| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,751,840 | +C | 94.2% | intergenic (+169/‑189) | RCAP_rcc01619 → / → aldB | Fis family transcriptional regulator/aldehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,751,840 | 1 | .→C | 94.2% | 10.7 ‑3.0 ‑1.1 | 104 | intergenic (+169/‑189) | RCAP_rcc01619/aldB | Fis family transcriptional regulator/aldehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (73/25): ref base (2/4): total (75/29) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.96e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.58e-02 | ||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
ATAAAGGATAAGGCGCTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCACGCGAGGGGGGCA.GA.G.C.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGAAACAGGTCAGCCATAAC > NC_014034/1751741‑1751934
|
aTAAAGGATAAGGCGCTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGGGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.G.c > 2:1643554/1‑101 (MQ=255)
aaaGGATAAGGCGCTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGTGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.G.c.cc > 1:1382028/1‑101 (MQ=255)
aaaGGATAAGGCGCTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.G.c.cc < 2:1488691/101‑1 (MQ=255)
aaaGGATAAGGCGCTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.G.c.cc > 1:4087905/1‑101 (MQ=255)
aaaGGATAAGGCGCTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGATGAGGCGCAGCCGAGGGTGGCA.GA.G.c.cc > 2:1781086/1‑101 (MQ=38)
aaGGATAAGGCGCTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.G.c.cc.c > 2:2674394/1‑101 (MQ=255)
aGGATAAGGCGCTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.G.c.cc.cc > 1:365886/1‑101 (MQ=255)
ggATAAGGCGCTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.G.c.cc.ccc > 1:1966882/1‑100 (MQ=255)
ggATAAGGCGCTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.G.c.cc.ccc > 1:3580656/1‑100 (MQ=255)
gATAAGGCGCTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.G.c.cc.ccca > 1:856564/1‑99 (MQ=255)
aGGCGCTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.G.C.CCACCAGAcc > 2:3996744/1‑101 (MQ=38)
ggCGCTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGAccc > 1:4066855/1‑101 (MQ=38)
ggCGCTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGAccc < 2:884781/101‑1 (MQ=37)
gcgcTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGAcccc < 1:1245533/101‑1 (MQ=37)
cgcTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCg > 2:2765689/1‑101 (MQ=38)
cTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGcc > 1:3643724/1‑101 (MQ=38)
tCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCt > 1:2172953/1‑101 (MQ=38)
tCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCt > 2:2286789/1‑101 (MQ=38)
tCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCt > 1:1132992/1‑101 (MQ=38)
tCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCt < 2:525595/101‑1 (MQ=37)
tCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCt < 2:956625/101‑1 (MQ=37)
gCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCg > 1:2048101/1‑101 (MQ=38)
aaGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGAc > 2:1532273/1‑101 (MQ=38)
aaGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGAc > 2:2754421/1‑101 (MQ=38)
aaGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGAc > 2:3344748/1‑101 (MQ=38)
aGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGAcc > 1:3910842/1‑101 (MQ=38)
gggCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGAccc > 1:2266502/1‑101 (MQ=38)
ggCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGAcccc > 2:1301820/1‑101 (MQ=38)
ggCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGAcccc < 1:4142757/101‑1 (MQ=37)
gcCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCcgcg > 1:2147093/1‑101 (MQ=38)
gcCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCcgcg > 2:140405/1‑101 (MQ=38)
ttcttcCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGAGatcggaagagc > 1:1086412/1‑91 (MQ=25)
cttcCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCgccgcc > 2:3797527/1‑101 (MQ=38)
cttcCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCgccgcc < 2:3951734/101‑1 (MQ=37)
ttcCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCt > 1:2973926/1‑101 (MQ=38)
tcCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCtt > 2:1331095/1‑101 (MQ=38)
tcCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCtt > 2:4056437/1‑101 (MQ=38)
tcCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCtt < 1:3667302/101‑1 (MQ=37)
ccATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGGGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCttt > 1:557713/1‑101 (MQ=37)
aTTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTAc > 1:1113801/1‑101 (MQ=38)
aTTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTAc > 2:3637184/1‑101 (MQ=37)
tttCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACg < 1:637932/101‑1 (MQ=37)
tttCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACg > 1:2567798/1‑101 (MQ=38)
ccGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAAt > 2:528113/1‑101 (MQ=37)
ccGACTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAAt > 2:3586807/1‑101 (MQ=37)
cGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCC.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCCGCGAACCCGCGCCGCCCTTCCGaagt > 2:1450838/1‑99 (MQ=25)
gCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAAttt > 2:3449185/1‑101 (MQ=38)
gCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAAttt > 1:2629930/1‑101 (MQ=38)
cccTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAAttt < 1:1102715/100‑1 (MQ=37)
ccTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAAtttt < 1:1376323/101‑1 (MQ=37)
tttCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGc > 1:87972/1‑101 (MQ=37)
tttCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGc > 1:360953/1‑101 (MQ=37)
cccccccTCGCCCCAAAGGGCCGGGGGGGGGGGGCGCAGCCGGGGGGGCCACCC.C.C.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGc < 1:2765908/96‑1 (MQ=255)
ttCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGGA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCg > 2:2922023/1‑101 (MQ=37)
ttCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGca > 1:1598262/1‑100 (MQ=37)
cACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGAt > 1:979761/1‑101 (MQ=37)
cACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.G.CGCC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAACTTTGCGag > 2:2554703/1‑100 (MQ=37)
aCCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGAtg > 1:1558897/1‑101 (MQ=37)
ccTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGAtgc > 1:3419429/1‑101 (MQ=38)
cTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGTA.GAGG.C.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGAtgct > 1:979729/1‑101 (MQ=38)
ttGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGAtgctg < 1:2152795/101‑1 (MQ=38)
ttGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGAtgctg > 2:2066777/1‑101 (MQ=38)
gCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGGCTTTACGAATTTTGCGATgctgca > 2:3881872/1‑101 (MQ=37)
cccAAATATCCGGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATgctgcagc < 1:1984827/101‑1 (MQ=38)
cccAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATgctgcagc < 2:2741769/101‑1 (MQ=38)
ccAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATgctgcagct > 2:4185943/1‑101 (MQ=38)
cAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATgctgcagctg < 1:289477/101‑1 (MQ=38)
aaaTATCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATgctgcagctgc > 2:3520288/1‑101 (MQ=38)
atatCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCAc > 1:2306666/1‑101 (MQ=38)
gttCCGGGGGGGGGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.G.CGGC.CCAGCCCCCGCCTGCGGCCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCAcc < 1:1666549/99‑1 (MQ=255)
ttCCCGGGGGGTGAGGCCCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCt < 2:3173609/100‑1 (MQ=38)
tCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTg > 2:3949475/1‑101 (MQ=39)
tCCCGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTg < 1:914254/101‑1 (MQ=39)
cccGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCCCCTGt > 2:2001289/1‑101 (MQ=38)
cGGGGGGTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGtct < 1:749770/101‑1 (MQ=255)
ggggggTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGAGCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGtctc > 2:3626202/1‑101 (MQ=255)
ggggggTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGtctc > 2:3043523/1‑101 (MQ=255)
ggggggTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGtctc > 1:2336100/1‑101 (MQ=255)
gggggTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCg > 1:2026579/1‑101 (MQ=255)
ggggTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCgg > 1:3955944/1‑101 (MQ=255)
gggTGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.AA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGc > 2:380560/1‑101 (MQ=255)
gggGGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GATC.C.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGc < 1:1769199/101‑1 (MQ=255)
tGAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGt > 1:3464067/1‑101 (MQ=255)
gAGGCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTg > 2:1679927/1‑101 (MQ=255)
aGGCGCAGCCGGGGGGGGCA.GACC.C.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGa < 2:1981308/101‑1 (MQ=255)
ggCGCAGCCGAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGaa < 2:3507316/101‑1 (MQ=255)
cgcagccgAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGAAAc > 2:845726/7‑101 (MQ=255)
cgcagccgAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGAAAc > 1:3137865/7‑101 (MQ=255)
gcagccgAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGAAACa > 2:515355/6‑101 (MQ=255)
agccgAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGAAACCgg > 2:2149744/4‑101 (MQ=255)
ccgAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGAAACAGGTc > 1:2546233/2‑101 (MQ=255)
cgAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGAAACAGGTCa > 2:3556263/1‑101 (MQ=255)
cgAGGGGGGCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGAAACAGGTCa > 1:2319336/1‑101 (MQ=255)
gggggCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGAAACAGGTCAGCCa > 1:2989519/1‑101 (MQ=255)
gggcCA.GA.GCC.CC.CCAGCCCCCGCCTGCGCCCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGAAACAGGTCAGCCAt < 2:768384/101‑1 (MQ=255)
gggCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGAAACAGGTCAGCCATa > 1:547417/1‑101 (MQ=255)
gggCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGAAACAGGTCAGCCATa < 1:2849523/101‑1 (MQ=255)
ggCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGAAACAGGTCAGCCATaa > 2:3733424/1‑101 (MQ=255)
gCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGAAACAGGTCAGCCATAAc > 2:380002/1‑101 (MQ=255)
gCA.GA.GCC.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGAAACAGGTCAGCCATAAc > 1:3332230/1‑101 (MQ=255)
|
ATAAAGGATAAGGCGCTCCGCAAGGGCGCCTTCTTCCATTTCCGCCTTTCACCTTGCCCCAAATATCCCGGGGGGTGAGGCGCACGCGAGGGGGGCA.GA.G.C.CC.CCAGACCCCGCCTGCGACCCCGCGCCGCCTTTACGAATTTTGCGATGCTGCAGCTGCACCTGTCTCGGCAGTGAAACAGGTCAGCCATAAC > NC_014034/1751741‑1751934
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 17 ≤
ATCG
< 25 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|