| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,084 | 0 | G→A | 10.2% | 93.6 ‑3.1 ‑3.1 | 396 | D191D (GAC→GAT) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (13/28): ref base (174/181): total (187/209) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.66e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.82e-04 | ||||||||||
Only 100 of 561 total aligned reads displayed.
GATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCA > NC_014034/221975‑222184
|
atccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGgtcgggtccgtcgggt > 2:1240296/2‑101 (MQ=11)
tccgtgggatcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGgtcggatccgcggggtc > 1:3842026/1‑101 (MQ=11)
gcgtgggaacggtcggGTGCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtcc < 1:1968538/100‑1 (MQ=11)
ccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtcc > 2:2710047/1‑101 (MQ=14)
ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGTATCTGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcg < 1:3617974/101‑2 (MQ=14)
ccgtcgggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcggatcg < 2:1626253/101‑2 (MQ=11)
cgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcgggtccgtggggtccg > 2:2758708/1‑101 (MQ=14)
cgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGtcgggtccgtcggatccg > 1:2171812/1‑101 (MQ=11)
tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGGCGGTGGGGGCGGTGGGGTCGGTg > 2:774778/1‑101 (MQ=11)
gttgccatcggTTTCGTGGGATCGGCTTGAACGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.TGGGGTCCGTCGGa < 1:2617244/94‑1 (MQ=2)
ggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGa > 2:3493885/9‑101 (MQ=11)
ggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGGGGGTCGGGGGGa > 2:4022978/6‑101 (MQ=11)
gtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt > 2:2268108/8‑101 (MQ=11)
gtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAt > 1:1071470/5‑101 (MQ=11)
ggcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:3540579/99‑1 (MQ=14)
atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAt < 1:2476616/101‑1 (MQ=11)
atcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTggggt < 2:3575009/101‑3 (MQ=11)
tggggcggGTCCGGAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtc < 2:1054585/96‑1 (MQ=14)
tcggtgggATCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTTGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtc < 2:1876789/101‑1 (MQ=11)
tcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTGGGAtc < 1:1763848/101‑1 (MQ=11)
tcgggcggATCCGTGGGAGCGGTCGGCTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtc < 2:915292/101‑1 (MQ=11)
ccgtcggATCTGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtcc < 2:1298320/99‑2 (MQ=11)
ccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtcc < 1:1240392/99‑2 (MQ=11)
ccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGGTCCGTCGGAtcc > 2:3956649/3‑100 (MQ=11)
ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg > 1:3306811/1‑101 (MQ=14)
ggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGTGCCGtagggtccgtcgggtccgggagggccc > 1:1188836/1‑92 (MQ=2)
gtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGCtcggc > 2:1540964/4‑100 (MQ=14)
cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtgg < 1:1334465/101‑3 (MQ=11)
gggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGCCGGGTCCGTGGGAtcggcggg > 2:2412689/4‑97 (MQ=14)
gATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGAtccgtgggg > 2:3008882/1‑100 (MQ=11)
gtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGCGGGAtcggtctggt > 1:3786307/2‑97 (MQ=11)
tcggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc < 2:3886002/95‑1 (MQ=17)
gTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGCTCGGTCGGGTCCTTCTGGTCCGTCGGAtccgtgggggcggt > 2:1895616/1‑95 (MQ=14)
taggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc < 2:1738996/99‑2 (MQ=14)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg > 2:3278672/1‑101 (MQ=14)
cggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg > 1:370750/2‑101 (MQ=255)
aggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg < 2:659347/100‑3 (MQ=14)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGGCCGTggg > 2:832753/1‑101 (MQ=11)
ggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg > 1:337397/1‑101 (MQ=255)
aTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt < 2:3419328/101‑1 (MQ=14)
aTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 1:1879006/101‑1 (MQ=255)
tgggtgggGTCGGTGGGGTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 1:4236402/99‑1 (MQ=14)
tcggtcgtGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 2:3643130/101‑1 (MQ=17)
tcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 2:319504/101‑1 (MQ=17)
tccgtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAGCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 2:3655727/95‑1 (MQ=18)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg > 1:2960612/1‑101 (MQ=17)
ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg > 1:3060961/1‑101 (MQ=17)
ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGGGCCCGTCGGAtcgg > 2:334933/1‑101 (MQ=14)
cgtggggTCCGTGTGATCAGTCGGCGCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg < 2:4131394/97‑1 (MQ=21)
gtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGCGGGAtcggt > 1:414267/4‑101 (MQ=255)
tgggttCCGTGGGATCCGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:2495061/96‑1 (MQ=14)
tggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 2:2119791/3‑101 (MQ=255)
gcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 1:1467812/100‑1 (MQ=17)
gggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:1532205/101‑1 (MQ=17)
tCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATTGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGAGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 1:3114907/101‑1 (MQ=17)
ccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGTTCGGCCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGCTCGGGTCCGTGGCATCGGCCGCGTcc > 1:567934/1‑101 (MQ=17)
ggTGGGGTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 1:749766/100‑1 (MQ=17)
cGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCg > 1:849480/1‑101 (MQ=17)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGCATCGGTCGGGTCCGt > 2:1791296/1‑101 (MQ=11)
tGGGGTCGGTAGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg < 1:3921363/101‑1 (MQ=255)
gggATCGGGCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 1:2888559/101‑1 (MQ=255)
gATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggg < 2:2188500/101‑1 (MQ=255)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTcgggtcc > 1:2771794/1‑98 (MQ=11)
cggtcgcGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTcgggtcc < 1:683117/101‑4 (MQ=11)
ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgg > 2:1679120/1‑96 (MQ=17)
tgggtttgTGTGATCTGTCGGGTCCGTAGGGTCGGTCGGTTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggtgg < 2:3786050/94‑1 (MQ=18)
cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggggg > 1:1846553/1‑101 (MQ=255)
cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggctcgggcg > 2:1144351/1‑93 (MQ=17)
cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg < 2:1209142/101‑9 (MQ=11)
ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggtcgg > 2:613104/1‑92 (MQ=14)
ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg > 1:497808/1‑92 (MQ=11)
gATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTgggatcggtcggg > 2:3850427/1‑91 (MQ=11)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGGGGGGtcg > 2:2590262/1‑101 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTAAGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTGGGGCTGGTGGGAtcggt > 1:2398914/1‑101 (MQ=255)
tGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtc < 2:2942855/101‑1 (MQ=255)
gATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGa > 1:1412210/1‑101 (MQ=255)
atggggcggGTCCGGCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGat < 1:977062/95‑2 (MQ=11)
cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCg > 2:1974625/1‑101 (MQ=255)
cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCg > 1:1561000/1‑101 (MQ=255)
ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGc > 2:1496922/1‑101 (MQ=255)
cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGt < 1:3481872/101‑1 (MQ=255)
cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGt > 2:2338702/1‑101 (MQ=255)
gggTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGCGGGATCGGTCGGACCGCTGTc > 2:545688/1‑101 (MQ=255)
tCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgcc > 1:1676213/1‑101 (MQ=255)
cGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgc > 2:1415958/1‑101 (MQ=255)
aGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGGCGGACCGCTGTcgccgccgc > 1:1122238/1‑101 (MQ=255)
aTCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCgg > 2:2860126/1‑101 (MQ=255)
aTCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCgg < 1:2920756/101‑1 (MQ=255)
cggtcggGGCCGGCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGAc < 1:3987806/101‑1 (MQ=25)
ggtcggGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACa > 2:439319/1‑101 (MQ=255)
gggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAcc < 2:1105587/101‑1 (MQ=255)
ggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAccc < 2:502550/101‑1 (MQ=255)
ggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAccc < 1:2119936/101‑1 (MQ=255)
tccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAg < 2:3091427/101‑1 (MQ=255)
gtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAagcc > 1:4029066/1‑101 (MQ=255)
cgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccgg > 2:3701871/1‑101 (MQ=255)
cgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGGCTGGGGGGACCGGCCGGCCCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGCCCCAgcccgc > 2:2901755/1‑100 (MQ=21)
gggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccggc > 1:2334129/1‑101 (MQ=255)
ggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccggcc > 1:1006313/1‑101 (MQ=255)
gtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCa > 1:620523/1‑101 (MQ=255)
|
GATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCA > NC_014034/221975‑222184
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 16 ≤
ATCG
< 24 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|