| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 3,504,122 | +G | 2.0% | intergenic (‑15/+68) | recO ← / ← RCAP_rcc03309 | DNA repair protein RecO/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 3,504,122 | 1 | .→G | 2.0% | 4.4 ‑4.0 ‑0.1 | 202 | intergenic (‑15/+68) | recO/RCAP_rcc03309 | DNA repair protein RecO/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (4/0): ref base (71/127): total (75/127) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.81e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 7.49e-01 | ||||||||||
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
TGCGTGGCCGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGCGT > NC_014034/3504022‑3504222
|
tGCGTGGCCGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCTTGGTGCCCGTGACGaa < 1:3700249/101‑1 (MQ=255)
tGCGTGGCCGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGGGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGCCGaa > 1:1282492/1‑101 (MQ=255)
gCGTGGCCGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.g < 1:3517952/101‑1 (MQ=255)
cGTGGCCGTGAACGCCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.gg < 2:3363509/101‑1 (MQ=255)
cGTGGCCGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.ga > 1:275859/1‑100 (MQ=255)
tGGCCGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.cc > 1:2742504/1‑101 (MQ=255)
ggCCGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.gggcc > 1:1894058/1‑98 (MQ=255)
ggCCGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGGGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGGGCCCGTGACGAA.GG.CC..g > 1:2649062/1‑101 (MQ=255)
cGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.GC..gggg > 1:3875852/1‑101 (MQ=255)
gTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.GC..ggggg > 1:2680237/1‑101 (MQ=255)
gTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..ggggg < 2:3494807/101‑1 (MQ=255)
aaCACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.GC..gggggggt > 1:253244/1‑98 (MQ=255)
aaCACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGgtt > 2:1018641/1‑101 (MQ=255)
cacCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTg < 2:1500213/101‑1 (MQ=255)
ccTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGGGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCa > 2:709814/1‑101 (MQ=255)
tCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCAcc > 2:2676100/1‑101 (MQ=255)
tCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGAGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCAcc > 2:4133117/1‑101 (MQ=255)
cGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGCGCCGCTGTCTTGCCAGTCAATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..cggggggttttcccc > 1:616837/1‑91 (MQ=255)
aCAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCAccccc < 1:3037053/101‑1 (MQ=255)
cAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCg < 2:580349/101‑1 (MQ=255)
cAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGGAcccccc > 2:4036435/1‑100 (MQ=255)
aaTCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GGCCC..GGGGGTTTTG.ACCCCCgg > 1:241072/1‑101 (MQ=255)
aTCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.GC..GGGGGGTTTGGACCCCCcgg > 2:3686260/1‑101 (MQ=255)
tCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCTCCCCCGGGc < 2:1129270/101‑1 (MQ=255)
tCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGc < 1:293122/101‑1 (MQ=255)
tCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGc < 1:3916594/101‑1 (MQ=255)
cGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCCACCCCGGGcc > 2:2012932/1‑101 (MQ=255)
gCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCa < 1:3300486/101‑1 (MQ=255)
gCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCa < 2:825745/101‑1 (MQ=255)
cTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAg < 1:3831690/101‑1 (MQ=255)
tttCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAAGGG.CCGGGGGGGTTTTGC.CCCCCGGCcccccccg > 1:2168037/1‑98 (MQ=255)
tttCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAgg < 1:2792607/101‑1 (MQ=255)
tttCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAgg < 1:574435/101‑1 (MQ=255)
tttCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCGGGCCCCCCCAgg > 1:1400033/1‑101 (MQ=255)
tttCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCCGGCCCCCGCAgg > 2:624975/1‑101 (MQ=255)
tttCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..CGGGGGTTTGCACCCCCCGGccccccccgg > 1:697409/1‑96 (MQ=255)
ttCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGa < 2:50637/101‑1 (MQ=255)
ttCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGa < 1:436550/101‑1 (MQ=255)
tCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGat < 1:2849811/101‑1 (MQ=255)
tCGCCCTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGat < 2:115479/101‑1 (MQ=255)
gCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGatat < 1:1018732/101‑1 (MQ=255)
ccGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATAtt < 1:4074324/101‑1 (MQ=255)
ccGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATAtt < 2:1282396/101‑1 (MQ=255)
cGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAAGGG.CC..GGGGGGTTTGACCCCCCGGGcccccccggggactt > 2:2327550/1‑91 (MQ=255)
cGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAAGGG.CC..GGGGGGTTTATGCCCCCGGAcccccccccggcatt > 2:38859/1‑91 (MQ=255)
gTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTg < 1:2024718/101‑1 (MQ=255)
gTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCGGGCCCCCCCAGGGTATTTg > 2:1335602/1‑101 (MQ=255)
aGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGc < 1:4197411/101‑1 (MQ=255)
aGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTTGACCCCCAGGCCCCCGCCGGGTTttttatgc > 2:1115108/1‑96 (MQ=255)
cGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAg < 1:1897558/101‑1 (MQ=255)
cGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAg > 2:359227/1‑101 (MQ=255)
gggTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGa < 2:2205181/101‑1 (MQ=255)
gggTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGa < 1:3081041/101‑1 (MQ=255)
ggTCGAAAGGGTGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CG..GGGGTTTTTCCACCCCCGGGCCCCGGGAGGATATTTGAGGCAAGAt < 2:1552121/101‑1 (MQ=255)
ggTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAt < 2:1126887/101‑1 (MQ=255)
ggTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAt > 2:1739379/1‑101 (MQ=255)
tCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.aa < 2:2742298/101‑1 (MQ=255)
tCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.aa < 1:1335702/101‑1 (MQ=255)
cGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCCGGATATTTGAGGCAAGAT.aaa > 2:2816003/1‑101 (MQ=255)
gAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTTAGGCAAGAT.aaaa > 2:3204277/1‑101 (MQ=255)
aaaGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CCG.GGGGGTTTTTACCCCCCGGGCCCCCCCGGGAGATTTG.GGGAAGAG.aaaaa > 1:3847951/1‑100 (MQ=255)
aaGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAA.AAAAGc > 1:2011075/1‑101 (MQ=255)
aaGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCCGGGCCCCCCAGGGGATTTGGGGCAAGAT.aaaaaa > 1:1062771/1‑99 (MQ=37)
aGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCg < 1:2993196/101‑1 (MQ=255)
aTGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGaaa < 2:1292620/101‑1 (MQ=255)
aTGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGaaa < 2:285528/101‑1 (MQ=255)
aTGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGaaa < 2:1733834/101‑1 (MQ=255)
ggTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGc < 2:253199/101‑1 (MQ=255)
ggTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGc < 2:2396261/101‑1 (MQ=255)
gTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGcc < 1:2893230/101‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCg < 1:3923689/101‑1 (MQ=255)
gCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCgg > 2:3992311/1‑101 (MQ=255)
gCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCGGGGTATTTGGGGGAAGGT.AAAAGCGAAAGCCgg > 2:3432827/1‑101 (MQ=255)
cGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCgggg < 2:2480557/101‑1 (MQ=255)
gCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGt > 2:2648165/1‑101 (MQ=255)
cTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTTCACCCCCCGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCgggggc > 1:3379711/1‑99 (MQ=255)
cTGTCTTGCCAGTCCATGGAGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTc < 1:4133379/101‑1 (MQ=255)
tGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCa < 1:3562282/101‑1 (MQ=255)
tGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCa < 1:1772740/101‑1 (MQ=255)
tGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCa < 1:540680/101‑1 (MQ=255)
tGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCa < 1:173801/101‑1 (MQ=255)
gTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTTCACCCCCGGGCCCCCCCAGGATATTTGAGGGAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGGCAg > 2:906624/1‑101 (MQ=38)
gTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTTCACCCCCCGGCCCCCCCCGGATATTTTAGGCAAGAA.AAAAACGAAAACCggggggag > 2:1032745/1‑97 (MQ=255)
ttGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGGTATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCt > 2:3952272/1‑101 (MQ=255)
tGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GGCCC..GGGGGTTTTTACCCCCCCGGCCCCCCCGGGA.ATTTTTGGGGAGATAAAAAGGGAAACCCggggcaggctt > 2:139002/1‑94 (MQ=255)
tGCCAGTCCATGGTGCCCGTAACGAA.CG.CG..GGGGGTTTTGAGCCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCtt < 2:731253/101‑1 (MQ=37)
ccAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTc < 2:3101262/101‑1 (MQ=255)
ccATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCGCCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTcc < 1:1186780/101‑1 (MQ=255)
tGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCACTCCGTc < 2:1893938/101‑1 (MQ=255)
ggTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGTT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCt > 1:2093504/1‑101 (MQ=255)
ggTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCt < 1:1545616/101‑1 (MQ=255)
gTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCtt < 2:3830672/101‑1 (MQ=255)
tGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCCCCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTc < 1:1122896/101‑1 (MQ=255)
ccGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATc < 2:915283/101‑1 (MQ=255)
cGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATcc < 1:222039/101‑1 (MQ=255)
cGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAACCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATcc < 1:3782630/101‑1 (MQ=255)
tGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAg < 2:2940279/101‑1 (MQ=255)
tGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAg > 2:3253972/1‑101 (MQ=255)
gACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGa < 1:4024783/101‑1 (MQ=255)
a.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGCGt > 2:439847/1‑101 (MQ=255)
|
TGCGTGGCCGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAT.AAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGCGT > NC_014034/3504022‑3504222
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 24 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|