New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_014034 = 11539880 (0.000)2 (0.010) 2/184 31.5 0.02 coding (352/1065 nt) lspL1 UDP‑glucuronate 5'‑epimerase
?NC_014034 2712979 = 193 (0.910)coding (235/792 nt) RCAP_rcc02524 pyrimidine ABC transporter ATP‑binding protein
Rejected: Position hash score below cutoff.

GCCCCGCTTCGATGCCGTGGCCGACGCCTTCCGCCCCGAGGTGATCGTGCATCTGGCCGCCCAGGCCGGGGTCCGCTACAGCCTGGAAAATCCGCGCGCCTATCTC  >  NC_014034/1153888‑1153993
                                                                                                    |     
gCCCCGCTTCGATGCCGTGGCCGACGCCTTCCGCCCCGAGGTGATCGTGCATCTGGCCGCCCAGGCCGGGGTCCGCTACAGCCTGGAAAATCCGCGCGCCt       >  2:1878936/1‑101 (MQ=32)
  cccGCTTCGTTGCCGTGGCCGACGCCTTCCGCCCCGAGGTGATCGTGCATCTGGCCGCCCAGGCCGGGGTCCGCTACAGCCTGGAAAATCCGCGCGCCTAt     <  1:1519688/101‑1 (MQ=17)
  cccGCTTCGATGCCGTGGCCGACGCCTTCCGCCCCGAGGTGATCGTGCATCTGGCCGCCCAGGCCGGGGTCCGCTACAGCCTGGAAAATCCGCGCGCCTAt     >  2:1436204/1‑101 (MQ=32)
  cccGCTTCGATGCCGTGGCCGACGCCTTCCGCCCCGAGGTGATCGTGCATCTGGCCGCCCAGGCCGGGGTCCGCTACAGCCTGGAAAATCCGCGCGCCTAt     <  2:2713214/101‑1 (MQ=32)
  cccGCTTCGATGCCGTGGCCGACGCCTTCCGCCCCGAGGTGATCGTGCATCTGGCCGCCCAGGCCGGGGTCCGCTACAGCCTGGAAAATCCGCGCGCCTAt     <  2:906562/101‑1 (MQ=32)
    cGCTTCGATGCCGTGGCCGACGCCTTCCGCCCCGAGGTGATCGTGCATCTGGCCGCCCAGGCCGGGGTCCGCTACAGCCTGGAAAATCCGCGCGCCTAtct   >  1:3886735/1‑101 (MQ=32)
    cGCTTCGATGCCGTGGCCGACGCCTTCCGCCCCGAGGTGATCGTGCATCTGGCCGCCCAGGCCGGGGTCCGCTACAGCCTGGAAAATCCGCGCGCCTAtct   <  2:2775834/101‑1 (MQ=32)
     gCTTCGATGCCGTGGCCGACGCCTTCCGCCCCGAGGTGATCGTGCATCTGGCCGCCCAGGCCGGGGTCCGCTACAGCCTGGAAAATCCGCGCGCCTAtctc  >  1:1083298/1‑101 (MQ=31)
     gCTTCGATGCCGTGGCCGACGCCTTCCGCCCCGAGGTGATCGTGCATCTGGCCGCCCAGGCCGGGGTCCGCTACAGCCTGGAAAATCCGCGCGCCTAtctc  >  1:2232555/1‑101 (MQ=31)
     gCTTCGATGCCGTGGCCGACGCCTTCCGCCCCGAGGTGATCGTGCATCTGGCCGCCCAGGCCGGGGTCCGCTACAGCCTGGAAAATCCGCGCGCCTAtctc  >  2:3896276/1‑101 (MQ=31)
                                                                                                    |     
GCCCCGCTTCGATGCCGTGGCCGACGCCTTCCGCCCCGAGGTGATCGTGCATCTGGCCGCCCAGGCCGGGGTCCGCTACAGCCTGGAAAATCCGCGCGCCTATCTC  >  NC_014034/1153888‑1153993

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 20 ≤  ATCG  < 27 ≤  ATCG  < 33 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG