Read alignment evidence... | ||||||||||
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seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 3,436,862 | 0 | C→A | 1.7% | 1.0 0.0 ‑0.0 | 236 | H233N (CAT→AAT) | RCAP_rcc03237 | hypothetical protein |
Rejected: E-value exceeds prediction threshold. | ||||||||||
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/2): ref base (109/123): total (111/125) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.13e-01 |
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
GTCCCCGCGATGATCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCACCCGCCTTGGCGCGAAGCT > NC_014034/3436763‑3436962
|
gTCCCCGCGATGATCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCa < 1:3073469/101‑1 (MQ=255)
tCCCCGCGATGATCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCAt > 1:3278747/1‑101 (MQ=255)
cccGCGATGATCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGc < 1:2450012/101‑1 (MQ=255)
cccGCGATGATCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGc < 1:1916330/101‑1 (MQ=255)
cccGCGATGATCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGc < 1:1036607/101‑1 (MQ=255)
cgATGATCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATc < 1:2022294/101‑1 (MQ=255)
cgATGATCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATc > 1:3971257/1‑101 (MQ=255)
cgATGATCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATc > 1:160624/1‑101 (MQ=255)
cgATGATCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATc < 2:1525577/101‑1 (MQ=255)
cgATGATCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGAATGCGATc < 2:2765404/101‑1 (MQ=255)
gatgatCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCa < 2:2564672/101‑1 (MQ=255)
atgatCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCac < 1:656040/101‑1 (MQ=255)
atgatCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCac > 2:2106972/1‑101 (MQ=255)
atgatCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTATTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCac < 2:2910812/101‑1 (MQ=255)
tgatCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCacc < 1:614124/101‑1 (MQ=255)
tgatCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCacc < 1:48933/101‑1 (MQ=255)
gatCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCacca > 1:99386/1‑101 (MQ=255)
tCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCaccaac < 2:3867305/101‑1 (MQ=255)
gtACCTGCTCGGCATGCCGGCCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCaccaacc < 2:2050138/100‑1 (MQ=255)
tACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCaccaacca < 2:528066/101‑1 (MQ=255)
tACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCaccaacca < 2:3534317/101‑1 (MQ=255)
aCCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCcccaaccac > 1:3186033/1‑100 (MQ=255)
aCCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAATCAg < 2:23868/101‑1 (MQ=255)
cTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAgtc < 1:751328/101‑1 (MQ=255)
gCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAgtcgg > 1:3822036/1‑101 (MQ=255)
gCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAgtcgg < 1:2898104/101‑1 (MQ=255)
cTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAgtcggt < 1:2529617/101‑1 (MQ=255)
cTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAgtcggt < 2:160586/101‑1 (MQ=255)
cGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAgtcggtcg > 1:136000/1‑101 (MQ=255)
cGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCGGCATGCGATCACCAACCAgtcggtcg > 1:2545597/1‑101 (MQ=255)
tGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGAtgtg > 2:2663643/1‑101 (MQ=255)
gCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGa < 1:2049300/101‑1 (MQ=255)
ccGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGAt > 1:2326886/1‑101 (MQ=255)
cGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATg < 2:2166615/101‑1 (MQ=255)
aCCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCt > 2:1643542/1‑101 (MQ=255)
ccAAGGTGGTGATCGGCGCCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTg < 2:1266538/101‑1 (MQ=255)
ccAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCATATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTg < 2:3960440/101‑1 (MQ=255)
ccAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTg < 2:690031/101‑1 (MQ=255)
cAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTgg < 2:2009000/101‑1 (MQ=255)
aaGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTgga > 1:263926/1‑100 (MQ=255)
aaGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGgc > 2:1211685/1‑101 (MQ=255)
aaGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGgc < 2:1187315/101‑1 (MQ=255)
aGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGgcg < 2:3278506/101‑1 (MQ=255)
gtggtgATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCt < 1:300624/101‑1 (MQ=255)
gtggtgATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCt > 1:1545365/1‑101 (MQ=255)
tggtgATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCtt < 2:135976/101‑1 (MQ=255)
ggtgATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCttt < 1:2169388/101‑1 (MQ=255)
ggtgATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCttt < 2:3797913/101‑1 (MQ=255)
gATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGc < 1:343309/101‑1 (MQ=255)
tCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTg < 1:1399075/101‑1 (MQ=255)
cGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGa > 2:1983680/1‑101 (MQ=255)
cGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGa > 1:2643367/1‑101 (MQ=255)
cGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGa < 1:2876088/101‑1 (MQ=255)
cGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGa > 2:2247592/1‑101 (MQ=255)
ggCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGAt < 1:2786463/101‑1 (MQ=255)
gCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCAACACGCTACTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGAtc > 2:618396/1‑101 (MQ=255)
cccTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGAtcgt < 2:2645698/100‑1 (MQ=255)
aCCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGAtcgt > 2:1329222/1‑101 (MQ=255)
ccTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGAtcgtc > 1:1719583/1‑101 (MQ=255)
cTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGAtcgtcg < 2:2528101/101‑1 (MQ=255)
gcagTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTcggcg > 1:2420850/4‑101 (MQ=255)
cTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTcggcgg < 2:1311749/101‑1 (MQ=255)
tttCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGcgt > 2:1884106/1‑101 (MQ=255)
tttCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGcgt > 2:3978403/1‑101 (MQ=255)
tttCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGcgt < 1:2527713/101‑1 (MQ=255)
tttCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGGGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGcgt > 1:3896065/1‑101 (MQ=255)
ttCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTGCTCCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGcgtc < 1:3614851/101‑1 (MQ=255)
ttCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGcgtc < 2:4122071/101‑1 (MQ=255)
ttCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGcgtc > 2:3015557/1‑101 (MQ=255)
ttCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGcgtc < 2:827209/101‑1 (MQ=255)
tCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGcgtcg < 2:2755332/101‑1 (MQ=255)
aGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTg > 1:1578/1‑101 (MQ=255)
aGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTg > 2:419287/1‑101 (MQ=255)
aGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTg < 1:2247751/101‑1 (MQ=255)
aTCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTggg > 1:1824603/1‑101 (MQ=255)
aTCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTggg > 1:3525898/1‑101 (MQ=255)
tCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGgc > 1:2131584/1‑101 (MQ=255)
tCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGgc > 2:3443715/1‑101 (MQ=255)
ccTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGgcg > 1:1651305/1‑101 (MQ=255)
cTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGgcgc > 1:1167083/1‑101 (MQ=255)
tGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGgcgcg > 1:3125741/1‑101 (MQ=255)
aTCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCa > 1:1957948/1‑101 (MQ=255)
tCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAg < 2:2178837/101‑1 (MQ=255)
ggCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCa < 2:3731557/101‑1 (MQ=255)
gCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCAc < 2:372084/101‑1 (MQ=255)
ttCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCACCCg > 1:3537685/1‑101 (MQ=255)
ttCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCACCCg > 1:967873/1‑101 (MQ=255)
tCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCACCCGc < 2:2485108/101‑1 (MQ=255)
tCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCACCCGc > 2:3358228/1‑101 (MQ=255)
caccacGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGGGCGCAGATCGGCACCCGcc > 2:2859829/1‑101 (MQ=255)
cccacGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCACCCGCCt < 2:2539913/100‑1 (MQ=255)
accacGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCACCCGCCt > 1:1205667/1‑101 (MQ=255)
ccacGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCACCCGCCtt < 2:418310/101‑1 (MQ=255)
cGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCACCCGCCTTGgc > 1:3457119/1‑101 (MQ=255)
gcgccTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCACCCGCCTTGgcg < 2:3876845/98‑1 (MQ=255)
tCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCACCCGCCTTGGcgcg > 1:1519004/1‑101 (MQ=255)
tGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCACCCGCCTTGGCGCGAAg < 1:843527/101‑1 (MQ=255)
gCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCACCCGCCTTGGCGCGAAGc < 1:3731595/101‑1 (MQ=255)
gCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCACCCGCCTTGGCGCGAAGc > 2:3157809/1‑101 (MQ=255)
cATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCACCCGCCTTGGCGCGAAGCt < 1:450195/101‑1 (MQ=255)
|
GTCCCCGCGATGATCTACCTGCTCGGCATGCCGACCAAGGTGGTGATCGGCACCTCGCTGTTTCAGATCCTGATCGTCTCGGCCTTCACCACGCTCCTGCATGCGATCACCAACCAGTCGGTCGATGTGATGCTGGCGCTTTTGCTGATCGTCGGCGGCGTCGTGGGCGCGCAGATCGGCACCCGCCTTGGCGCGAAGCT > NC_014034/3436763‑3436962
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 21 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|