| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 678,806 | C→A | 8.6% | A1601S (GCG→TCG) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 678,806 | 0 | C→A | 8.6% | 43.6 ‑1.1 ‑0.3 | 229 | A1601S (GCG→TCG) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (13/7): ref base (108/101): total (121/108) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.49e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.50e-01 | ||||||||||
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
GCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGAC > NC_014034/678706‑678906
|
gcCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTcgc > 2:3042148/1‑101 (MQ=255)
cGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCgcgc > 2:2041730/1‑101 (MQ=255)
gTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCt > 2:5326370/1‑101 (MQ=255)
gTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCt > 1:2550491/1‑101 (MQ=255)
tCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTc > 2:5556440/1‑101 (MQ=255)
tCCCGATCCCCGCCAGGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGGGATCTGGGCCGTGCTCAGCGCCCCGATCTGCGTCGCGCTc > 2:2400444/1‑101 (MQ=255)
tCCCGACCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTc < 2:662680/101‑1 (MQ=255)
ccGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAg < 1:2408117/101‑1 (MQ=255)
cGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGc < 1:2071993/101‑1 (MQ=255)
gATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGcc > 1:5241026/1‑101 (MQ=255)
gATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGcc > 2:2077465/1‑101 (MQ=255)
aTCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCg > 1:1601275/1‑101 (MQ=255)
aTCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCg > 2:1263822/1‑101 (MQ=255)
aTCCCCGCCATGGCCGACACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCg < 2:5193767/101‑1 (MQ=255)
cccccGCCATGGCCGAGACCGAAAGCCGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGt < 2:1104481/100‑1 (MQ=255)
ccccGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTg < 2:133631/101‑1 (MQ=255)
cccGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTgc < 2:54262/101‑1 (MQ=255)
cGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTgccg < 2:2914665/101‑1 (MQ=255)
gCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTgccgc > 1:109387/1‑101 (MQ=255)
ccATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTgccgcc > 2:1949707/1‑101 (MQ=255)
cATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCt > 2:4179909/1‑101 (MQ=255)
cATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCt < 2:592956/101‑1 (MQ=255)
aTGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTg < 2:5612786/101‑1 (MQ=255)
aTGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTg > 1:5362401/1‑101 (MQ=255)
aTGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTg < 2:2701461/101‑1 (MQ=255)
ggCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTgcg < 2:2578948/101‑1 (MQ=255)
ccGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGcc < 2:4349771/101‑1 (MQ=255)
gagaCCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGt < 2:1640616/101‑1 (MQ=255)
agaCCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTg > 1:3393043/1‑101 (MQ=255)
agaCCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTg < 1:4900454/101‑1 (MQ=255)
aCCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGt > 2:3684590/1‑101 (MQ=255)
ccGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTc < 1:714316/101‑1 (MQ=255)
gAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAg > 1:3206146/1‑101 (MQ=255)
aaaGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAgc > 2:4436652/1‑101 (MQ=255)
aaaGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAgc < 2:5030534/101‑1 (MQ=255)
aGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAgcgc > 1:3776776/1‑101 (MQ=255)
aGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAgcgc > 1:4156722/1‑101 (MQ=255)
ccgcaccagatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa > 1:2120853/10‑101 (MQ=2)
tGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGcccc > 1:1361434/1‑99 (MQ=255)
tGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCAc < 1:239015/101‑1 (MQ=255)
gcaccagatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACg > 1:1257668/8‑101 (MQ=2)
caccagatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGa > 1:5514965/7‑101 (MQ=2)
gCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGAt < 2:3776513/101‑1 (MQ=255)
gCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGAt < 2:3392838/101‑1 (MQ=255)
gCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGAt < 1:3171491/101‑1 (MQ=255)
gCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGAt < 1:3494135/101‑1 (MQ=255)
accagatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt > 2:3654422/6‑101 (MQ=2)
cGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATg < 1:1766674/101‑1 (MQ=255)
cGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATg > 1:4754360/1‑101 (MQ=255)
gATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGt < 1:166916/101‑1 (MQ=255)
gATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGt > 1:3040533/1‑101 (MQ=255)
atatCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTc > 2:4818359/1‑101 (MQ=255)
atatCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTc > 1:2872800/1‑101 (MQ=255)
atatCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTc > 1:4004075/1‑101 (MQ=255)
gatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa < 1:3954294/100‑1 (MQ=2)
gatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa < 2:3142092/100‑1 (MQ=2)
atCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGCCGTCAGCGCCACGATGTCAt < 2:4129182/101‑1 (MQ=2)
atCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCAt < 2:5362111/101‑1 (MQ=255)
tCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCAtt < 2:5339618/101‑1 (MQ=255)
cgcgGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCg < 2:4030/101‑1 (MQ=255)
gcgGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGt > 2:5209376/1‑101 (MQ=255)
cgGTTTCCACCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTg > 2:4737789/1‑101 (MQ=255)
ggTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGc < 1:5615790/101‑1 (MQ=255)
gTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGcc > 1:3644464/1‑101 (MQ=255)
tttCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGccc > 2:1043965/1‑101 (MQ=255)
tCCAGCGCCGCGATCTGAGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAg > 2:3879472/1‑101 (MQ=255)
cgccgcGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCt < 1:1949818/101‑1 (MQ=255)
cgccgcGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCt < 1:2639733/101‑1 (MQ=255)
cgccgcGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGCTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCt > 1:4980961/1‑101 (MQ=255)
cgccgcGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATATGCGTAGCGCTCAGCCGCGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCTACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCt > 2:5135487/1‑101 (MQ=25)
gccgcGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCtt < 1:1748266/101‑1 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCtt < 1:4214224/101‑1 (MQ=255)
cgcgATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCa > 2:3837890/1‑101 (MQ=255)
cgcgATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCa < 2:2444853/101‑1 (MQ=255)
gcgATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAg < 2:4395443/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAgcg < 2:3410977/101‑1 (MQ=255)
tCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGcgcc < 2:1206041/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGcgccg < 1:5100135/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGcgccgc < 2:1256772/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGcgccgc > 2:3902444/1‑101 (MQ=255)
gcgcCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCcgcg > 1:59698/1‑101 (MQ=255)
gTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCt < 2:2609286/101‑1 (MQ=255)
gCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCa < 2:191092/101‑1 (MQ=255)
cTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAg > 1:1457541/1‑101 (MQ=255)
tcggcgcCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAgc < 2:4882917/98‑1 (MQ=255)
gcgATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGAt < 1:4818640/101‑1 (MQ=255)
gcgATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGAt > 1:3933386/1‑101 (MQ=255)
cgATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCGCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATc < 1:3250000/101‑1 (MQ=255)
cgATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATc < 2:1393229/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGGGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCg < 1:52907/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCg < 1:1263905/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCg > 1:1461579/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGTCGCGGTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGc < 2:457552/101‑1 (MQ=255)
tGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGcccc > 1:4853398/1‑101 (MQ=255)
gTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCggc > 2:1697382/1‑100 (MQ=255)
gTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGt > 2:3322985/1‑101 (MQ=255)
gTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGt < 1:4398251/101‑1 (MQ=255)
gTCACGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGt > 2:3240086/1‑101 (MQ=255)
cgcgCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGGGGTCAGCACCACGTTGTCCTTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCg < 1:4468150/101‑1 (MQ=255)
cgcTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGAc < 1:1414816/101‑1 (MQ=255)
|
GCCGTCCCGATCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGCGCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGAC > NC_014034/678706‑678906
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 22 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|