BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,051	G→C	1.8%	T202T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,051	0	G→C	1.8%	35.7 ‑3.2 ‑0.6	1481	T202T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (8/22): ref base (660/788): total (670/811)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.23e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.54e-01

Only 100 of 2386 total aligned reads displayed.


CGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGC  >  NC_014034/221951‑222151


cggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg                                                                                                      <  2:3275539/101‑1 (MQ=11)


ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                      >  1:3840404‑M1/6‑101 (MQ=255)


ccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGTGGGGTCGGCCGGGGCAGTGGGAtcg                                                                                                      >  2:317867/3‑101 (MQ=14)


 cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                                     <  2:1674742‑M1/97‑1 (MQ=255)


 cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                                     <  1:796675‑M1/97‑1 (MQ=255)


  gtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                                    >  2:5393539/10‑101 (MQ=11)


  gtgGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                                    >  2:4890336‑M1/4‑101 (MQ=255)


  gtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                                    >  2:3098315‑M1/4‑101 (MQ=255)


  gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                                    >  2:5478054/1‑101 (MQ=255)


   tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   >  1:5652124‑M1/3‑101 (MQ=255)


   tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   <  1:1487915‑M1/99‑1 (MQ=255)


   ggGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   >  1:4108048‑M1/3‑101 (MQ=255)


    cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtgg                                                                                                  >  2:1770851/1‑99 (MQ=255)


     ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggtcgg                                                                                                 >  2:2047502/1‑101 (MQ=11)


     ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGGGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTCGGTCGGAtcggttcg                                                                                                 >  2:415871/1‑98 (MQ=11)


       atcggtcgggtccgtggcatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                                                               <  2:5195244/101‑3 (MQ=14)


        tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtagatcg                                                                                              >  2:2655326/1‑95 (MQ=14)


        ggagtgcggtccgtgggagcggtcggggccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                              <  1:2647263/94‑1 (MQ=14)


         ctggcgtatccgtgggatcggtcgggtccgttggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                             <  1:1305871/93‑1 (MQ=11)


         cggtgggctccgcgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                             <  2:2147795/101‑1 (MQ=11)


         cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc                                                                                             >  1:465800/1‑101 (MQ=11)


         cgggcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtggggtCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                             <  1:1674841/101‑1 (MQ=11)


          ggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGCCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGCCCGCTGGATCGGTAGGGTCCg                                                                                            >  1:2941113/1‑101 (MQ=11)


          ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGACGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGCTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCg                                                                                            >  1:5339952/1‑101 (MQ=11)


          ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggagccg                                                                                            >  2:5094191/1‑96 (MQ=11)


          ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccg                                                                                            >  2:4069832‑M2/1‑96 (MQ=255)


          ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGGCCGTGGGATCTGTCGGGTACg                                                                                            >  2:594113/1‑101 (MQ=14)


          ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcGGTCGGGTCCGCGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                            >  2:251845/1‑101 (MQ=11)


           gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgt                                                                                           >  1:3262635‑M2/1‑95 (MQ=255)


            tcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                                                          <  1:3739548/101‑2 (MQ=14)


            tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtg                                                                                          <  2:3788433‑M2/101‑8 (MQ=255)


             cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                                                         >  1:5757283/1‑99 (MQ=14)


             cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGtgg                                                                                         >  2:3515628/1‑99 (MQ=11)


              gggtccgtggggtcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGCTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                                        <  1:4894875/101‑1 (MQ=11)


              gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGCCGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                                        >  2:3027202/1‑101 (MQ=11)


               ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGCGATCGGTCGTGCCCGTGCGATCCGTGggggctgaggga                                                                                       >  1:2272670/1‑92 (MQ=11)


               ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGa                                                                                       >  1:2147917/1‑101 (MQ=14)


               gatccgtgggatcggtcgggtccgttggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                                       >  1:3943457/3‑101 (MQ=11)


                  ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcg                                                                                    >  1:1105026‑M2/1‑88 (MQ=255)


                   cgtggggtcggtcgggtccgtggggtccgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                   <  1:5005178/101‑1 (MQ=11)


                   cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcgg                                                                                   >  1:3146404‑M2/1‑87 (MQ=255)


                    gtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                  <  1:1223071/101‑1 (MQ=11)


                     ggggatcgggcggatccgtgggatcgggcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtcggtc                                                                                 <  1:196957/100‑1 (MQ=11)


                       ggatcgggcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                               <  1:3080770/101‑1 (MQ=11)


                           cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                           >  1:55105‑M2/1‑79 (MQ=255)


                           cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCCGgtcggggcc                                                                           >  1:970844/1‑101 (MQ=11)


                            ggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGggcgggtccg                                                                          >  1:5109042/1‑101 (MQ=11)


                             gtcggatccgtgggatcngtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgt                                                                         <  2:2395371/101‑1 (MQ=255)


                             gtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgg                                                                         <  2:3668044‑M2/101‑25 (MQ=255)


                                ttatccgtgggatcgggcggTTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                                                                      <  2:1059168/98‑1 (MQ=14)


                                gggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGatccgtgggatcggtcggatccgtggg                                                                      <  1:3388560‑M2/101‑28 (MQ=255)


                                 ggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggga                                                                     >  2:4548153/1‑100 (MQ=11)


                                 gatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTCGGGCGGgcggggtccgtcgga                                                                     >  2:2887640/3‑100 (MQ=11)


                                   tccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtc                                                                   <  1:1760653/101‑1 (MQ=11)


                                    ccgtgggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                                                                  <  1:100380/101‑1 (MQ=14)


                                    ccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                                                                  <  2:1165415/101‑1 (MQ=11)


                                     cgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcggtggggcccc                                                                 >  2:1866017/1‑100 (MQ=11)


                                     cgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGtggggtccgtcgggtccg                                                                 >  1:2042297/1‑101 (MQ=11)


                                       tgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                               >  2:4330856‑M2/1‑67 (MQ=255)


                                       tgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTg                                                               >  1:4350263/1‑101 (MQ=11)


                                            tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                          >  1:4562948/1‑101 (MQ=14)


                                            tcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGtc                                                          <  1:3505051/101‑1 (MQ=11)


                                                  ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgcggg                                                    <  1:1862950‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                  ggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCAGGTCCGTGGGATAGGACGGGTCCGTCGTGTTCGTCGGGtacgtcgg                                                    >  2:2265183/1‑101 (MQ=2)


                                                   ggtccGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                                   >  1:4482020‑M2/3‑55 (MQ=255)


                                                    aTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAt                                                  >  1:4282987/1‑101 (MQ=11)


                                                     tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                                 >  2:70385‑M2/1‑53 (MQ=255)


                                                      ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                <  2:806086‑M2/101‑50 (MQ=255)


                                                      ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                >  2:1583958/1‑101 (MQ=14)


                                                         tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                             <  1:4796944‑M2/101‑53 (MQ=255)


                                                         tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGAtcggtgggggccggg                                             >  2:5586102/1‑94 (MQ=11)


                                                          cgtgtcttgagggTCGGTCGGAGCGGTGGGAGCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                            <  2:5663917/91‑1 (MQ=11)


                                                          cggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                            >  2:3906945/2‑101 (MQ=255)


                                                            gATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                          >  2:4989381/1‑101 (MQ=17)


                                                                ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtacg                                      <  2:1337536‑M2/101‑60 (MQ=255)


                                                                 gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgg                                     <  2:2754140‑M2/101‑61 (MQ=255)


                                                                  gcgggTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtg                                    >  2:4643506‑M2/2‑40 (MQ=255)


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                                                                     ggTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                 <  1:885290‑M2/101‑65 (MQ=255)


                                                                      gTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                >  2:885214‑M2/1‑36 (MQ=255)


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                                                                       tCCGTGGGATCGGTCTGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                               <  1:3639250/101‑1 (MQ=17)


                                                                        ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggatccgtgggatcg                              <  1:5227592‑M2/101‑68 (MQ=255)


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                                                                           tggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc                           >  2:3385031‑M2/1‑31 (MQ=255)


                                                                           tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc                           <  1:2395505‑M2/101‑71 (MQ=255)


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                                                                                   gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggt                   >  1:1362469/1‑95 (MQ=14)


                                                                                    tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggtg                  <  1:285322/101‑1 (MQ=255)


                                                                                     cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggtgg                 >  2:4260396/1‑101 (MQ=255)


                                                                                         gccGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTAGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtc             <  1:5412195/100‑1 (MQ=255)


                                                                                          ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtagggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcg            <  2:1972480‑M2/101‑86 (MQ=255)


                                                                                            gTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggt          >  2:1474427/1‑101 (MQ=255)


CGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGC  >  NC_014034/221951‑222151

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG