Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,395,426 | +T | 10.1% | intergenic (+238/‑693) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,395,426 | 1 | .→T | 10.1% | 76.7 ‑1.1 ‑0.4 | 198 | intergenic (+238/‑693) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (12/8): ref base (84/94): total (96/102) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.47e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.29e-01 |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATC > NC_014034/1395327‑1395526
|
aaTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.at < 2:2024427/101‑1 (MQ=255)
tttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCa > 1:3900809/1‑101 (MQ=255)
ttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGGCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAg > 1:4574207/1‑101 (MQ=255)
ttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAg > 2:1814577/1‑101 (MQ=255)
ttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAg > 1:4300910/1‑101 (MQ=255)
ttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAg < 1:2484104/101‑1 (MQ=255)
acacCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGAACCCGCTGGCCCTGCCGGGGCTCGGGG.GTCAggg > 1:3418179/1‑99 (MQ=37)
cccGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGt < 1:1106706/100‑1 (MQ=255)
acCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCggc > 2:3178039/1‑100 (MQ=255)
acCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGt > 1:2984252/1‑101 (MQ=255)
gTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGc > 2:2044056/1‑101 (MQ=255)
tCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCt < 2:3017249/101‑1 (MQ=255)
tCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTccccc < 2:1446422/101‑1 (MQ=255)
tCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTccccc < 1:2381168/101‑1 (MQ=255)
aGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCcg < 2:2980544/101‑1 (MQ=255)
aGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACCTCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGACCGGTG.ATCAGCGGTCGCGccccccc > 2:644228/1‑100 (MQ=37)
cGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCcgcg > 2:4319255/1‑101 (MQ=255)
gggTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCgg < 1:1260656/101‑1 (MQ=255)
gTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCgggg < 1:2338731/101‑1 (MQ=255)
gTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCgggg > 1:3502965/1‑101 (MQ=255)
tACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc < 2:1193667/101‑1 (MQ=255)
cGAAACGGCAGCCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGGCCTGCCGGCGCTCGGTG.ATCAGCGGTCTCTCTTCCCGCGGGGGCGt > 2:3080792/1‑101 (MQ=37)
tcaacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt > 1:4524058/9‑101 (MQ=2)
tcaacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt > 1:3692723/9‑101 (MQ=2)
aaaCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTTGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg < 2:3443017/101‑1 (MQ=255)
aaaCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg < 1:4436026/101‑1 (MQ=255)
caacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:3158007/94‑1 (MQ=2)
aaCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa > 1:4494640/1‑101 (MQ=255)
aaCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 2:4180447/101‑1 (MQ=255)
aacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 1:1823222/7‑101 (MQ=2)
aacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:4187166/95‑1 (MQ=2)
aCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:394704/101‑1 (MQ=255)
cGGCAGTCGCTCGCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 1:2531988/1‑101 (MQ=255)
acactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 1:3940869/6‑101 (MQ=2)
cactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa > 1:4216720/5‑101 (MQ=2)
cactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 2:2197567/97‑1 (MQ=2)
cactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 1:218179/97‑1 (MQ=2)
gCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa < 1:749198/101‑1 (MQ=255)
gCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa < 1:3078127/101‑1 (MQ=255)
gCAGTCCCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa < 2:4574396/101‑1 (MQ=255)
cctgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 1:1424812/98‑1 (MQ=2)
cAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 2:4471129/101‑1 (MQ=255)
cAGACGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGATGGACCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCACCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa > 2:438207/1‑101 (MQ=38)
tgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAct > 2:1752721/2‑100 (MQ=2)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 1:4347029/101‑1 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 1:2888290/1‑101 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 2:3251534/1‑101 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 1:939820/1‑101 (MQ=255)
aGTCGCGCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 1:4633246/101‑1 (MQ=255)
gTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAActc > 1:3860529/1‑99 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 1:592815/1‑101 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAAAt > 1:60779/1‑101 (MQ=255)
accccaccccGTGGGGGACTGGATCGGAACGGCACCCCCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt < 2:711214/95‑1 (MQ=25)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATc > 2:2564729/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAGCGACGCTGCGCCTGGTGGCCCTGCCGGTGATCGGGG.ATCAGCGGTCCCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATc < 2:1604010/101‑1 (MQ=25)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgc > 2:234818/1‑101 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgcc < 1:2828081/101‑1 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgcc < 1:1019681/101‑1 (MQ=255)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATCGAAACATCGCCGCt > 1:174470/1‑101 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTgg > 1:1191417/1‑101 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTgg > 2:2237069/1‑101 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGc > 2:397733/1‑101 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGc > 1:4284900/1‑101 (MQ=255)
ggggCGGGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCg < 2:3891237/101‑1 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCgg < 2:1764964/101‑1 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGt < 1:2044196/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCg > 2:1371769/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACCGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGa < 2:2742043/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.GTTAACGGTCGGTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGGCggc > 2:1540596/1‑99 (MQ=37)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGGGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTAGAc > 1:1643886/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTTGGGGTCggc > 1:4392100/1‑99 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc > 2:2985953/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTAATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc < 1:3981298/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGAACCCGCTGGACCTGCCGGTGATCGGTA.ATCAGCGGTCGCTCCCACCGCGGGGGCGTGGATTGAAACATCGCCGCTTTTGCGGTCgga > 1:1513968/1‑99 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACa > 1:3355550/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACa > 2:3524531/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAg > 2:2815872/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAg > 2:4040535/1‑101 (MQ=255)
aaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGt < 2:4587914/101‑1 (MQ=255)
aCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTa > 2:3229170/1‑101 (MQ=255)
tGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGCCGACAGGATGGTAAc > 2:167793/1‑101 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtgt < 1:352530/101‑1 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtgt < 2:2888007/101‑1 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGc < 2:3362020/101‑1 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGc > 1:2693398/1‑101 (MQ=255)
cccTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGGCGACAGGCTGGTAACGGGTCGCTcccc > 2:3536113/1‑101 (MQ=255)
ccTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccccc < 1:1791516/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc < 2:939740/101‑1 (MQ=255)
tGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcg > 2:2494859/1‑101 (MQ=255)
gCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcgc > 1:3650678/1‑101 (MQ=255)
gCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcgc > 1:2358714/1‑101 (MQ=255)
gtgatcggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgggg > 1:4089704/1‑101 (MQ=255)
gatcggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc > 2:516824/1‑101 (MQ=255)
atcggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCg < 1:3220934/101‑1 (MQ=255)
cggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg > 2:3719644/1‑101 (MQ=255)
ggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg > 2:54828/1‑101 (MQ=255)
gtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 1:482771/101‑1 (MQ=255)
tg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:2453644/101‑1 (MQ=255)
tg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:891739/101‑1 (MQ=255)
g.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGNGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:438244/101‑1 (MQ=255)
|
CAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATC > NC_014034/1395327‑1395526
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 17 ≤
ATCG
< 25 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|