| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 221,994 | 0 | A→G | 14.9% | 227.2 ‑3.0 ‑3.5 | 653 | D221D (GAT→GAC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (43/55): ref base (304/251): total (347/306) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.87e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.29e-04 | ||||||||||
Only 100 of 1658 total aligned reads displayed.
TGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAT > NC_014034/221894‑222094
|
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga < 1:2906970‑M1/39‑1 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggat > 1:1837309‑M1/62‑101 (MQ=255)
tggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGgtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcg > 1:2708375/1‑101 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggg < 2:2660809‑M1/44‑2 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtc > 1:955828‑M1/57‑101 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg < 1:2359247‑M1/47‑1 (MQ=255)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGa > 2:577393‑M1/54‑101 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 1:2846248‑M1/55‑1 (MQ=255)
cGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg > 2:2450178/1‑101 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa < 1:1005158‑M1/57‑1 (MQ=255)
cgcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 2:1913818/1‑101 (MQ=255)
tCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg > 2:3687661/1‑101 (MQ=255)
cggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:1574888‑M1/69‑1 (MQ=255)
ccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 1:2758927‑M1/33‑101 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGa < 2:2061228‑M1/75‑1 (MQ=255)
gatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGGGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGa < 2:1983390‑M1/75‑1 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGgatag < 1:221888‑M1/78‑3 (MQ=255)
gttCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg < 2:327056/99‑1 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg < 1:3867311‑M1/79‑1 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg < 1:902159‑M1/79‑1 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg < 1:2512046‑M1/79‑1 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt < 1:2567273‑M1/80‑1 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 2:3621392‑M1/22‑101 (MQ=255)
gtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt < 1:4025297‑M1/80‑1 (MQ=255)
atccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCGGTGGGAtcggcggggt > 1:1313022/4‑95 (MQ=14)
cggtcgggtcggtcggGTCAGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCTGTCGGTTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:1188742/93‑1 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc > 1:2421040‑M1/15‑101 (MQ=255)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGCTCGGTCGGGTCCGTTGGAtggggcgggccc > 2:2746760/2‑97 (MQ=14)
ccGTGCGATCGGTCGCATTCGTGGGGTCCATCCGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATcg < 2:2606316/100‑2 (MQ=14)
gggttggtcggGTCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgg < 1:2621096/96‑1 (MQ=17)
gggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 1:574884‑M1/92‑1 (MQ=255)
ggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa < 2:1833563‑M1/93‑1 (MQ=255)
gatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa > 2:630054‑M1/9‑101 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGTCGGTAGGAGCCGTGGGAt > 2:3098978/8‑101 (MQ=11)
atccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt > 1:692825‑M1/8‑101 (MQ=255)
gccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:341609/95‑1 (MQ=11)
tcgtgggctcggtccgatccgttggctcggtccggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg < 2:2154157/93‑1 (MQ=11)
ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg > 1:29650‑M1/6‑101 (MQ=255)
ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg > 1:1149972‑M1/6‑101 (MQ=255)
ccggtggagcggtccggcccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg < 2:1089267/96‑1 (MQ=11)
cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtccgtggggtccg < 1:3615139‑M1/97‑6 (MQ=255)
cgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg < 2:1750911/100‑1 (MQ=11)
gtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtcggt > 2:749689/10‑101 (MQ=11)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGCGCGGTCGGATCCGTGGGGtcggg > 2:4181752/4‑100 (MQ=11)
gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 1:2053915/1‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggggccgtgGGGTCCGTCGGATGCGGGGGATCGGTAGGAGCCGTGGGGTGGGTCGGGTCCGTGGGAacggag > 2:3987546/3‑99 (MQ=2)
tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggtc < 1:1765829‑M1/99‑1 (MQ=255)
gggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 1:499849/96‑1 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGCGGGaacagggggg > 2:2960032/1‑92 (MQ=11)
atcggtggggcccgtgggagcggtcgggtccgggggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTTCGTGGGATCGGTCGGGt < 1:3124385/101‑1 (MQ=11)
ccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:1627026/99‑1 (MQ=14)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 1:2302474/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCg > 2:840862/1‑101 (MQ=11)
ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGGCCGGTGGGGTCCGCGGCACCGCTCGGCTCCg > 2:2241074/1‑101 (MQ=1)
ggtcgcgtccgtgcgatcggtcggatccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg < 2:931597/101‑1 (MQ=11)
gctcgggtccttcggatgggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 2:2309744/99‑1 (MQ=11)
cgccgcgtccgtggcatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg < 2:3379864/95‑1 (MQ=11)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt < 1:4213527/101‑1 (MQ=14)
ggcggttccgtcggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt < 2:67801/99‑1 (MQ=14)
tctgggccgtgggggcggtcgggtacgggggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg < 2:3921351/95‑2 (MQ=11)
tcgtgtccgggggatccgtcgggtccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg < 2:3525660/101‑2 (MQ=11)
tcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg > 1:348268/1‑100 (MQ=11)
tgtttccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg > 2:3159980‑M2/5‑99 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg > 2:3776454‑M2/1‑99 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGgg > 2:1661778/1‑101 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggga > 1:3366797‑M2/1‑97 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat < 2:1015105‑M2/101‑6 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat < 1:2133784‑M2/101‑6 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggat > 2:2891090‑M2/1‑96 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggagcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 1:409747/101‑1 (MQ=14)
ggccgtgggatcgggcgggtcggtggggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:3952586/99‑1 (MQ=14)
tccgtgggatcgttcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc > 2:1272684‑M2/1‑95 (MQ=255)
accgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc > 2:2366294‑M2/2‑95 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgg < 1:3059812‑M2/101‑9 (MQ=255)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggg < 1:809076‑M2/101‑10 (MQ=255)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 1:3793247/1‑101 (MQ=11)
ggggatcggtcgggtccgtgggatccgtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:2832539/100‑1 (MQ=14)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcg > 1:1975670/1‑101 (MQ=11)
gatcggtcggatccgtaggatcgggcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtaggg < 1:3257051/101‑1 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTTGGATCGGTCGGGCACGTGGGGTCAgtcgggt > 1:3190876/1‑101 (MQ=11)
tcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGGTCGggcggatc > 2:468449/1‑101 (MQ=11)
cggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc < 1:1891154‑M2/101‑17 (MQ=255)
cggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtggggtcc > 1:1223956/1‑101 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTGGGAGCGgtgggatcg > 2:3035853/1‑100 (MQ=11)
ggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg > 2:4073340/1‑101 (MQ=11)
ggggggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt < 1:1069575/98‑1 (MQ=11)
ccgatctgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGgtcgggtccgtag < 2:1330596/94‑3 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg < 1:373384‑M2/101‑22 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg < 1:1490982‑M2/101‑22 (MQ=255)
gatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGgtcggctccgggggc > 1:1696293/3‑96 (MQ=11)
gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATGGgtcggggcggaggggc > 2:1503531/1‑91 (MQ=11)
tccgggggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtggggtccgtcggatc < 1:1388600/101‑1 (MQ=14)
cgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtggggtcgg < 1:635772‑M2/101‑27 (MQ=255)
cgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcggggccgtcgggtcgg > 1:1553100/1‑99 (MQ=255)
gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt > 2:253771/1‑101 (MQ=11)
gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggt > 1:3553560‑M2/1‑74 (MQ=255)
gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggt > 1:3647280‑M2/1‑74 (MQ=255)
taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGtggggtccgtcggggccggg > 2:3851074/3‑99 (MQ=11)
ggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg < 2:3457229‑M2/101‑31 (MQ=255)
ggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTggg < 2:141761/101‑1 (MQ=14)
|
TGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAT > NC_014034/221894‑222094
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|