BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,012	A→G	4.4%	D215D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,012	0	A→G	4.4%	123.4 ‑2.2 0.0	1893	D215D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (39/53): ref base (922/872): total (966/927)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.08e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2301 total aligned reads displayed.


GATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAT  >  NC_014034/221912‑222112


 gtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                                     <  2:545342‑M1/58‑1 (MQ=255)


   ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                   <  2:227540‑M1/60‑1 (MQ=255)


   ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                   >  2:4618413‑M1/42‑101 (MQ=255)


   ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                   >  1:5495228‑M1/42‑101 (MQ=255)


   ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcg                                                                                                   <  2:1965811‑M1/60‑1 (MQ=255)


      tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                <  1:3924942‑M1/63‑1 (MQ=255)


       gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                               <  2:69032‑M1/64‑1 (MQ=255)


          aTCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                                            >  1:3722078/1‑101 (MQ=255)


           gccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                           >  2:4129724‑M1/34‑101 (MQ=255)


             ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                         >  1:3370285‑M1/32‑101 (MQ=255)


             ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                         <  2:5039131‑M1/70‑1 (MQ=255)


             gACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                         >  2:2542497/1‑101 (MQ=255)


              gtcggatccgtgggatctgtccgatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                        >  2:3608345‑M1/31‑101 (MQ=255)


                 gTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                     <  1:3083631/101‑1 (MQ=255)


                   gggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                   <  2:484663/101‑1 (MQ=255)


                   gggCGGCGAATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                   <  2:2033743/101‑1 (MQ=18)


                        tCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtccgtg                                                                              <  2:799071/101‑2 (MQ=11)


                          ggatcggtggggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                            >  1:1095037‑M1/19‑101 (MQ=255)


                           gatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGa                                                                           <  2:4385580‑M1/84‑1 (MQ=255)


                            aTGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggcc                                                                          >  1:5185634/1‑99 (MQ=255)


                              gCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                        <  1:1202738/101‑1 (MQ=255)


                              cggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgtgggatcggtagatggg                                                                        <  2:1748786‑M1/87‑8 (MQ=255)


                               cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                       <  1:145030/101‑1 (MQ=11)


                                gtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGgatcggt                                                                      <  1:5295200‑M1/89‑4 (MQ=255)


                                gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                      >  2:1863978/1‑101 (MQ=11)


                                  cgggtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGGCCGTgg                                                                    >  1:3256760/8‑101 (MQ=11)


                                   ggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                   >  1:4356787‑M1/10‑101 (MQ=255)


                                    gatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                  >  1:4666411‑M1/9‑101 (MQ=255)


                                     gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGACCCGTGGGAt                                                                 >  1:1636694/8‑101 (MQ=11)


                                     atcggtcggGTCCGTCGGACCCGGGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                                 <  2:395991/100‑1 (MQ=11)


                                       ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATccgtggggtcc                                                               <  2:4738387‑M1/96‑5 (MQ=255)


                                       ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                               <  2:3866065‑M1/96‑1 (MQ=255)


                                        ggtaggATCGGTCGGATCCTTTGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                              <  1:5705475/101‑1 (MQ=11)


                                        cgggggggccgtcggatccgtgggatgggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                              <  1:5616213/91‑1 (MQ=11)


                                         gtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                             <  1:4575861/95‑1 (MQ=11)


                                          tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                            <  1:1361608‑M1/99‑1 (MQ=255)


                                          tgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                            <  2:4245642‑M1/99‑1 (MQ=255)


                                           gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGACCGGGGGACCGGTCGGGTGCGGGGGAtcggtcg                                                           >  2:4059528/2‑101 (MQ=11)


                                           cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                           <  1:905383/101‑1 (MQ=255)


                                           cggATCGGTCGGGGCCGTGGGAGCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                           <  1:3601237/101‑1 (MQ=255)


                                             gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGGCCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAtcgggcgcg                                                         >  1:3160018/1‑99 (MQ=11)


                                              atcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggATCGGACGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGGGGTATCGGTCGGGGGCGGGGGATCGGTCtgga                                                        >  2:493925/1‑100 (MQ=11)


                                                cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTCGGATCGGTAGGGtgc                                                      >  2:1545066/1‑99 (MQ=11)


                                                cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgcgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGcc                                                      >  1:4896000/1‑101 (MQ=11)


                                                cggtcgggtccgtcggatcggtcggatccgtaggatCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcagatcggaag                                                      >  1:1291522/1‑91 (MQ=11)


                                                cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGGGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATcc                                                      >  2:2642864/1‑101 (MQ=11)


                                                 ggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGCCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGCCCGCTGGATCGGTAGGGTCCg                                                     >  1:2941113/1‑101 (MQ=11)


                                                 ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCCg                                                     >  2:3002532/1‑101 (MQ=14)


                                                  gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgt                                                    >  2:3262772‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                                   tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgta                                                   <  1:2267761‑M2/101‑8 (MQ=255)


                                                   gcgggtgcgttggatcggtcgggtcggtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                   <  1:596434/100‑2 (MQ=11)


                                                     gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGGGCCGTGGGGTcggccgg                                                 >  1:1964455/1‑95 (MQ=11)


                                                     gggtccgtgggatcggtcgggcccgtgggatcggtcGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGGGGGtggggagg                                                 >  2:1255982/1‑94 (MQ=11)


                                                      ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggga                                                <  1:4494209‑M2/101‑11 (MQ=255)


                                                       gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggat                                               <  1:2636522‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                       atccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggac                                               <  1:3480234‑M2/100‑12 (MQ=255)


                                                        tcggtgggacccgtcgtctccgtgggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                              <  2:1447708/98‑1 (MQ=11)


                                                        tccgtgggatcggtcgtgtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                              <  2:1145487/101‑1 (MQ=11)


                                                         ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcg                                             >  1:5094476‑M2/1‑88 (MQ=255)


                                                           gtggggtccgtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                           <  2:1011482/101‑1 (MQ=14)


                                                           gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggt                                           <  1:1857276‑M2/101‑16 (MQ=255)


                                                              ggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAtcgggcgg                                        >  2:45181/1‑101 (MQ=11)


                                                               gatcggtcgggtccgggggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgga                                       <  1:827349‑M2/101‑20 (MQ=255)


                                                                 gcgggcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatc                                     >  2:2877620‑M2/2‑80 (MQ=255)


                                                                 cccgtccgacccgttggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatc                                     <  2:5662952/91‑1 (MQ=11)


                                                                   ggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggggccg                                   >  2:5144596/1‑101 (MQ=11)


                                                                    gtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCCGGCCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGCCTCGcgcgggcccgt                                  >  1:4201581/1‑101 (MQ=11)


                                                                    gtcgggtccgtcggatcggccggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGCGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAACGatcgggtccgt                                  >  1:2862388/1‑101 (MQ=11)


                                                                    gtcggctccggaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCCTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgt                                  <  1:2718118/101‑1 (MQ=11)


                                                                     tcggatcctggggatcggtcggATCCGTGGGATAGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGgtcgggtccgta                                 <  1:4997894/101‑2 (MQ=11)


                                                                      cgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGATCGgtcgggtccgtgg                                >  2:3747103/1‑99 (MQ=11)


                                                                      cgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcg                                <  2:239280/101‑1 (MQ=11)


                                                                      cggatccgttggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcg                                <  1:4301436/101‑1 (MQ=11)


                                                                       gggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                               <  1:3816085‑M2/101‑28 (MQ=255)


                                                                         gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggat                             >  2:3367906‑M2/1‑72 (MQ=255)


                                                                          tccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                            >  1:2361508‑M2/1‑71 (MQ=255)


                                                                           ccgtgggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                           <  1:100380/101‑1 (MQ=14)


                                                                             gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                         >  2:1327625‑M2/1‑68 (MQ=255)


                                                                             gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcggggccgcggggtccgt                         >  2:3482133/1‑101 (MQ=11)


                                                                             gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggc                         <  1:712352‑M2/101‑34 (MQ=255)


                                                                               gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                       <  2:1662746‑M2/101‑36 (MQ=255)


                                                                               cgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTgg                       >  1:2037697/11‑101 (MQ=11)


                                                                                ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCGGTCGGCTAGGGGGGCTCGGTCGGGTGCGTGGGGTGCGTcgg                      >  2:5555418/1‑101 (MQ=2)


                                                                                ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgg                      >  1:1551856‑M2/1‑65 (MQ=255)


                                                                                  gtccgtcggATGCGTGGGGTCCGTGCGGTAGGTGGGATCGGTCGGGCTCCTCGGATCGGTTGGGTAGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAt                    <  1:4091836/97‑1 (MQ=2)


                                                                                  atcggtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggat                    >  2:2731475‑M2/1‑63 (MQ=255)


                                                                                    cggtcggGTCCGTGGGATCGTGTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcg                  <  1:2506777/101‑1 (MQ=11)


                                                                                    cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                  >  2:5367852/1‑101 (MQ=14)


                                                                                     ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccg                 <  2:3157189‑M2/101‑42 (MQ=255)


                                                                                     cgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccg                 <  2:30947/100‑3 (MQ=11)


                                                                                     cgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGATCGAATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGACCGTCGGAtccg                 <  2:5782228/100‑3 (MQ=11)


                                                                                       tgggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg               <  1:2170201‑M2/99‑44 (MQ=255)


                                                                                        gggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg              >  1:1710941/2‑101 (MQ=17)


                                                                                        cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtgg              <  2:4318615/101‑3 (MQ=11)


                                                                                           gtCCGTGGGAGGGTTCGGCTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgggt           <  2:2158180/100‑3 (MQ=14)


                                                                                           gtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgggg           >  2:852290/2‑99 (MQ=14)


                                                                                            tCCGTGTGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc          >  2:5246591‑M2/1‑53 (MQ=255)


                                                                                            tCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc          <  1:4009974‑M2/101‑49 (MQ=255)


                                                                                               gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgg       >  1:5400310/1‑100 (MQ=14)


                                                                                                tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc      <  1:4796944‑M2/101‑53 (MQ=255)


GATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAT  >  NC_014034/221912‑222112

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG