BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,964	C→G	3.0%	P231P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	221,964	0	C→G	3.0%	24.9 ‑0.8 ‑0.6	552	P231P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (10/7): ref base (262/273): total (272/280)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.68e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.29e-01

Only 100 of 1313 total aligned reads displayed.


TGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAG  >  NC_014034/221864‑222064


 gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                                                                     <  1:2277543‑M1/10‑1 (MQ=255)


   ccGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGGGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcggg                                                                                                   >  1:3763635/1‑101 (MQ=255)


      cggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                                                <  1:1236652‑M1/15‑1 (MQ=255)


       ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                                                               <  2:409696‑M1/16‑1 (MQ=255)


         tggggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtg                                                                                             >  1:2061366‑M1/84‑101 (MQ=255)


         tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtg                                                                                             <  2:3102697‑M1/18‑1 (MQ=255)


         tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                                                                                             <  1:358068‑M1/18‑1 (MQ=255)


          cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgg                                                                                            <  1:51531‑M1/19‑1 (MQ=255)


           ggctccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                                                           >  2:808998‑M1/82‑101 (MQ=255)


            tCGGCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtggga                                                                                          >  1:3257860/1‑101 (MQ=255)


               ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtgggggccgtgggatcg                                                                                       <  2:3682664‑M1/24‑1 (MQ=255)


                 gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                                                                                     >  1:3629337‑M1/76‑101 (MQ=255)


                  tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                    <  1:2494218‑M1/27‑1 (MQ=255)


                   gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcg                                                                                   >  2:2890520‑M1/74‑101 (MQ=255)


                    ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                                  <  2:597445‑M1/29‑1 (MQ=255)


                     gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtgggatcggtcggg                                                                                 <  1:1454029‑M1/30‑1 (MQ=255)


                      atcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgagggatcgggcgggg                                                                                <  2:926618‑M1/31‑2 (MQ=255)


                        cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                              <  2:2248549‑M1/33‑1 (MQ=255)


                          gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt                                                                            >  2:2632406‑M1/67‑101 (MQ=255)


                             ggatccgtgggctcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                                         >  2:1226142‑M1/64‑101 (MQ=255)


                              ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                                                        <  1:2906970‑M1/39‑1 (MQ=255)


                               atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                                       <  1:2854456‑M1/40‑1 (MQ=255)


                                  cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                    <  1:3366556‑M1/43‑1 (MQ=255)


                                  cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                    <  1:2560651‑M1/43‑1 (MQ=255)


                                   gagggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                   <  1:3517480‑M1/44‑1 (MQ=255)


                                     cAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                                 >  1:3468516/1‑101 (MQ=255)


                                      ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                <  1:2359247‑M1/47‑1 (MQ=255)


                                       gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGa                                                               >  1:435040‑M1/54‑101 (MQ=255)


                                           ggtcggttccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                           >  2:144934‑M1/50‑101 (MQ=255)


                                             tcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                         <  2:1739698‑M1/54‑1 (MQ=255)


                                                ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                      <  1:1005158‑M1/57‑1 (MQ=255)


                                                ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgggg                                                      <  1:3051895‑M1/57‑2 (MQ=255)


                                                ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                      <  1:2018999‑M1/57‑1 (MQ=255)


                                                gatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                      <  1:726117‑M1/57‑1 (MQ=255)


                                                 gtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                     >  2:2312264‑M1/44‑101 (MQ=255)


                                                 ggccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                     >  1:3831136‑M1/44‑101 (MQ=255)


                                                   ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                   <  2:2081049‑M1/60‑1 (MQ=255)


                                                     gtgggatcggtcggttccgtgggctccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                 >  2:3404390‑M1/40‑101 (MQ=255)


                                                      tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                >  2:3553382‑M1/39‑101 (MQ=255)


                                                            cggtcgggtccgtgtgatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                          >  2:3930173‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                                              gtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgg                                        <  1:1524937‑M1/71‑2 (MQ=255)


                                                               tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                       >  1:1875513‑M1/30‑101 (MQ=255)


                                                               tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                       >  1:1739817‑M1/30‑101 (MQ=255)


                                                                cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                      <  1:4044190‑M1/73‑1 (MQ=255)


                                                                  ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                    >  1:3207092‑M1/27‑101 (MQ=255)


                                                                   gtccgtggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                   >  1:2412865‑M1/26‑101 (MQ=255)


                                                                     ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGAGGGAtcg                                 <  2:1314567‑M1/78‑1 (MQ=255)


                                                                     ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGgatag                                 <  1:221888‑M1/78‑3 (MQ=255)


                                                                     ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                 <  1:1663322‑M1/78‑1 (MQ=255)


                                                                      cgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtcgg                                <  1:4131656‑M1/79‑1 (MQ=255)


                                                                      cgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                >  2:3625515‑M1/23‑101 (MQ=255)


                                                                       gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                               >  1:2778116‑M1/22‑101 (MQ=255)


                                                                       gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                               <  2:1965449‑M1/80‑1 (MQ=255)


                                                                        tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                              <  1:3888699‑M1/81‑1 (MQ=255)


                                                                         ggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                             >  1:1604283‑M1/20‑101 (MQ=255)


                                                                         gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                             <  2:189449‑M1/82‑1 (MQ=255)


                                                                         gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                             <  1:909386‑M1/82‑1 (MQ=255)


                                                                         gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                             >  1:991847‑M1/20‑101 (MQ=255)


                                                                         gggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                             >  1:2140335‑M1/20‑101 (MQ=255)


                                                                         cGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                             <  1:1925897/101‑1 (MQ=255)


                                                                         cGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                             >  2:3471668/1‑101 (MQ=255)


                                                                           gatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggtcggg                           <  2:2400988‑M1/84‑2 (MQ=255)


                                                                             tcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATc                         >  1:3959863‑M1/16‑101 (MQ=255)


                                                                                gtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgg                      <  1:2666999‑M1/89‑2 (MQ=255)


                                                                                  cgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTgg                    <  2:526789‑M1/91‑1 (MQ=255)


                                                                                  cggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                    <  2:1038503‑M1/91‑1 (MQ=255)


                                                                                    ggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                  >  2:4220238‑M1/9‑101 (MQ=255)


                                                                                    gatcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTCGGa                  >  1:3679956/3‑101 (MQ=11)


                                                                                       tcgtgggctcggtccgatccgttggctcggtccggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg               <  2:2154157/93‑1 (MQ=11)


                                                                                       ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg               >  1:29650‑M1/6‑101 (MQ=255)


                                                                                       ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg               >  1:1149972‑M1/6‑101 (MQ=255)


                                                                                       ccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg               <  2:2477945/99‑1 (MQ=11)


                                                                                       ccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg               <  1:817489/99‑1 (MQ=11)


                                                                                        cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg              >  1:597509‑M1/5‑101 (MQ=255)


                                                                                         gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt             <  2:738258‑M1/98‑1 (MQ=255)


                                                                                         gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt             >  2:2831027‑M1/4‑101 (MQ=255)


                                                                                         gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggggtccgt             <  2:3053430‑M1/98‑7 (MQ=255)


                                                                                          tgggatctgtcgggtccgtgggctcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc            <  2:2726382/99‑1 (MQ=14)


                                                                                          tgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc            <  1:274216‑M1/99‑1 (MQ=255)


                                                                                          tgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc            >  1:643782‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                                                          ggGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc            >  2:4011815‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                                                           gGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg           >  2:1524833‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                                                                           cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGAtcggtgg           >  2:643705/1‑99 (MQ=255)


                                                                                            ggatcggtgggatccgtgggatccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg          <  2:3272292/101‑1 (MQ=11)


                                                                                            ggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGtcggtcgg          >  1:1069037/1‑101 (MQ=11)


                                                                                            ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg          <  2:2962493/101‑1 (MQ=11)


                                                                                             gctaggtcgggtccgttggaccggtccggtccgtgtgaccTGTCGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg         <  2:2557258/97‑1 (MQ=11)


                                                                                             gatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcgga         <  1:1371767/101‑2 (MQ=11)


                                                                                              gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggaTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGt        <  1:3128428/100‑1 (MQ=11)


                                                                                              atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtgggat        >  1:3409028/1‑99 (MQ=255)


                                                                                              atcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTGCGGTGTGTCgggg        >  2:1806838/1‑100 (MQ=11)


                                                                                               tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc       >  2:1105434/1‑101 (MQ=11)


                                                                                                cgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc      <  1:1316212/101‑1 (MQ=11)


                                                                                                 ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCGGTCGGATCCg     >  2:1632933/1‑101 (MQ=14)


                                                                                                 ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGCGATCGGTCGGATcag     >  2:3857848/1‑99 (MQ=14)


                                                                                                 cgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatagGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTcca     >  2:1350158/2‑100 (MQ=11)


                                                                                                  gtcgggtccggtggatccgtcgggtccgtgggaccgGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt    <  2:3190637/101‑1 (MQ=11)


                                                                                                  gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGACCGGTCGGATCCGt    >  1:2606507/1‑101 (MQ=11)


                                                                                                   tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg   >  1:1797768‑M2/1‑100 (MQ=255)


                                                                                                   tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTGCGTGGGAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg   >  2:3775826/1‑100 (MQ=14)


TGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAG  >  NC_014034/221864‑222064

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG