BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,048	A→G	1.9%	D203D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,048	0	A→G	1.9%	45.5 ‑2.4 ‑1.5	1680	D203D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (11/26): ref base (730/910): total (742/938)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 9.33e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.36e-02

Only 100 of 2421 total aligned reads displayed.


GCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAC  >  NC_014034/221948‑222148


ggtcggtgggGTCGGTCGGGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                                      <  1:4908482/99‑1 (MQ=11)


ggtaggttggAGCGGTGGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                                      <  2:1385808/97‑1 (MQ=11)


 gtccgccggATGGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                                                                     <  2:1521661/95‑1 (MQ=11)


  tccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatg                                                                                                    <  2:3679055‑M1/95‑2 (MQ=255)


    cgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGggataga                                                                                                  <  1:404549‑M1/97‑4 (MQ=255)


     gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                                 <  1:3966624‑M1/98‑1 (MQ=255)


     gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                                 >  2:2911804‑M1/4‑101 (MQ=255)


     gtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAccggg                                                                                                 >  2:2181156/1‑100 (MQ=11)


      tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                                <  1:1487915‑M1/99‑1 (MQ=255)


       gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                               <  1:3760810‑M1/100‑1 (MQ=255)


        ggggcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                              <  1:2047619/97‑1 (MQ=14)


        agatcagtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGGTCGGTCGGGTCTGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                              <  2:5587046/100‑1 (MQ=11)


          gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGat                                                                                            >  1:904390‑M2/2‑99 (MQ=255)


          atcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGt                                                                                            >  1:2380409/1‑101 (MQ=11)


          atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGat                                                                                            <  1:136666‑M2/101‑3 (MQ=255)


          atcggtcgggtccgtggcatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                                                            <  2:5195244/101‑3 (MQ=14)


           tcggtggggtccgtggggtccgtcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                           <  1:1223179/101‑1 (MQ=11)


           tccgtcggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTc                                                                                           >  1:1118400/4‑101 (MQ=11)


            cttccgagctcgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                                                          <  2:1699587/91‑1 (MQ=11)


            cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatcc                                                                                          >  2:1600681‑M2/1‑97 (MQ=255)


            cgggcgggtccgttggatctgtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                          <  1:5657544/101‑1 (MQ=11)


            cggctggctccgtggactcggccagggccatggggtccgtcggATGCGTGAGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                          <  2:599262/93‑1 (MQ=9)


             ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGCCGGGTCCGTGGGGTCGGTCAGGCCCGTCGGGTCGGTCGGAGTCGTCGGCGCGGCCggggacg                                                                                         >  2:3105901/1‑97 (MQ=2)


             ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatgGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGGGGGTCCGGGGGACTGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                         >  1:341041/1‑101 (MQ=11)


              gtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                        >  1:3658220/7‑101 (MQ=11)


              gtcgggtacgtgggatcggtcgggtccgtagggtcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                        <  2:4281950/101‑1 (MQ=11)


               ttgcctctgtgggctctgtcgggacggtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                                                       <  2:3927089/93‑2 (MQ=11)


               tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                                                       <  1:5112974/101‑2 (MQ=11)


               tcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGGGGGATAGGTCGGGTCCggg                                                                                       >  2:1913922/1‑99 (MQ=11)


               tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATGCGtg                                                                                       >  2:303852/1‑100 (MQ=11)


                cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgg                                                                                      >  2:4193293‑M2/1‑93 (MQ=255)


                cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgg                                                                                      >  1:4227778‑M2/1‑93 (MQ=255)


                cggggccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                                                      <  1:3866307/101‑3 (MQ=11)


                cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgg                                                                                      <  2:5484981‑M2/101‑9 (MQ=255)


                 gggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgcggg                                                                                     >  1:4684752/1‑97 (MQ=11)


                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                                     >  1:5533436/1‑101 (MQ=14)


                  ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGCGATCGGTCGTGCCCGTGCGATCCGTGggggctgaggga                                                                                    >  1:2272670/1‑92 (MQ=11)


                   gaccgtgtgatccgtcgggtccgtgggaccggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                   <  2:5394203/99‑1 (MQ=11)


                    tccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGGTCGGTCGGGTCCggggggtg                                                                                  >  2:4339911/1‑94 (MQ=11)


                     ccgtgggctcggtcgggtccgttggatcggtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTtcg                                                                                 <  2:4901046/101‑1 (MQ=11)


                     ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcg                                                                                 <  1:2742917‑M2/101‑14 (MQ=255)


                      cgtgggatcggtcggatgcgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTTGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                <  1:4816053/101‑1 (MQ=11)


                       gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggt                                                                               <  1:4136571‑M2/101‑16 (MQ=255)


                       gtgggagcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTTGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                               <  2:4433639/101‑1 (MQ=11)


                         gggatcggttggatccgggggatcggtcggGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                             <  1:5237514/101‑1 (MQ=11)


                         gggatcggtctgctccggggggtccgtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                             <  2:1812091/101‑1 (MQ=11)


                          gggtccgtcggctccgtggggtccgtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtggg                                                                            <  2:2777622/95‑1 (MQ=11)


                           ggtccgtcggatccgtgggatgggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgga                                                                           >  1:3279224/6‑100 (MQ=11)


                           gatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcggg                                                                           <  1:2653451‑M2/101‑20 (MQ=255)


                             tcggtggggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                                                                         <  2:1219113/101‑1 (MQ=11)


                               ggtggggtccgggggatcgggcggAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATTGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGgtcggatccg                                                                       <  2:2076184/101‑1 (MQ=11)


                                  cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGgtcggatccgggg                                                                    >  1:5005693/1‑98 (MQ=11)


                                   gggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg                                                                   >  2:3546973/1‑101 (MQ=11)


                                   gggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg                                                                   >  1:5424134/1‑101 (MQ=11)


                                   ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                                                                   >  2:3810101/4‑101 (MQ=255)


                                    ggtccgtggggtccgtcggAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAACGGTCGCATCCGTCGGAGCGGAGGGGTCCGTAGGCGCggt.gggtcagttcgct                                                                 >  2:805771/1‑96 (MQ=9)


                                    ggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggga                                                                  >  2:4548153/1‑100 (MQ=11)


                                     gtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtaggat                                                                 <  2:1302413‑M2/101‑30 (MQ=255)


                                     gtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtaggat                                                                 >  1:3157378‑M2/1‑72 (MQ=255)


                                      tccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtc                                                                <  1:1760653/101‑1 (MQ=11)


                                      tccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGGGGGGTCGggcgggaccgggggggc                                                                >  2:2285722/1‑94 (MQ=11)


                                       ccgtgggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                                                               <  1:100380/101‑1 (MQ=14)


                                       ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGgtcggctccggggggtgc                                                               >  2:1094962/1‑99 (MQ=11)


                                        cgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGgtcgggcccgggggatcgg                                                              >  2:2671148/1‑92 (MQ=11)


                                         gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggt                                                             <  1:1306212‑M2/101‑34 (MQ=255)


                                           aggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTgg                                                           <  1:4361177/100‑1 (MQ=14)


                                            ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                          >  2:5092771‑M2/1‑65 (MQ=255)


                                                ccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                      <  2:254742/96‑1 (MQ=14)


                                                  ggcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                    <  1:2542639/99‑1 (MQ=14)


                                                   tcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgcg                                                   <  1:2158302‑M2/101‑44 (MQ=255)


                                                    gggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                                  >  2:3291384‑M2/2‑57 (MQ=255)


                                                     ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgcggg                                                 <  1:1862950‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                        tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                              >  2:70385‑M2/1‑53 (MQ=255)


                                                         cggtgGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                             >  1:4305837‑M2/3‑52 (MQ=255)


                                                         ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCAGATcg                                             >  1:1667650/1‑100 (MQ=14)


                                                         ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                             >  1:807754‑M2/1‑52 (MQ=255)


                                                            tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                          <  1:450812‑M2/101‑53 (MQ=255)


                                                            tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                          >  2:4000597/1‑101 (MQ=14)


                                                             gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                         <  1:4578425‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                              ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                        >  1:2954325‑M2/1‑47 (MQ=255)


                                                              ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                        <  1:2867514‑M2/101‑55 (MQ=255)


                                                               gATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                       >  2:4989381/1‑101 (MQ=17)


                                                                     tcggGTCCGTGGGATCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                                 >  2:5296654‑M2/1‑40 (MQ=255)


                                                                      cggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                <  2:878358‑M2/101‑63 (MQ=255)


                                                                       gggTCCGTTGGAGCCGGCCGGTCCCTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                               <  1:5769918/101‑1 (MQ=0)


                                                                       gggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                               >  2:4074298/1‑101 (MQ=255)


                                                                       gggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                               >  1:1969701/1‑101 (MQ=17)


                                                                           ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg                           >  2:5684889‑M2/1‑34 (MQ=255)


                                                                           ccGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                           <  2:4643306/101‑1 (MQ=255)


                                                                           ccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                           <  1:69043/101‑1 (MQ=17)


                                                                           ccGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTcc                           <  1:1584052/101‑1 (MQ=11)


                                                                            cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCAGTCGGGTCCGTGGGATCGGACGGGTACGTAGGAGCGGTCGGGGCCg                          >  2:4763767/1‑101 (MQ=2)


                                                                                ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcgg                      <  2:339557‑M2/101‑73 (MQ=255)


                                                                                 gATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTggga                     >  2:3194633/1‑100 (MQ=17)


                                                                                  atcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggat                    <  2:2408989‑M2/101‑75 (MQ=255)


                                                                                  aTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTcgggg                    >  1:3088926/1‑100 (MQ=11)


                                                                                   ttggtcggATCCGTGGAGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatc                   <  1:983494/99‑4 (MQ=14)


                                                                                   tcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                   <  1:5340555/101‑4 (MQ=14)


                                                                                        cggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtcg              <  2:1982293‑M2/101‑81 (MQ=255)


                                                                                          ggaccGTGGGATGGGGGGGGGCGGTAGGATCTGTCGGGTCCGCCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGa            <  1:3539023/98‑1 (MQ=18)


GCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAC  >  NC_014034/221948‑222148

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG