New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_014034 221986 =781 (6.470)3 (0.020) 2/114 23.8 0.01 coding (671/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
?NC_014034 = 222068 262 (1.240)coding (589/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
Rejected: Position hash score below cutoff.

Only 100 of 1623 total aligned reads displayed.

TTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTC  >  NC_014034/221886‑222086
                                                                                                    |                                                                                                    
  cGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                                                    <  2:1849057/101‑1 (MQ=255)
   ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggcccg                                                                                                   <  1:3507192‑M1/34‑1 (MQ=255)
      gtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGgatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                                                                                >  2:3047793/1‑101 (MQ=255)
       ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtggg                                                                                               <  2:2555344‑M1/38‑1 (MQ=255)
         gtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggat                                                                                             >  1:1837309‑M1/62‑101 (MQ=255)
          tccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                                            >  1:3453115‑M1/61‑101 (MQ=255)
               cggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcg                                                                                       <  1:3696446‑M1/46‑4 (MQ=255)
                   gTCGCCGGATCGCCCTCATCGACGGTGGGCGTCTGATGCGTGGGCCCGGTCGGCTCGGCGGGGACCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGCCCGGTGGGGTc                                                                                   >  2:2105700/1‑101 (MQ=255)
                    cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggggcc                                                                                  <  1:3969894‑M1/51‑5 (MQ=255)
                    cgggcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                  >  2:2014455‑M1/51‑101 (MQ=255)
                     ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCg                                                                                 <  1:3317356‑M1/52‑1 (MQ=255)
                     cgtcggctccgtgggatcggtcggccccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                 >  2:3696192‑M1/50‑101 (MQ=255)
                       ccGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATACGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                               <  1:3628306/101‑1 (MQ=255)
                        cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                              <  1:3767340‑M1/55‑1 (MQ=255)
                         gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                             <  1:390267‑M1/56‑1 (MQ=255)
                          ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                                            <  1:1005158‑M1/57‑1 (MQ=255)
                             ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                         >  1:2807912‑M1/42‑101 (MQ=255)
                              cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                        <  1:3101380‑M1/61‑1 (MQ=255)
                                  ggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                    >  2:413584‑M1/37‑101 (MQ=255)
                                   gatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg                                                                   >  2:3101150‑M1/36‑101 (MQ=255)
                                      ctgtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                >  2:1271196‑M1/33‑101 (MQ=255)
                                      cggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                <  2:1574888‑M1/69‑1 (MQ=255)
                                      cggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                <  1:114800‑M1/69‑1 (MQ=255)
                                       ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                               <  1:2861009‑M1/70‑1 (MQ=255)
                                       ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                               <  1:2673768‑M1/70‑1 (MQ=255)
                                        gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                              <  1:959983‑M1/71‑1 (MQ=255)
                                         cGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                             <  2:615902/101‑1 (MQ=255)
                                            ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                          >  2:441313‑M1/27‑101 (MQ=255)
                                             gtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                         >  1:1546777‑M1/26‑101 (MQ=255)
                                              ggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                        <  1:2052160/101‑1 (MQ=255)
                                                gttCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                      <  2:327056/99‑1 (MQ=255)
                                                 gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                     >  2:555087‑M1/22‑101 (MQ=255)
                                                  tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGCATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                    >  2:2261477‑M1/21‑101 (MQ=255)
                                                      gtcagTGGGGTCGGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                                                <  1:2746347/97‑1 (MQ=14)
                                                        cggtcgggtcggtcggGTCAGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCTGTCGGTTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                              <  2:1188742/93‑1 (MQ=11)
                                                        cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                              <  2:3617721‑M1/87‑1 (MQ=255)
                                                          gtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGATCCGt                                            <  2:3526656‑M1/89‑1 (MQ=255)
                                                          gtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatcctg                                            <  2:1922922‑M1/89‑3 (MQ=255)
                                                                gcggtcggGTCGGTCGGGTCCGTCGGATGGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                      <  1:1691468/100‑1 (MQ=14)
                                                                 tcgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                     <  2:1031411/96‑1 (MQ=11)
                                                                 ccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                     <  1:2928699/99‑1 (MQ=11)
                                                                 ccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTCGGTtcg                                     >  1:1391943/3‑101 (MQ=11)
                                                                   ggcggCTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGCGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                   <  1:904675/99‑1 (MQ=11)
                                                                    tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggtc                                  <  1:1765829‑M1/99‑1 (MQ=255)
                                                                    tgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                  >  1:643782‑M1/3‑101 (MQ=255)
                                                                    ggGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                  >  2:4011815‑M1/3‑101 (MQ=255)
                                                                    ggGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                  >  1:2346353‑M1/3‑101 (MQ=255)
                                                                     ggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGCtcggtcg                                 >  2:2173624/8‑101 (MQ=14)
                                                                     gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTgggcgctcgag                                 >  1:248344/2‑93 (MQ=11)
                                                                     gggagcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                 <  2:2906956/100‑1 (MQ=14)
                                                                      tgagcgtgcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg                                <  2:2850349/93‑1 (MQ=11)
                                                                      gggtcggtcgggtcgggcggaccggtggagtccgtgggcTCGGTTGGGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                <  1:4155478/98‑1 (MQ=0)
                                                                      ggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggccgg                                >  2:1766888/1‑101 (MQ=11)
                                                                      ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                <  1:2204152/101‑1 (MQ=11)
                                                                       gagctgtcgggtccgtgggattgggcgggtccgtgggatcgGTCGGAGCCGTGGGATCGGTTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtggga                               <  1:436496/96‑2 (MQ=11)
                                                                        gtcggttgggtccgtgggatcgggcgggtccgtcggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                              <  1:3142584/100‑1 (MQ=11)
                                                                        atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGAgccgtcggaa                              >  2:2459118/1‑99 (MQ=11)
                                                                        atcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGCCGGGt                              >  2:817408/1‑101 (MQ=11)
                                                                          cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGGGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                            >  1:816465/1‑101 (MQ=11)
                                                                          cgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc                            <  1:1316212/101‑1 (MQ=11)
                                                                           ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggctCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCGGCGTGGTCGGTCGGATCCGTGGGCtcgcggggcgcgg                           >  2:741676/1‑91 (MQ=9)
                                                                           ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGCGATCGGTCGGATcag                           >  2:3857848/1‑99 (MQ=14)
                                                                           ggtcgggtcagtgggatcgctcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                           <  1:2401164/101‑1 (MQ=14)
                                                                           cgccgcgtccgtggcatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                           <  2:3379864/95‑1 (MQ=11)
                                                                            gtcgtggccgtgggatctgtcggatccgtgggatcgGTCGGAGCCGTGGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                          <  2:1667000/101‑1 (MQ=11)
                                                                            gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGACCGGTCGGATCCGt                          >  1:2606507/1‑101 (MQ=11)
                                                                             tcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGCTCGGCTCCGtg                         >  1:737430/1‑100 (MQ=11)
                                                                              tgtttccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                        >  2:3159980‑M2/5‑99 (MQ=255)
                                                                              gggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGAGGGATCGGTGGAGGCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGACCGGTCGGGTCCgggg                        >  2:904590/5‑98 (MQ=11)
                                                                              cgggtccgtgggatcggtcggttccgtgggatcggtCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGtgg                        <  2:2964316/101‑3 (MQ=11)
                                                                              cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATAGGTCGGATCCGtgg                        >  2:3939404/1‑99 (MQ=14)
                                                                              cggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                        >  2:1334545‑M2/1‑99 (MQ=255)
                                                                              cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGCGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGtgg                        >  1:2125657/1‑99 (MQ=11)
                                                                                ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTgggg                      <  2:3782412‑M2/101‑5 (MQ=255)
                                                                                ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgGGTCCGTGGGATCGGTCGCGTCCGAGGGGTCGGTCGGGTACGCGGGTTCGGTCGCGTCCGtggac                      >  1:1974556/1‑97 (MQ=11)
                                                                                 gtccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                     <  1:3840941/101‑1 (MQ=11)
                                                                                  tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                    >  2:2388423‑M2/1‑95 (MQ=255)
                                                                                  tccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                    <  2:2775555/101‑1 (MQ=11)
                                                                                   ccgtgggatcggtcgggtccttgcgatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                   <  2:2666793/101‑1 (MQ=11)
                                                                                   ccgtgggagcgttcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                   <  2:1428986/101‑1 (MQ=11)
                                                                                    cgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGCTCGGGCGGGTCCGTGGGTtcgg                  >  1:585646/1‑101 (MQ=11)
                                                                                    cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgg                  <  2:2611639‑M2/101‑9 (MQ=255)
                                                                                       gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg               <  1:16241‑M2/101‑12 (MQ=255)
                                                                                       gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg               <  1:3237751‑M2/101‑12 (MQ=255)
                                                                                       gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg               <  1:3003714‑M2/101‑12 (MQ=255)
                                                                                          gtcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt            <  1:227749/100‑1 (MQ=11)
                                                                                          atcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggc            >  2:2314216/1‑100 (MQ=11)
                                                                                            cggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGTATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc          <  1:3577692/101‑1 (MQ=11)
                                                                                            cggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc          <  1:1891154‑M2/101‑17 (MQ=255)
                                                                                            cggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc          <  1:1236652‑M2/101‑17 (MQ=255)
                                                                                            cggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtcc          <  1:4067249/101‑1 (MQ=11)
                                                                                             ggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgttgggtccg         >  2:3452863/1‑101 (MQ=14)
                                                                                              gtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgt        <  1:3391082/101‑1 (MQ=11)
                                                                                              ggggggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt        <  1:1069575/98‑1 (MQ=11)
                                                                                               tcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtg       >  1:520738‑M2/1‑82 (MQ=255)
                                                                                                cgggtccgtgggatcggtcggGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCCGATCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtgg      >  1:2557449/1‑99 (MQ=11)
                                                                                                cggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcg      <  2:1105012/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                cggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTCGGATCCgtggggtccgtcg      >  2:668972/1‑101 (MQ=11)
                                                                                                 ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg     <  1:1490982‑M2/101‑22 (MQ=255)
                                                                                                   gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATGGgtcggggcggaggggc   >  2:1503531/1‑91 (MQ=11)
                                                                                                    |                                                                                                    
TTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTC  >  NC_014034/221886‑222086

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 16 ≤  ATCG  < 23 ≤  ATCG  < 31 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG