| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,033 | 0 | G→C | 6.0% | 165.9 ‑6.2 ‑1.5 | 1428 | T208T (ACC→ACG) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has biased read strand distribution supporting polymorphism. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (24/67): ref base (577/760): total (601/827) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.97e-03 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.97e-02 | ||||||||||
Only 100 of 1895 total aligned reads displayed.
GCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGG > NC_014034/221933‑222133
|
ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg > 1:2607179‑M1/24‑101 (MQ=255)
cgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg > 2:3625515‑M1/23‑101 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt < 2:2627027‑M1/80‑1 (MQ=255)
gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 1:413635/1‑101 (MQ=255)
ggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 1:1604283‑M1/20‑101 (MQ=255)
tccgtggagccgggcggGTCCGCCGGGTGCGTGGGGTGCGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGGGTCCGTCCTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 1:3765108/91‑1 (MQ=2)
ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg < 1:897152‑M1/88‑1 (MQ=255)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 2:330468/101‑1 (MQ=11)
tGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc < 2:3926693/101‑2 (MQ=11)
gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg < 2:1552996/101‑3 (MQ=11)
ggatccggcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg < 2:1482662/93‑1 (MQ=11)
gatcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTCGGa > 1:3679956/3‑101 (MQ=11)
gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt > 2:583376‑M1/8‑101 (MQ=255)
gtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt > 1:1140137/5‑101 (MQ=11)
ccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg > 1:40378/3‑101 (MQ=11)
cgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg > 2:2122250/2‑101 (MQ=11)
tggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtc < 1:3967911/93‑1 (MQ=14)
tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggtc < 1:1765829‑M1/99‑1 (MQ=255)
tccgctcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtc < 2:3987657/96‑1 (MQ=11)
ggggtttgttcggatcggtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:239941/92‑1 (MQ=11)
ggggatcctcggatccgtggggtcgctctgcaccgtgggctccgTAGGTTCCGTCGGATGGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 2:4196523/93‑1 (MQ=2)
cggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgggcg > 2:2479920/1‑101 (MQ=11)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTCGGATCCGAGAGAacggccgg > 2:2336746/1‑101 (MQ=11)
ggatcggtcggggccgggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtggg < 1:3204731/101‑1 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcgGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCggg > 1:3893164/1‑101 (MQ=11)
gatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcgga < 1:1371767/101‑2 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGt > 2:3549605/1‑101 (MQ=11)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc < 2:2200306/101‑1 (MQ=14)
tccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 1:2327748/98‑1 (MQ=14)
tcgttgggtccggcggatccgtcgggtccgtcgggtccgtcGGATCCGTCGGATCTGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:1388215/96‑1 (MQ=11)
gggcgggtccgggggatcgggcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg < 1:3119503/98‑1 (MQ=14)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTCGGATTGGTAGGGTCCGt > 2:1954709/1‑101 (MQ=11)
gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTAGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCTGt > 2:164188/1‑101 (MQ=11)
tcgggtccgtggtatcggtcgggtccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg < 2:3122888/101‑2 (MQ=14)
tcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc < 1:2758331/101‑2 (MQ=11)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg > 2:3776454‑M2/1‑99 (MQ=255)
cgcgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg < 2:306147/98‑3 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 1:512702‑M2/101‑4 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 1:214277‑M2/101‑4 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 2:868614‑M2/101‑4 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga > 2:1179354‑M2/1‑97 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggga > 1:3366797‑M2/1‑97 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga < 1:144958‑M2/101‑5 (MQ=255)
gttcgtgggatccgtggggttcgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 2:1879235/98‑1 (MQ=11)
gtctgttggatcgttctggtccgtttggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtggtat < 2:3470222/101‑6 (MQ=11)
gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 1:3048018/101‑1 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATTCGTGGGATCGGCCGGATTCGTGGGGTCGGTCGGGTTCGTGggttt > 1:3282285/1‑98 (MQ=14)
cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgg < 1:1685018‑M2/101‑9 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGACGGGTCCGTGGGAtcggc > 2:2800112/1‑100 (MQ=11)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAgcggt > 1:2058500/1‑101 (MQ=11)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggg < 1:809076‑M2/101‑10 (MQ=255)
gtcggtcgggtccggggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt < 2:2854237/100‑1 (MQ=11)
tcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGATGGgtgggatc > 2:687594/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccg > 2:640997/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg > 1:2961070/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg > 2:4073340/1‑101 (MQ=11)
ggggggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt < 1:1069575/98‑1 (MQ=11)
tcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtc > 2:2910087/1‑101 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcggGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCCGATCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtgg > 1:2557449/1‑99 (MQ=11)
cggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtcgggtccgtcg > 2:2561610/1‑101 (MQ=11)
cggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcg < 2:1105012/101‑1 (MQ=11)
gggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtcgggtccgtggg > 2:1804251/1‑101 (MQ=11)
ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg < 2:1726255/98‑1 (MQ=255)
atccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGgtcgggtccgtcgggt > 2:1240296/2‑101 (MQ=11)
ccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtcc > 2:2710047/1‑101 (MQ=14)
ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGTATCTGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcg < 1:3617974/101‑2 (MQ=14)
tcggatcggtgggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc < 1:130866‑M2/99‑29 (MQ=255)
taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGtggggtccgtcggggccggg > 2:3851074/3‑99 (MQ=11)
gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcg > 2:102097‑M2/1‑72 (MQ=255)
gggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTggg < 2:20397/95‑1 (MQ=11)
gatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTgggg > 1:1219421/1‑100 (MQ=11)
ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg > 1:2005904‑M2/1‑66 (MQ=255)
gtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 1:2483387/4‑101 (MQ=14)
gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgt > 1:3832867/1‑101 (MQ=11)
tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtg < 1:3486420‑M2/101‑38 (MQ=255)
gATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa < 1:1920778/101‑1 (MQ=11)
aTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggat < 1:3419573‑M2/101‑42 (MQ=255)
gtaggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 1:2896976/4‑101 (MQ=14)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt < 1:239986‑M2/101‑46 (MQ=255)
tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtc > 1:955828‑M2/1‑55 (MQ=255)
tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc < 2:1317375‑M2/101‑47 (MQ=255)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgg < 1:3553635‑M2/101‑49 (MQ=255)
tgggtgggGTCGGTGGGGTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 1:4236402/99‑1 (MQ=14)
tcggtcggGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc > 1:578303‑M2/1‑50 (MQ=255)
ggtcggTGCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg < 2:3227422/101‑1 (MQ=14)
ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg > 1:705827/1‑101 (MQ=14)
gggtgggtccgTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg > 1:641074‑M2/5‑48 (MQ=255)
cgtcggTTCCGTCGGATCCGTCGGATCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg < 2:2271518/100‑1 (MQ=14)
tggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTCGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:3694365/99‑1 (MQ=17)
cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg < 1:2846248‑M2/101‑57 (MQ=255)
gggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg < 2:93981‑M2/101‑58 (MQ=255)
gggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:1532205/101‑1 (MQ=17)
ggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtggga < 1:1005158‑M2/101‑59 (MQ=255)
cGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcgg < 1:2266379‑M2/101‑63 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGTTCCGTGGGCTCCGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt > 2:3404390‑M2/1‑38 (MQ=255)
tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTg > 2:781548/1‑101 (MQ=255)
cggtgggGTCCGTGGTGTTTGTCGGATCCGTGGGGTTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTcgggtcc < 1:1844100/101‑4 (MQ=11)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtcc > 2:2985‑M2/1‑31 (MQ=255)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTcgggtcc < 2:516512/101‑4 (MQ=11)
ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg < 1:2673768‑M2/101‑72 (MQ=255)
|
GCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGG > NC_014034/221933‑222133
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|