New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_014034 | 411494 = | 225 (1.030) | 91 (0.420) | 18/184 | 23.9 | 0.43 | intergenic (+7/+56) | RCAP_rcc00380/RCAP_rcc00381 | transglycosylase, Slt family/hypothetical protein |
? | NC_014034 | 1608059 = | 13 (0.050) | intergenic (+329/‑18) | RCAP_rcc01484/murD | hypothetical protein/UDP‑N‑acetylmuramoylalanine‑‑D‑glutamate ligase | |||||
Rejected: Position hash score below cutoff. |
GGCCCAATTCACCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCACGGCGGCGGCATT > NC_014034/1608041‑1608159
|
ggggtgtgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCt > 1:3173785/11‑101 (MQ=255)
ggggtgtgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCt < 2:3921231/91‑1 (MQ=255)
gggtgtgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTg > 2:1996607/10‑101 (MQ=255)
gggtgtgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTg < 1:175157/92‑1 (MQ=255)
gggtgtgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTg < 2:4399020/92‑1 (MQ=255)
ggtgtgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTgg < 1:4424186/93‑1 (MQ=255)
gtgtgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGc < 2:2725233/94‑1 (MQ=255)
gtgtgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGc < 2:2902325/94‑1 (MQ=255)
gtgtgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGc > 1:226250/8‑101 (MQ=255)
gtgtgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGc < 2:4478065/94‑1 (MQ=255)
tgtgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGcc > 1:168321/7‑101 (MQ=255)
tgtgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGcc < 1:3640183/95‑1 (MQ=255)
gagacccccccGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCa < 1:71447/95‑1 (MQ=255)
tggaaCCGCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGAGATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCAc < 2:4389953/97‑1 (MQ=255)
tgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCAc > 1:645147/5‑101 (MQ=255)
tgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCAc < 1:2720724/97‑1 (MQ=255)
tgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCAc > 2:4602531/5‑101 (MQ=255)
tgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCAc < 1:1525172/97‑1 (MQ=255)
tgaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGGCGCATATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTCCGGGCGTCGCGGTCCTGGGGCTCGGGCGGTCGGGTCTGGGCAc > 2:3833384/5‑101 (MQ=255)
gcaaCCCCCGCAGTTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCAcg < 2:834355/98‑1 (MQ=255)
gaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCAcg > 2:3866828/4‑101 (MQ=255)
gaaaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCAcg > 2:3356485/4‑101 (MQ=255)
aaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCAcggc < 1:3867113/100‑1 (MQ=255)
aaCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGATCGGGCGCTCGGGTCTGGCCAcggc > 2:727648/2‑101 (MQ=255)
aCCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTAGGGCGCTCGGGTCTGGCCCcggcg > 2:2742284/1‑101 (MQ=255)
ccccGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCAcggcggc > 2:3751248/1‑101 (MQ=255)
ccccGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCAcggcggc < 2:3082524/101‑1 (MQ=255)
ccccGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGGCTGGCCAcggcggc > 2:715171/1‑101 (MQ=255)
cccGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGGCTGGCCAcggcggcg > 2:4255798/1‑101 (MQ=255)
cGCAGCTTACGGAGGTCGCAGGTGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCACggcggcggc > 1:3438018/1‑101 (MQ=255)
cGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCACggcggcggc < 2:335582/101‑1 (MQ=255)
cGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCACggcggcggc < 1:1529559/101‑1 (MQ=255)
cGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGCCTGGCCACggggggggc > 2:1165842/1‑101 (MQ=255)
gCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCACGGCGGCGGCa > 1:2748650/1‑101 (MQ=255)
gCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGCCTGGCCAcggccgcggga > 1:3225703/1‑99 (MQ=255)
aGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGGGCTCGGGTCTGGCCACGGCGGCGGCAtt > 2:1240144/1‑101 (MQ=255)
aGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCACGGCGGCGGCAtt > 1:1042088/1‑101 (MQ=255)
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GGCCCAATTCACCCCCGCAGCTTACGGAGGTCGCAGATGATACCGGTTCAGGGATATGAGGGTGCGCGCGTCGCGGTGCTGGGGCTCGGGCGCTCGGGTCTGGCCACGGCGGCGGCATT > NC_014034/1608041‑1608159
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 19 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
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