Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,395,474 | T→G | 16.4% | intergenic (+286/‑645) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,395,474 | 0 | T→G | 16.4% | 152.0 ‑1.2 ‑0.3 | 349 | intergenic (+286/‑645) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (33/24): ref base (147/144): total (180/169) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.15e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.38e-01 |
Only 100 of 376 total aligned reads displayed.
CCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCC > NC_014034/1395374‑1395574
|
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCt > 2:710412/1‑101 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCttt > 2:4149554/1‑101 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTg > 1:5379231/1‑101 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTgg > 2:4412309/1‑101 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGc > 1:5033205/1‑101 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCgg > 1:4556070/1‑101 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTc > 1:5293067/1‑101 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCg < 1:3938075/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCg > 2:2737899/1‑101 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCg > 1:575486/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTCGCGGTCGACa > 2:3030113/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAg < 2:5335712/101‑1 (MQ=255)
cGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCt < 2:3248864/101‑1 (MQ=255)
gAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTg < 2:2249688/101‑1 (MQ=255)
aaaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTgg > 2:5587427/1‑101 (MQ=255)
aaaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTgg > 2:5436478/1‑101 (MQ=255)
aaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGt > 2:570184/1‑101 (MQ=255)
aCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGGCGACAGGCTGGTa > 1:5560209/1‑101 (MQ=255)
cTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGtca > 2:2198354/1‑99 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg > 1:4772535/1‑101 (MQ=255)
cccccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgt < 1:4961429/99‑1 (MQ=255)
cACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgt < 1:1008518/101‑1 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtgt < 2:2638602/101‑1 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtgt < 1:425148/101‑1 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGAGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGc < 1:5627598/101‑1 (MQ=255)
cccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccc < 1:3797572/101‑1 (MQ=255)
ccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccccc < 1:611722/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc > 2:1609413/1‑101 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc > 1:2420560/1‑101 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc < 1:4641189/101‑1 (MQ=255)
tGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcg < 1:445083/101‑1 (MQ=255)
ccGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcgcg < 1:1456709/101‑1 (MQ=255)
cggtgatcggtgatCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCCCgg > 2:2984716/1‑101 (MQ=255)
ggtgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCggg < 1:3219629/101‑1 (MQ=255)
gtgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgggg < 1:2879681/101‑1 (MQ=255)
gtgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgggg > 1:1221033/1‑101 (MQ=255)
tgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCggggg > 2:1290923/1‑101 (MQ=255)
tgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCggggg > 1:1772931/1‑101 (MQ=255)
tgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCcgggg > 2:3984185/1‑101 (MQ=255)
gatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc < 2:2100303/101‑1 (MQ=255)
gatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc < 2:174487/101‑1 (MQ=255)
gatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc < 2:1433974/101‑1 (MQ=255)
atcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCg > 2:2428787/1‑101 (MQ=255)
cggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg < 2:3391719/101‑1 (MQ=255)
ggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGgg > 2:4656103/1‑101 (MQ=255)
gctgggcgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:902603/92‑1 (MQ=0)
tgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:518330/101‑1 (MQ=255)
tgatcAGCGGGCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:3723058/101‑1 (MQ=255)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:2868548/93‑1 (MQ=0)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:3011195/93‑1 (MQ=0)
tggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 2:5129891/8‑101 (MQ=2)
gatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 2:3837634/1‑101 (MQ=255)
ggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 1:994893/7‑101 (MQ=2)
ggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 1:4015619/7‑101 (MQ=2)
atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAGAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:3520267/101‑1 (MQ=255)
aGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 1:2338100/1‑101 (MQ=255)
aGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGCGGCTCGgaa > 2:4318378/1‑101 (MQ=37)
gCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc < 1:202891/101‑1 (MQ=255)
cGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa < 1:4095712/101‑1 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACagc < 1:2202092/101‑3 (MQ=2)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACagc > 2:2668049/1‑99 (MQ=2)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAAAt > 2:3930654/1‑101 (MQ=255)
gTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgct > 2:3773847/1‑101 (MQ=2)
gTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtc > 2:1938972/1‑101 (MQ=255)
tCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtct > 2:1560552/1‑101 (MQ=255)
tCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtct < 2:5773985/101‑1 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtctc < 2:45605/101‑1 (MQ=255)
cGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgcttt < 1:1101348/101‑3 (MQ=2)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttc > 2:4976097/1‑98 (MQ=2)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttc > 1:2666755/1‑98 (MQ=2)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg > 2:792827/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg < 2:5235566/101‑1 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTGGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg < 1:774801/101‑1 (MQ=255)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaa > 1:3481832/1‑96 (MQ=2)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCggg > 2:3501322/1‑100 (MQ=255)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGt > 1:2847289/1‑101 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaat > 2:4824836/1‑95 (MQ=0)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACAGCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTg < 1:1056571/101‑1 (MQ=255)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGcc > 1:3170801/1‑101 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTc < 2:2023410/101‑1 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTc < 2:1330235/101‑1 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCt < 2:2584270/101‑1 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCg < 1:1300119/101‑1 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCg > 2:2905109/1‑101 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTcc > 2:4726316/1‑101 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTcc < 1:3384543/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTcc < 2:5546908/101‑1 (MQ=255)
gAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGcc > 1:1663205/1‑101 (MQ=255)
aaaCATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCt > 1:5465414/1‑101 (MQ=255)
aaaCATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCt < 2:4106099/101‑1 (MQ=255)
aaCATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTg < 1:3062437/101‑1 (MQ=255)
aaCATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTg < 1:1326460/101‑1 (MQ=255)
aCATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGGCTGc > 2:1075162/1‑101 (MQ=255)
cATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCt < 2:2303306/101‑1 (MQ=255)
tCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcg < 2:815338/101‑1 (MQ=255)
cgccgcTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgt > 2:4846001/1‑101 (MQ=255)
gccgcTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgtc < 1:2747905/101‑1 (MQ=255)
ccgcTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgtcg > 1:3349507/1‑101 (MQ=255)
gcTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCt < 1:1586426/101‑1 (MQ=255)
cTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGGCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTc > 1:3637435/1‑101 (MQ=255)
|
CCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCC > NC_014034/1395374‑1395574
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 39 ≤
ATCG
|