New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_014034 221965 =518 (3.260)44 (0.280) 11/150 20.2 0.11 coding (692/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
?NC_014034 = 222128 177 (0.840)coding (529/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
Rejected: Position hash score below cutoff.

Only 100 of 1342 total aligned reads displayed.

GCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGG  >  NC_014034/221865‑222065
                                                                                                    |                                                                                                    
     cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcc                                                                                                 >  2:2879017‑M1/87‑101 (MQ=255)
      ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccg                                                                                                <  2:4232343‑M1/16‑1 (MQ=255)
        tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                                                                                              <  1:358068‑M1/18‑1 (MQ=255)
         cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgg                                                                                             <  1:51531‑M1/19‑1 (MQ=255)
          gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtggg                                                                                            >  1:1317539‑M1/82‑101 (MQ=255)
              ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                        <  2:1797649‑M1/24‑1 (MQ=255)
              ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtgggggccgtgggatcg                                                                                        <  2:3682664‑M1/24‑1 (MQ=255)
                gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                                      <  1:306192‑M1/26‑1 (MQ=255)
                gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                                                                                      >  1:3629337‑M1/76‑101 (MQ=255)
                     ttCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                                                                                 >  1:2775774/1‑101 (MQ=255)
                     atcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgagggatcgggcgggg                                                                                 <  2:926618‑M1/31‑2 (MQ=255)
                        ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                                              >  1:2005904‑M1/68‑101 (MQ=255)
                            ggtcccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                                          >  2:3270758‑M1/64‑101 (MQ=255)
                             ggtccgttggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgttggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                                                         >  2:3158695‑M1/63‑101 (MQ=255)
                                 cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                     <  1:3366556‑M1/43‑1 (MQ=255)
                                  gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgt                                                                    <  1:2056041‑M1/44‑7 (MQ=255)
                                  gtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                    >  2:3553307/1‑101 (MQ=255)
                                  gagggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                    <  1:3517480‑M1/44‑1 (MQ=255)
                                    cAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                                  >  1:3468516/1‑101 (MQ=255)
                                      gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGa                                                                >  1:435040‑M1/54‑101 (MQ=255)
                                        gTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                              <  1:2207341/101‑1 (MQ=255)
                                          ggtcggttccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                            >  2:144934‑M1/50‑101 (MQ=255)
                                            tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTg                                                          <  1:2907175‑M1/54‑1 (MQ=255)
                                              gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTggg                                                        >  1:2661015‑M1/46‑101 (MQ=255)
                                               ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                       <  1:1005158‑M1/57‑1 (MQ=255)
                                                ggccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                      >  1:3831136‑M1/44‑101 (MQ=255)
                                                   cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                   >  2:2133639‑M1/41‑101 (MQ=255)
                                                         atcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTcgggc                                             <  1:2271686‑M1/67‑2 (MQ=255)
                                                          tcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                            >  2:2354643‑M1/34‑101 (MQ=255)
                                                           cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                           >  1:3408097‑M1/33‑101 (MQ=255)
                                                             gtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgg                                         <  1:1524937‑M1/71‑2 (MQ=255)
                                                              tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                        >  1:1875513‑M1/30‑101 (MQ=255)
                                                              tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                        >  1:1739817‑M1/30‑101 (MQ=255)
                                                               ggTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                       >  2:3863140/1‑101 (MQ=255)
                                                               cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                       <  2:1095540‑M1/73‑1 (MQ=255)
                                                                   tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTGCGTGGGATCGGTAGGGTCCGTGGGAtc                                   <  2:1035146‑M1/77‑1 (MQ=255)
                                                                    gCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                  >  2:2225189/1‑101 (MQ=255)
                                                                    ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                  >  1:2733267‑M1/24‑101 (MQ=255)
                                                                    ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGAGGGAtcg                                  <  2:1314567‑M1/78‑1 (MQ=255)
                                                                    ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                  <  1:1663322‑M1/78‑1 (MQ=255)
                                                                    ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                  >  2:2451929‑M1/24‑101 (MQ=255)
                                                                    ccgtgggatcgggcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                  >  1:1923048‑M1/24‑101 (MQ=255)
                                                                    ccgagggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                  >  2:1223860‑M1/24‑101 (MQ=255)
                                                                     cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                 <  1:3256378‑M1/79‑1 (MQ=255)
                                                                     cgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                 >  2:3625515‑M1/23‑101 (MQ=255)
                                                                      gtggtgtcagTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                <  2:2536326/92‑1 (MQ=11)
                                                                      gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                >  2:3394741‑M1/22‑101 (MQ=255)
                                                                      gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                >  2:742564/1‑101 (MQ=255)
                                                                      gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                >  1:413635/1‑101 (MQ=255)
                                                                        ggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                              >  1:1604283‑M1/20‑101 (MQ=255)
                                                                        cGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                              >  2:3471668/1‑101 (MQ=255)
                                                                          gatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggacggg                            <  1:644729‑M1/84‑2 (MQ=255)
                                                                              ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCg                        <  2:227739‑M1/88‑1 (MQ=255)
                                                                                tGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgggggcgtc                      >  1:969407/1‑94 (MQ=11)
                                                                                  gggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                    <  2:2060389‑M1/92‑1 (MQ=255)
                                                                                   gatcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTCGGa                   >  1:3679956/3‑101 (MQ=11)
                                                                                    atccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                  <  1:90893‑M1/94‑1 (MQ=255)
                                                                                      ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                <  1:1388315‑M1/96‑1 (MQ=255)
                                                                                      ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                >  1:1149972‑M1/6‑101 (MQ=255)
                                                                                      ccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                <  1:817489/99‑1 (MQ=11)
                                                                                      ccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg                >  2:599597/3‑101 (MQ=11)
                                                                                       gggggggtcggtcgggtccgtggggtcggtggggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccg               <  1:2130583/94‑3 (MQ=11)
                                                                                       cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg               >  1:597509‑M1/5‑101 (MQ=255)
                                                                                        gtgggatcggtcgggtccgtgagatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt              >  1:2404725/4‑101 (MQ=11)
                                                                                        gtcggGTCTGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggg              >  2:2697695/1‑100 (MQ=11)
                                                                                          gGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg            >  2:1524833‑M1/2‑101 (MQ=255)
                                                                                          cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTgagggccgggg            >  2:1943219/1‑91 (MQ=14)
                                                                                           ggttcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg           <  2:1713610/98‑1 (MQ=11)
                                                                                           ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggccgg           >  2:1883038/1‑101 (MQ=11)
                                                                                           ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTCGGAtcgggcgg           >  2:2620904/1‑101 (MQ=11)
                                                                                           ggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGtcggtcgg           >  1:1069037/1‑101 (MQ=11)
                                                                                           ggatcggtcggggccgggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtggg           <  1:3204731/101‑1 (MQ=11)
                                                                                            gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcgGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCggg          >  1:3893164/1‑101 (MQ=11)
                                                                                             gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggaTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGt         <  1:3128428/100‑1 (MQ=11)
                                                                                             gtcggtaggatccgtgggatcggtcgggtcggtgggaTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt         <  2:4023185/100‑1 (MQ=11)
                                                                                             atcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGCCGGGt         >  2:817408/1‑101 (MQ=11)
                                                                                              tctgtcggggccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATc        <  2:3099289/98‑1 (MQ=11)
                                                                                              tcggtgggatccgt.ggatcggtcgggtccgtggggtCGGTCGGGGCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGACGGTCGGGTCCGGGGGGTCGGTCGGGttc       >  2:4104425/1‑99 (MQ=2)
                                                                                              tccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCggggc        >  2:528007/4‑99 (MQ=14)
                                                                                              gcgggcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc        <  1:285684/100‑1 (MQ=11)
                                                                                               ccgtggggtgcgtgggatgggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc       <  1:2340616/96‑1 (MQ=14)
                                                                                                ggtcgggtcggtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCg      <  1:1472334/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCGGTCGGATCCg      >  2:1632933/1‑101 (MQ=14)
                                                                                                ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCCg      >  1:1237739/1‑101 (MQ=11)
                                                                                                ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg      <  1:2598806/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                cgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatagGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTcca      >  2:1350158/2‑100 (MQ=11)
                                                                                                 gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCCCGTAGGATCCGTGGGCTCGGTCGGATCCgg     >  2:2815186/1‑100 (MQ=14)
                                                                                                  tcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGCTCGGCTCCGtg    >  1:737430/1‑100 (MQ=11)
                                                                                                  tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg    >  1:1797768‑M2/1‑100 (MQ=255)
                                                                                                  tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCggggctgtg    >  2:3044153/1‑95 (MQ=11)
                                                                                                  tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg    >  2:654820‑M2/1‑100 (MQ=255)
                                                                                                  tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGtg    >  1:2972139/1‑100 (MQ=11)
                                                                                                  gcgggtccgtcggatcggtcggggccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg    <  1:3764921/100‑2 (MQ=11)
                                                                                                  gcggatctgtgggagcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg    <  1:3963964/100‑2 (MQ=11)
                                                                                                   tgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg   <  1:4058902/100‑3 (MQ=11)
                                                                                                   cgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg   >  1:2552420/1‑99 (MQ=11)
                                                                                                   cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATAGGTCGGATCCGtgg   >  2:3939404/1‑99 (MQ=14)
                                                                                                   cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg   >  2:3776454‑M2/1‑99 (MQ=255)
                                                                                                    gggtcggcggcatcggccgcggccttggggtcggtcGGGTCCGTGGGGGTCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg  <  2:2939148/101‑1 (MQ=2)
                                                                                                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg  <  1:2480104/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                    |                                                                                                    
GCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGG  >  NC_014034/221865‑222065

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 15 ≤  ATCG  < 23 ≤  ATCG  < 31 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG