Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | ||||||||||
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* | NC_014034 | 2,304,901 | 0 | C→A | 100.0% | 578.8 | 166 | V892L (GTA→TTA) | RCAP_rcc02139 | methyl‑accepting chemotaxis protein |
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Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
TAATCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCGCCCTGCATGC.GAAGACCG.CGTACGCTCCCGC.A.GGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACC > NC_014034/2304810‑2304986
||
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tAATCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGc > 2:1096491/1‑101 (MQ=255)
aaTCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGcc > 1:3984558/1‑100 (MQ=255)
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ttGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGAGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.A.gggt > 1:3416738/1‑99 (MQ=255)
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ggCCGGATCCGGCCGGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGccc < 2:442004/101‑1 (MQ=255)
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gATCGGGCCTTGCGGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCcagcag < 1:295973/101‑1 (MQ=255)
gATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCGGCTCCCGC.AGGGCCTGCGCCTCGCCctgcag > 2:561861/1‑101 (MQ=255)
aTCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCagcagc < 1:1310324/101‑1 (MQ=255)
tCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGCGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAgcg > 1:1681307/1‑101 (MQ=255)
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cGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGcc > 1:1701061/1‑101 (MQ=255)
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ggCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCt > 1:2260104/1‑101 (MQ=255)
gCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTg > 1:3135457/1‑101 (MQ=255)
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tCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcg > 2:2359472/1‑101 (MQ=255)
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cacccGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGTGCCTCGCCCAGCAGCGCCCGCGTcgc > 2:1753692/4‑101 (MQ=255)
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ccGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGc < 2:3012732/101‑1 (MQ=255)
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ggCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCcg > 2:1282926/1‑101 (MQ=255)
gCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCcgc > 1:780438/1‑101 (MQ=255)
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gCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCcgc < 1:964098/101‑1 (MQ=255)
ccTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCcgcg > 2:1329757/1‑101 (MQ=255)
cTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGt > 1:1556572/1‑101 (MQ=255)
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ccGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGtttt < 1:3472088/101‑1 (MQ=255)
ccGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCCCGGCCGCGtttt < 1:2289488/101‑1 (MQ=255)
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cGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTc < 1:3149776/101‑1 (MQ=255)
cGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGCTTTc > 2:4045153/1‑101 (MQ=255)
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ggTGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGCCGGATCCCGC.AGGGGCTGCGCCTCGCCCAGAAGCGCCGGCGTCGCGCCCGCGTTTTCCTCGAACACcggcgc > 2:2763359/1‑101 (MQ=255)
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tGGCG.CCTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCCACTCGCCCAGCCGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTGCCTCGACGATCGCCCCAt > 2:1930902/1‑101 (MQ=255)
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gcgccTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATtg > 1:3242709/4‑101 (MQ=25)
cgccTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATtgt < 1:3500781/99‑1 (MQ=25)
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cgccTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATtgt > 1:411985/3‑101 (MQ=21)
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ccTGCATGCGGAAGCCCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGc < 2:1890693/101‑1 (MQ=21)
cTGCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCt > 2:3045022/1‑101 (MQ=21)
gCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTgg > 1:221723/1‑101 (MQ=21)
gCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTgg < 1:193350/101‑1 (MQ=21)
gCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTgg < 1:1749748/101‑1 (MQ=25)
gCATGCGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTgg < 1:1593364/101‑1 (MQ=25)
atgcggAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTgggg > 2:3077513/6‑100 (MQ=21)
tgcggAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTg > 2:1823243/5‑101 (MQ=21)
cggAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGAc < 1:2359648/99‑1 (MQ=25)
cggAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGAc > 1:2612733/3‑101 (MQ=21)
cggAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGAc < 1:3521958/99‑1 (MQ=21)
ggAAGACCGCCGTCAGCTCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGAcc < 1:1823363/100‑1 (MQ=21)
ggAAGACCGCCGTCAGCCCCCGC.AGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGAcc < 2:854770/100‑1 (MQ=21)
||
TAATCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCGCCCTGCATGC.GAAGACCG.CGTACGCTCCCGC.A.GGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACC > NC_014034/2304810‑2304986
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 25 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|