| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,395,430 | A→C | 3.9% | intergenic (+242/‑689) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,395,430 | 0 | A→C | 3.9% | 20.6 0.0 ‑0.2 | 317 | intergenic (+242/‑689) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (7/6): ref base (161/143): total (168/149) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.52e-01 | ||||||||||
Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
TTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAA > NC_014034/1395330‑1395530
|
tttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCa < 2:1548368/101‑1 (MQ=255)
ttcccccGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAg < 1:919080/96‑1 (MQ=255)
tACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATGGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCCGGGATGGGGG.AGCAGc > 1:2649580/1‑101 (MQ=37)
tACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGc > 2:2206604/1‑101 (MQ=255)
cacCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGGG.ATCAGCgg > 2:4154398/1‑101 (MQ=255)
cacCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCCGCCGGTGATCGGGG.ATCAGCgg > 2:324518/1‑101 (MQ=255)
cacCGTCTGGGCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCgg < 1:1410520/101‑1 (MQ=255)
cccGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGt < 2:44820/100‑1 (MQ=255)
cccGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGt < 1:728761/100‑1 (MQ=255)
ccGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.GTCAGCGGTc > 2:5624150/1‑101 (MQ=255)
ccGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTc < 1:5622837/101‑1 (MQ=255)
ccGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCCGCCCGAGATCGGAG.ATCAGCggcc > 1:2099194/1‑99 (MQ=37)
gTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGc > 1:2860909/1‑101 (MQ=255)
tCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCt < 1:191551/101‑1 (MQ=255)
tCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCt < 1:525702/101‑1 (MQ=255)
cTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTc > 2:1646437/1‑101 (MQ=255)
tGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcc < 2:2223670/101‑1 (MQ=255)
gTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcccc > 2:2385594/1‑101 (MQ=255)
tCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTccccc < 2:3999117/101‑1 (MQ=255)
cAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcccccc < 2:1587189/101‑1 (MQ=255)
cAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcccccc > 1:4827706/1‑101 (MQ=255)
ggTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCggg < 2:2117957/101‑1 (MQ=255)
gAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCggg > 2:3797330/1‑99 (MQ=255)
gAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg > 2:5295402/1‑101 (MQ=255)
gAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg > 1:4045629/1‑101 (MQ=255)
aaaCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg < 2:4841831/101‑1 (MQ=255)
aaaCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg > 2:690492/1‑101 (MQ=255)
caacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 2:1085336/8‑101 (MQ=2)
aaCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa > 1:3397763/1‑101 (MQ=255)
aCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:5479570/101‑1 (MQ=255)
cGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:3087366/101‑1 (MQ=255)
cGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:4755998/101‑1 (MQ=255)
ggCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:4189522/101‑1 (MQ=255)
ggCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 2:5053647/101‑1 (MQ=255)
ggCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:3512452/101‑1 (MQ=255)
cactgTCGCTCCCCCCGTGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 2:5191803/97‑1 (MQ=2)
cactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa > 2:5142289/5‑101 (MQ=2)
actgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 1:5662747/4‑101 (MQ=2)
ctgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc > 1:2549814/3‑101 (MQ=2)
cAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCNGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGTTCGaa > 1:618298/1‑101 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt < 1:1257258/101‑1 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAAAt > 1:4125977/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATc > 2:4373063/1‑101 (MQ=255)
ccaccccccGGGAGGGCGTGGATCGAAACCGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCACCCCCCGCGGGGGGGTGGATCGAATCagc < 2:558357/98‑3 (MQ=37)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcg > 1:2944526/1‑101 (MQ=255)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgc > 1:2303432/1‑101 (MQ=255)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgc > 2:2819924/1‑101 (MQ=255)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATccc > 1:1695426/1‑99 (MQ=255)
cccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgc < 2:3476466/100‑1 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgcc > 2:2561932/1‑101 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgcc > 1:431151/1‑101 (MQ=255)
cccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgccg > 1:1458350/1‑101 (MQ=255)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgccgc > 2:2901641/1‑101 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTg < 2:1335725/101‑1 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCgg > 2:3384338/1‑101 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCgg > 1:861833/1‑101 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCgg > 1:4556070/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGt < 1:3052244/101‑1 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTc > 1:1307082/1‑101 (MQ=255)
cgcgcagcGAGACTGCACCGGCTGGCCCTGCCGGTGAACGGTT.ATCAGCGGTCCCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAATCATCGCCGCTTTGGAGATCg < 2:266407/94‑1 (MQ=25)
cGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCg < 1:3938075/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCg > 2:2737899/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc < 2:5371263/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACa > 1:5774280/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTCGCGGTCGACa > 2:3030113/1‑101 (MQ=255)
gAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTg < 2:2249688/101‑1 (MQ=255)
aaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGt > 2:570184/1‑101 (MQ=255)
cTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGGTCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGGGTGGACCGAAACCTCGCCGCTTTGGCGGTCGCCAGGCCCGTaa > 2:2300974/1‑101 (MQ=37)
cccccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgt < 1:4961429/99‑1 (MQ=255)
cACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgt < 1:1008518/101‑1 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtgt > 1:5043920/1‑101 (MQ=255)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTc < 2:768778/101‑1 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGc < 1:1075538/101‑1 (MQ=255)
cTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGGAAAGTGTCGCt > 2:1030972/1‑101 (MQ=255)
tGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGcgc > 1:2806509/1‑99 (MQ=255)
cccTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccc < 1:3139766/101‑1 (MQ=255)
ccTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccccc < 1:548655/101‑1 (MQ=255)
ccTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccccc < 1:1201635/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc > 2:3578171/1‑101 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc > 1:2420560/1‑101 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc > 1:3545085/1‑101 (MQ=255)
tGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcg < 1:445083/101‑1 (MQ=255)
tGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcg > 1:1576617/1‑101 (MQ=255)
cggtgatcggtg.atCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgg > 2:3436785/1‑101 (MQ=255)
ggtgatcggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCggg < 1:3219629/101‑1 (MQ=255)
gtgatcggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgggg < 1:5362611/101‑1 (MQ=255)
tgatcggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCggggg > 2:1290923/1‑101 (MQ=255)
tgatcggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCggggg > 1:1772931/1‑101 (MQ=255)
gatcggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc < 2:174487/101‑1 (MQ=255)
tcggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCgg > 2:4831629/1‑100 (MQ=255)
tcggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGt < 2:2010754/101‑1 (MQ=255)
ggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGgg > 2:4656103/1‑101 (MQ=255)
gtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 1:3809293/101‑1 (MQ=255)
tg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:518330/101‑1 (MQ=255)
tg.atcAGCGGGCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:3723058/101‑1 (MQ=255)
g.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:627700/101‑1 (MQ=255)
atcAGCGCTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACCTCGCCGCTTCGGCGGACGACAGGCTGTTAACGTGTCGCTCCCCCCCCCGGGGCGAggctta > 2:3901125/1‑97 (MQ=25)
cAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 2:3964774/101‑1 (MQ=255)
cAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa > 2:801437/1‑101 (MQ=255)
aGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGCGGCTCGgaa > 2:4318378/1‑101 (MQ=37)
|
TTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAA > NC_014034/1395330‑1395530
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 16 ≤
ATCG
< 24 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 39 ≤
ATCG
|