| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,048 | 0 | A→G | 1.6% | 30.1 ‑1.5 ‑2.1 | 1412 | D203D (GAT→GAC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (7/18): ref base (580/804): total (589/823) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.19e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 7.95e-03 | ||||||||||
Only 100 of 1894 total aligned reads displayed.
GCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGA > NC_014034/221948‑222147
|
gatcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGa < 1:946131/99‑1 (MQ=11)
gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt > 2:583376‑M1/8‑101 (MQ=255)
gtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt > 1:1140137/5‑101 (MQ=11)
cTCGGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 2:1077881/101‑1 (MQ=255)
tccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:2892559‑M1/95‑1 (MQ=255)
ccgttgagtcggtcgggtccgtgggagcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg < 2:1453927/93‑1 (MQ=14)
ccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg > 1:40378/3‑101 (MQ=11)
cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGACGGATCCGAGGGagagt > 1:2591777/5‑97 (MQ=11)
cgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg > 2:2273619‑M1/5‑101 (MQ=255)
gtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGAtcggg > 2:2215598/10‑100 (MQ=11)
gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 2:2831027‑M1/4‑101 (MQ=255)
gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGACCGTGGGCtcggt > 1:1682077/1‑101 (MQ=11)
tgGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 2:368240‑M1/3‑101 (MQ=255)
tccgctcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtc < 2:3987657/96‑1 (MQ=11)
gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 1:3160219‑M1/100‑1 (MQ=255)
cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTAGGGTCCGTCGGAtcggtgg > 2:2917863/1‑99 (MQ=11)
gggtcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcgg < 2:776309/98‑1 (MQ=11)
ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg > 1:3484173/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggaTCGGGCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgga < 1:1979503/99‑2 (MQ=11)
gtgggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt < 1:214135/98‑1 (MQ=11)
gtcggtcgggtccgtgggatcgttcggatccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat < 2:2875437/100‑3 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTGCGGTGTGTCgggg > 2:1806838/1‑100 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:3628463/101‑1 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGTTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 1:3884598/1‑101 (MQ=14)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGCCCg > 1:2309912/1‑101 (MQ=11)
ggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCCGATCCGTGGGATGGGTCTGATCCGCGGCATCGGTCTGGTcgg > 2:497929/1‑99 (MQ=14)
cgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatagGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTcca > 2:1350158/2‑100 (MQ=11)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGAGGGATCGGTCGGGGCGGTGGGGTCGGTCGGACGGGTGGGAtcggatggttccag > 2:2349901/1‑91 (MQ=14)
gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTAGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCTGt > 2:164188/1‑101 (MQ=11)
tcgggtcggtgggatcggtcgggtcctagggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg < 1:3549858/101‑2 (MQ=11)
tcgggtccgtggtatcggtcgggtccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg < 2:3122888/101‑2 (MQ=14)
tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg > 1:1833683‑M2/1‑100 (MQ=255)
tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg < 1:3036510‑M2/101‑2 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGtgg > 1:245399/1‑99 (MQ=11)
cgcgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg < 2:306147/98‑3 (MQ=11)
gtccgtgggctggggcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt < 1:3959951/101‑1 (MQ=11)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATGGGTCGGATCCGCGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt > 1:3352419/1‑101 (MQ=14)
tccgtggggtccgtcggctccgtgggatcggccggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGAATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 2:681565/101‑1 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGAACGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCAGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcgg > 1:3617097/1‑101 (MQ=14)
cgtgggaacggttggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgg > 1:4140101‑M2/1‑93 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc > 1:2831487‑M2/1‑91 (MQ=255)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc < 1:2659910‑M2/101‑11 (MQ=255)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcggg < 2:3481620‑M2/101‑14 (MQ=255)
cggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc < 1:1891154‑M2/101‑17 (MQ=255)
ggggggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt < 1:1069575/98‑1 (MQ=11)
ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg < 2:1726255/98‑1 (MQ=255)
ggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggcccgtcgg > 2:3835479/4‑101 (MQ=11)
ggtccgtggggtcgggcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCCGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggga < 1:2055037/101‑2 (MQ=11)
cgtgggttgtgtaggAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGgtcggatccgtgggatcgg < 2:1307710/101‑3 (MQ=11)
cgggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTgg < 1:1213927/94‑1 (MQ=11)
cggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg > 1:36726‑M2/2‑72 (MQ=255)
gggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTggg > 1:1295882/10‑101 (MQ=11)
gggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTggg < 2:3310726/92‑1 (MQ=14)
gatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggcccgtgggatcggtcggg < 1:1454029‑M2/101‑32 (MQ=255)
gatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTgggg < 2:2413629/101‑2 (MQ=11)
cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 2:204522/101‑1 (MQ=14)
cggtcggATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc > 2:116411‑M2/1‑67 (MQ=255)
gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt > 1:2757070‑M2/1‑65 (MQ=255)
gtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCAGTGGGGTGCGTCGGGTCCGTGGGGtcggt > 2:2988000/1‑101 (MQ=14)
tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtg > 2:3921103/1‑100 (MQ=11)
gggtccggtggAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 2:274171/92‑1 (MQ=11)
ggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 2:154198/101‑1 (MQ=17)
ggATCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg > 2:1226142‑M2/1‑62 (MQ=255)
ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg > 2:3409463/5‑101 (MQ=17)
gtaggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGt > 1:3272533/4‑101 (MQ=14)
tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc < 1:2366470‑M2/101‑47 (MQ=255)
tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGACGGATCCGTGGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg > 1:2943077/1‑101 (MQ=14)
gggGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 2:944451‑M2/101‑48 (MQ=255)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 1:1537563‑M2/101‑48 (MQ=255)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTggg > 2:1963848/1‑101 (MQ=14)
gtcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 2:1883700/100‑1 (MQ=17)
tgggtgggGTCGGTGGGGTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 1:4236402/99‑1 (MQ=14)
ggtcggTGCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg < 2:3227422/101‑1 (MQ=14)
gtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggc > 2:869231/4‑100 (MQ=255)
gtcggGGCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 1:1376482/101‑1 (MQ=17)
ggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtggga < 1:1005158‑M2/101‑59 (MQ=255)
gTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggat > 2:2500732‑M2/1‑42 (MQ=255)
tCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatc > 2:2648254‑M2/1‑41 (MQ=255)
ccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 2:1010906/1‑101 (MQ=17)
gTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt < 1:630118‑M2/101‑64 (MQ=255)
tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtc > 2:3553382‑M2/1‑37 (MQ=255)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 1:2516790/1‑101 (MQ=255)
ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCCGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTagg < 2:2129410/101‑1 (MQ=17)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGcgg > 1:573024/1‑99 (MQ=255)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtg > 1:502607/1‑101 (MQ=255)
cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtcc > 1:3408097‑M2/1‑31 (MQ=255)
ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg < 2:4076479‑M2/101‑72 (MQ=255)
ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgg < 1:877495/101‑6 (MQ=14)
gtcgtgggcgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt > 1:2239241‑M2/9‑29 (MQ=255)
tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggtc > 1:175104/1‑94 (MQ=14)
cggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg > 1:382867‑M2/1‑27 (MQ=255)
ggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg > 1:3102927‑M2/1‑26 (MQ=255)
gcccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat > 2:4194349‑M2/3‑24 (MQ=255)
tccgtggtatcggtcgggtccgtgggagcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc > 2:3767083‑M2/1‑23 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtc < 1:776386‑M2/101‑79 (MQ=255)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGGGGGGtcg > 2:2590262/1‑101 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatctgtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg > 2:635695‑M2/1‑21 (MQ=255)
ggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg > 1:1604283‑M2/1‑18 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg > 1:3759775‑M2/1‑17 (MQ=255)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggg < 1:681642‑M2/101‑86 (MQ=255)
|
GCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGA > NC_014034/221948‑222147
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 22 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|