Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_014034 | 1,951,528 | 2 bp→GC | 100% | coding (65‑66/528 nt) | ssb1 ← | single‑stranded DNA‑binding protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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* | NC_014034 | 1,951,528 | 0 | C→G | 100.0% | 878.6 | 236 | T22T (ACG→ACC) | ssb1 | single‑stranded DNA‑binding protein |
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* | NC_014034 | 1,951,529 | 0 | G→C | 100.0% | 877.7 | 236 | T22R (ACG→AGG) | ssb1 | single‑stranded DNA‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (103/133): ref base (0/0): total (103/133) |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
CATTCGGTGCGCTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAACGTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGACCCG > NC_014034/1951433‑1951623
||
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cTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGt > 2:4836779/1‑101 (MQ=255)
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cTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTcgc > 1:4805243/1‑101 (MQ=255)
cTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTcgc > 1:29152/1‑101 (MQ=255)
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cgcTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCATGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGccc < 1:4865642/101‑1 (MQ=255)
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gcTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTCCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCg < 2:4684663/101‑1 (MQ=255)
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tCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAg > 2:1878562/1‑101 (MQ=255)
tCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAg > 2:4171347/1‑101 (MQ=255)
tCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAg < 1:4312904/101‑1 (MQ=255)
tCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAg < 2:293105/101‑1 (MQ=255)
cGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAgg < 1:5797435/101‑1 (MQ=255)
cGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAgg < 1:3838308/101‑1 (MQ=255)
gCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGt < 2:2006581/101‑1 (MQ=255)
gCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGt > 1:2595283/1‑101 (MQ=255)
gCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGt < 1:2893991/101‑1 (MQ=255)
cccGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGtt < 1:2951009/101‑1 (MQ=255)
gATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGcc > 1:3886116/1‑101 (MQ=255)
aTTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGccc > 2:1814539/1‑101 (MQ=255)
aTTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGccc < 1:90291/101‑1 (MQ=255)
aTTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGccc < 1:1224376/101‑1 (MQ=255)
tGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCccac > 1:3097281/1‑101 (MQ=255)
tGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCccac > 2:4556568/1‑101 (MQ=255)
tGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCccac > 2:1492738/1‑101 (MQ=255)
gCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCccacc < 2:2244831/101‑1 (MQ=255)
tGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGa > 2:2482255/1‑101 (MQ=255)
gTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGaa < 2:3511632/101‑1 (MQ=255)
tCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAAt < 2:821298/101‑1 (MQ=255)
cnAGNTNTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGAccn < 1:316287/101‑2 (MQ=255)
cAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCCCCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCtt < 1:1401574/101‑1 (MQ=255)
cAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGGCCtt > 2:4118647/1‑101 (MQ=255)
cAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCtt > 1:1748932/1‑101 (MQ=255)
cAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGAGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCtt > 2:1346541/1‑101 (MQ=255)
aGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTg < 1:1183374/101‑1 (MQ=255)
ggTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGt < 2:5008296/101‑1 (MQ=255)
gTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGtt < 2:3678930/101‑1 (MQ=255)
gTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGtt > 1:2134189/1‑101 (MQ=255)
gTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGtt > 1:2182206/1‑101 (MQ=255)
tctcCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTc > 2:3165380/1‑101 (MQ=255)
ctcCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCa < 1:4513588/101‑1 (MQ=255)
ctcCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCa > 2:244964/1‑101 (MQ=255)
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ccGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCAcc > 1:2274072/1‑101 (MQ=255)
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gAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGa > 1:5473688/1‑101 (MQ=255)
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cgcAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGaa < 2:859526/101‑1 (MQ=255)
aGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAAct < 2:2134072/101‑1 (MQ=255)
aGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAAct > 1:1662439/1‑101 (MQ=255)
gtcgCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAActct < 2:1091075/98‑1 (MQ=255)
gTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAActct < 1:1862173/101‑1 (MQ=255)
ttGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACtctc > 2:3293449/1‑101 (MQ=255)
tGCAGCCCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTcc < 2:5515776/101‑1 (MQ=255)
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aGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTa < 2:5565638/101‑1 (MQ=255)
aGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTa < 1:4837060/101‑1 (MQ=255)
aGACCTTCCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTa < 1:3401347/101‑1 (MQ=255)
gcccTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGGCCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAg < 2:3853045/99‑1 (MQ=255)
aCCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGt < 1:507869/101‑1 (MQ=255)
cTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTgg > 1:842421/1‑101 (MQ=255)
ttGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAGTGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGc < 2:1176676/101‑1 (MQ=255)
ttGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGc > 2:4369187/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGcc > 1:347285/1‑101 (MQ=255)
gccgccATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCg > 2:5161080/1‑101 (MQ=255)
gccgccATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCg > 2:231802/1‑101 (MQ=255)
cgccATTGGCGAAGCTGCGCCCCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGa < 1:3231274/101‑1 (MQ=255)
cATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCg > 1:4700711/1‑101 (MQ=255)
cATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCg > 1:3352986/1‑101 (MQ=255)
cATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCg > 2:3031735/1‑101 (MQ=255)
aTTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGa > 1:3956338/1‑101 (MQ=255)
tGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGAcc < 2:308480/101‑1 (MQ=255)
ggCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGAccc < 2:2105784/101‑1 (MQ=255)
ggCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGAccc > 1:2068061/1‑101 (MQ=255)
gCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGACCCg < 2:3132203/101‑1 (MQ=255)
||
CATTCGGTGCGCTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAACGTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGACCCG > NC_014034/1951433‑1951623
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|