Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_014034 | 2,177,289 | 2 bp→AT | 100% | coding (87‑88/990 nt) | rbsB ← | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 2,177,289 | 0 | T→A | 100.0% | 841.7 | 220 | T30S (ACA→TCA) | rbsB | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (123/95): ref base (0/0): total (124/96) | ||||||||||
* | NC_014034 | 2,177,290 | 0 | A→T | 100.0% | 818.4 | 215 | C29* (TGT→TGA) | rbsB | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (121/93): ref base (0/1): total (121/94) |
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
CATAGGTCGAGGGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.A..GGGTTG..GTCGGTCTT.GTGTACAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.AGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.GGCAGAGG.CCCCAACAGGGCCAG.TTGCGCATC > NC_014034/2177202‑2177374
||
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aTAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAgg > 1:4687733/1‑101 (MQ=255)
tAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGc > 2:3298997/1‑101 (MQ=255)
ggTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGccc < 1:5657943/101‑1 (MQ=255)
gTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGcccc > 1:1483199/1‑101 (MQ=255)
cGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCgg > 2:1983599/1‑101 (MQ=255)
cGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCgg > 1:1092536/1‑101 (MQ=255)
agCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTc > 1:1874264/2‑101 (MQ=255)
agCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTc > 1:241213/2‑101 (MQ=255)
aCCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGc > 1:2021561/1‑101 (MQ=255)
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cAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCg < 2:1806747/101‑1 (MQ=255)
cAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCg < 2:5563726/101‑1 (MQ=255)
cAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCg > 1:5436352/1‑101 (MQ=255)
cAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCg > 2:4480119/1‑101 (MQ=255)
cAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCg > 1:3238960/1‑101 (MQ=255)
agtgccATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.a > 1:542127/5‑101 (MQ=255)
gCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aa < 1:4913284/101‑2 (MQ=255)
gCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aa < 2:1094928/101‑2 (MQ=255)
gCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aa > 1:3779711/1‑100 (MQ=255)
ccccATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aag < 1:801130/101‑3 (MQ=255)
ccATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aagcc < 1:5116068/101‑5 (MQ=255)
ccATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aagcc < 1:1690589/101‑5 (MQ=255)
ccATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aagcc < 1:2574211/101‑5 (MQ=255)
cATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aagccg < 2:223261/101‑6 (MQ=255)
cATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aagccc > 2:5720008/1‑96 (MQ=255)
ctcGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGccc < 1:1195955/101‑1 (MQ=255)
ctcGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGccc < 2:773897/101‑1 (MQ=255)
cGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCg > 1:3836031/1‑101 (MQ=255)
ggTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCgg > 1:648771/1‑101 (MQ=255)
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gTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGc > 1:4589122/1‑101 (MQ=255)
gTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGc < 2:4837739/101‑1 (MQ=255)
tCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGcc > 2:5169481/1‑101 (MQ=255)
cGCCTTTGCCGAAGTACCTTCCTTCATCTTGACGAAAGAG.GGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCa < 2:3825661/101‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAg > 2:763129/1‑101 (MQ=255)
gCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAg > 1:1784363/1‑101 (MQ=255)
ccTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAgc < 2:3218585/101‑1 (MQ=255)
cTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGACCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAgcg > 1:5569997/1‑101 (MQ=255)
tttGCCGATGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAgcgc > 1:951457/1‑101 (MQ=255)
tGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCgg < 1:1707758/101‑1 (MQ=255)
tGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCgg > 1:676645/1‑101 (MQ=255)
gCCGAAGCACCTTCCTTCGTCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGGCAGCGCGGa > 2:905712/1‑101 (MQ=255)
gCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGa < 2:4254804/101‑1 (MQ=255)
ccGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaa < 2:5415603/101‑1 (MQ=255)
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gAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaaaa > 1:4411750/1‑101 (MQ=255)
aaGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaaacc > 2:1633183/1‑99 (MQ=255)
aaGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAAc > 1:4824184/1‑101 (MQ=255)
aaGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAAc > 1:4092636/1‑101 (MQ=255)
aaGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAAc < 2:4095034/101‑1 (MQ=255)
gCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGc > 2:4645383/1‑101 (MQ=255)
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cttccttcATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.gg > 1:2440965/1‑101 (MQ=255)
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cATCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAgg > 2:5065912/1‑101 (MQ=255)
aTCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGG.c > 2:2590773/1‑101 (MQ=255)
aTCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGG.c > 2:3694177/1‑101 (MQ=255)
aTCTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGG.c > 1:594642/1‑101 (MQ=255)
tCTTGACGAAA.AGGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGG.cc > 1:3133628/1‑101 (MQ=255)
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cTTGACGAAA.AAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGG.cac > 1:2147781/1‑99 (MQ=255)
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ggggttggtgtcggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCa > 1:2073555/10‑101 (MQ=255)
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ggtgtcggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.tttgc < 2:3447890/98‑4 (MQ=255)
gtgtcggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.tttgcg < 1:3976571/99‑5 (MQ=255)
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tgtcggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.tttgcgc < 2:1483106/100‑6 (MQ=255)
gtcggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGca > 1:1279570/1‑101 (MQ=255)
tcggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGcat < 2:5316771/101‑1 (MQ=255)
tcggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGcat > 2:550471/1‑101 (MQ=255)
tcggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGcat > 2:367022/1‑101 (MQ=255)
tcggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.tttgagcat > 1:2804273/1‑94 (MQ=255)
cggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGcatc > 1:1369569/1‑101 (MQ=255)
||
CATAGGTCGAGGGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAA.A..GGGTTG..GTCGGTCTT.GTGTACAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.AGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.GGCAGAGG.CCCCAACAGGGCCAG.TTGCGCATC > NC_014034/2177202‑2177374
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|