101 (MQ=255)
ggggCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTGGATCCGGGCGa > 1:2444169/1‑101 (MQ=255)
gggCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTGGGTCCGGGCggg > 2:5597573/1‑99 (MQ=255)
gggCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTGGATCCGGGCGAg < 1:3356497/101‑1 (MQ=255)
gggCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTGGATCCGGGCGAg < 1:38506/101‑1 (MQ=255)
ggCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTGGATCCGGGCGAgg < 1:1859059/101‑1 (MQ=255)
ggCAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTGGATCCGGGCGAgg > 2:5628948/1‑101 (MQ=255)
cAG..CGCC.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTGGATCCGGGCGAGGaa < 2:403812/101‑1 (MQ=255)
|
ACCCCCCGGGATATTTGGGGCAAGGTGAAAGCAGGCCGCTTTGCCCTTTCATCTTGCCCCAAA.TATCCCGGGGGGAGTCCGCTTGCGGACGGGGGGCAG..CG.C.CCC.CCCTTTCTTATGCTTTGGCGGCCTTCACCTGCGCCCGGCGCTGGTGCAGCACCGGCTCGGTATAGCCCGAGGACTGGATCCGGGCGAGGAA > NC_014034/925809‑926004
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 25 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|