BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,045	G→C	7.4%	P204P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,045	0	G→C	7.4%	239.1 ‑2.8 0.0	1721	P204P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (46/80): ref base (696/843): total (768/953)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.24e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2458 total aligned reads displayed.


TGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221945‑222145


tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                                      >  1:1100130/1‑101 (MQ=255)


  gggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                                    <  1:5634023‑M1/92‑1 (MQ=255)


   ggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                                   >  1:1468412‑M1/9‑101 (MQ=255)


      cggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg                                                                                                <  1:4563783/101‑1 (MQ=11)


       cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                               <  2:1674742‑M1/97‑1 (MQ=255)


       cgggGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtccgtggggtccg                                                                                               >  1:2643013‑M1/5‑96 (MQ=255)


         tggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAcaggtc                                                                                             >  2:1875737/9‑101 (MQ=11)


          gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                            >  1:4793747‑M1/2‑101 (MQ=255)


           gggttggtcggggccgtgggatccggcggggccgggggggcCGGCGGGTTCGTGGGGTCGGGCGGGTCCCTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                           <  1:3082231/96‑1 (MQ=2)


           ggggcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                           <  1:2047619/97‑1 (MQ=14)


             gtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                                         <  2:4630965/97‑1 (MQ=14)


              tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtagatcg                                                                                        >  2:2655326/1‑95 (MQ=14)


              gcggtgggggccgtgggagcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATc                                                                                        <  1:2529775/100‑1 (MQ=11)


                ggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                      <  1:959149/101‑1 (MQ=11)


                ggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGCCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGCCCGCTGGATCGGTAGGGTCCg                                                                                      >  1:2941113/1‑101 (MQ=11)


                ggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                      >  1:4030612/1‑101 (MQ=11)


                 gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgt                                                                                     >  1:3262635‑M2/1‑95 (MQ=255)


                 gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgt                                                                                     >  2:3262772‑M2/1‑95 (MQ=255)


                 gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGGGGGAtcggtgggatgcgg                                                                                     >  2:4060926/1‑95 (MQ=11)


                  tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgta                                                                                    <  1:2267761‑M2/101‑8 (MQ=255)


                   cgggtgcgtggcagcggccggggccgggggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                                                   <  1:649574/101‑3 (MQ=11)


                    gggtcggtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTCGGCTCGTTCGGGACCGtgag                                                                                  >  1:385460/1‑98 (MQ=11)


                    gggtccgtggggtcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGCTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                                  <  1:4894875/101‑1 (MQ=11)


                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggg                                                                                  <  2:2074120‑M2/101‑10 (MQ=255)


                     ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGa                                                                                 >  2:4957725/1‑101 (MQ=14)


                     ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGa                                                                                 >  1:2147917/1‑101 (MQ=14)


                     ggtccgtgggatcgctcgtgtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                 <  2:2397799/101‑1 (MQ=11)


                     gctctgtgggatcggtctggtcagtggggtccgtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                 <  2:1057113/96‑1 (MQ=11)


                      tcttccgatctcggtcggagccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                <  1:4113566/91‑1 (MQ=14)


                       tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatc                                                                               >  2:4257887‑M2/1‑89 (MQ=255)


                       tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatc                                                                               <  1:1579621‑M2/101‑13 (MQ=255)


                       tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatc                                                                               <  2:3504834‑M2/101‑13 (MQ=255)


                         cgtgggggcgggcggagccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                             <  1:4221413/101‑1 (MQ=11)


                         cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtaga                                                                             >  1:4666168/1‑98 (MQ=11)


                         cgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                             >  1:5335366/1‑101 (MQ=11)


                          gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGgtccgtggggtcggg                                                                            <  2:2755836‑M2/101‑16 (MQ=255)


                          gtgggagccggcgggtccgttggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                            <  2:5290991/101‑1 (MQ=11)


                           ggggatcgggcggatccgtgggatcgggcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtcggtc                                                                           <  1:196957/100‑1 (MQ=11)


                            gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGAGGGGTGCGTGGGGtcggacg                                                                          >  2:5388840/1‑101 (MQ=11)


                                  ggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccg                                                                    <  1:3956454‑M2/101‑24 (MQ=255)


                                   gtcggctccggaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCCTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgt                                                                   <  1:2718118/101‑1 (MQ=11)


                                   gtcggatccgtgggttccgtcggACCCGTGGGATCGCTCGGATTCTGGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgt                                                                   <  2:582978/101‑1 (MQ=11)


                                    tcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtg                                                                  >  1:76083/1‑100 (MQ=11)


                                     cgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtgg                                                                 >  1:5095591/1‑99 (MQ=11)


                                     cggatccgttggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcg                                                                 <  1:4301436/101‑1 (MQ=11)


                                       ggtccgtggggtccgtcggAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAACGGTCGCATCCGTCGGAGCGGAGGGGTCCGTAGGCGCggt.gggtcagttcgct                                                              >  2:805771/1‑96 (MQ=9)


                                       ggtccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATGGGTCGGGTCGGTGGGGTCCgtggggtccgtcggg                                                               >  2:3096678/1‑101 (MQ=11)


                                        gtccgtggggtccgtcggATCCCTGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccgtgggat                                                              <  2:3786535/101‑3 (MQ=11)


                                        atccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggt                                                              <  2:1775045/100‑1 (MQ=11)


                                         tccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtc                                                             <  1:1760653/101‑1 (MQ=11)


                                          ccgtgggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                                                            <  1:100380/101‑1 (MQ=14)


                                           cgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                           >  2:5471094‑M2/1‑69 (MQ=255)


                                               gggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTggg                                                       <  2:5180967/92‑1 (MQ=14)


                                                gatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGGCGGATCCGTgggg                                                      >  1:4479992/1‑100 (MQ=11)


                                                 gtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGag                                                     >  2:1468319/5‑100 (MQ=11)


                                                 atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                                                     >  2:4526699/1‑101 (MQ=14)


                                                 atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                                                     >  2:21685/1‑101 (MQ=14)


                                                  tctgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                    >  2:2532935‑M2/1‑62 (MQ=255)


                                                  tcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGtc                                                    <  1:3505051/101‑1 (MQ=11)


                                                   cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGTGTCGGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                   <  2:1979556/101‑1 (MQ=14)


                                                    ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                  <  2:36538‑M2/101‑42 (MQ=255)


                                                    ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                  <  1:4355686‑M2/101‑42 (MQ=255)


                                                    ggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCGGTCGGATCCGTgggggccg                                                  >  2:389203/1‑96 (MQ=11)


                                                      tggggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                <  2:337651/96‑1 (MQ=11)


                                                       cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                               <  1:865686‑M2/101‑45 (MQ=255)


                                                        ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgcggg                                              <  1:1862950‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                        ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                              <  2:4147971‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                          gtcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                            >  2:1162392‑M2/2‑54 (MQ=255)


                                                          gtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgggg                                            >  1:2378664/2‑99 (MQ=14)


                                                          aTCCGTGGGATCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt                                            <  2:1273984/101‑1 (MQ=11)


                                                           tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                           >  1:5502084‑M2/1‑53 (MQ=255)


                                                            cggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                          >  1:5748823/6‑101 (MQ=17)


                                                            ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                          >  2:1583958/1‑101 (MQ=14)


                                                            ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCAGATcg                                          >  1:1667650/1‑100 (MQ=14)


                                                              gTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                        <  2:5064903‑M2/101‑52 (MQ=255)


                                                               tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                       >  2:2881588‑M2/1‑49 (MQ=255)


                                                                gggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                      <  1:3157222‑M2/101‑54 (MQ=255)


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                                                                   ctcggtcggGTCCGTTGGAGCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGGGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                   <  1:130119/100‑1 (MQ=14)


                                                                    tcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                  <  2:1341548‑M2/101‑58 (MQ=255)


                                                                      ggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                <  2:4325206‑M2/101‑60 (MQ=255)


                                                                        tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                              <  1:4989662/101‑1 (MQ=17)


                                                                           ggTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggga                           >  1:3747331‑M2/1‑37 (MQ=255)


                                                                            gTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                          >  2:885214‑M2/1‑36 (MQ=255)


                                                                             tCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTAGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                         <  2:3168522/101‑1 (MQ=18)


                                                                             tCCGTGGGATCGGTCTGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                         <  1:3639250/101‑1 (MQ=17)


                                                                              ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg                        >  1:1221677‑M2/1‑34 (MQ=255)


                                                                              ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                        >  2:4744065‑M2/1‑34 (MQ=255)


                                                                              ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                        <  2:227540‑M2/101‑68 (MQ=255)


                                                                                 tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGta                     >  1:5403358/1‑100 (MQ=17)


                                                                                    gatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcgga                  <  1:3385236‑M2/101‑74 (MQ=255)


                                                                                        ggtcggCGCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTTGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcgg              <  2:5561854/101‑6 (MQ=14)


                                                                                        cgtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccg              >  2:4860333‑M2/2‑24 (MQ=255)


                                                                                         gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggt             >  1:5213783/1‑101 (MQ=255)


                                                                                         gtcggATGCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggt             <  1:2850197/101‑7 (MQ=14)


                                                                                         gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggt             >  1:1362469/1‑95 (MQ=14)


                                                                                            gggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTggg          >  2:697725/4‑101 (MQ=255)


                                                                                                ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcg      >  2:3024191/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                  gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt    <  2:3978830‑M2/101‑88 (MQ=255)


                                                                                                  gTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggt    <  2:4404727/101‑1 (MQ=255)


TGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221945‑222145

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG