| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,018 | 0 | C→G | 3.2% | 82.0 ‑6.5 ‑1.7 | 1536 | P213P (CCG→CCC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has biased read strand distribution supporting polymorphism. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (37/14): ref base (732/749): total (770/766) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.49e-03 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.84e-02 | ||||||||||
Only 100 of 1937 total aligned reads displayed.
GCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCG > NC_014034/221918‑222118
|
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cATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCggg > 2:4271390/1‑101 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGggtccgtcggat < 1:1070100‑M1/67‑3 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 1:1239786‑M1/68‑1 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGggatcggtcggatc > 2:2583844‑M1/34‑98 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc > 1:1175066‑M1/34‑101 (MQ=255)
tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGggatcggtcggatc > 1:3022447‑M1/34‑98 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:1433819‑M1/69‑1 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 1:4427466‑M1/70‑1 (MQ=255)
gtcgggtccgtcggatcggtcgggcccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 2:2655668‑M1/31‑101 (MQ=255)
tgtgtgcagtGCCTGGGCGTGGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 2:2166218/92‑1 (MQ=2)
gCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg > 1:2225158/1‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 1:3809160‑M1/81‑1 (MQ=255)
gggggtcggtggggtccgtgGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 1:1882576‑M1/21‑101 (MQ=255)
ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgggcgg > 1:497183/1‑101 (MQ=255)
gatcggtcggggccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggtcggg > 1:3107983‑M1/18‑100 (MQ=255)
tccGTGGGGTCCGGCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATc < 2:825592/99‑1 (MQ=14)
ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg < 2:11734‑M1/88‑1 (MQ=255)
cgggtcggtgggGGCGGTCGGTTGCGTGGTGGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTgg < 1:2946009/97‑1 (MQ=11)
gggtccggctgatgggtggggtccgtggggtcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 1:949254/91‑1 (MQ=11)
cTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGATCCGTGGGAt > 2:4186199/1‑101 (MQ=255)
atccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:2858679‑M1/94‑1 (MQ=255)
tcggtcggGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 2:3255531/101‑1 (MQ=255)
tcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc < 1:4099140/101‑1 (MQ=11)
tccgtgggctcggtcgggccggtcggaccggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtc < 2:1642939/92‑1 (MQ=11)
gtcggATCGGTGGGGTACGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 1:4372144/101‑1 (MQ=11)
tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 2:10420‑M1/3‑101 (MQ=255)
cgagctcggtcggctccgttcgatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:4418090/96‑1 (MQ=11)
gggatcggtcgggtcggtggggtctgtcgggtccgtgGGTTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 2:508319/100‑1 (MQ=11)
gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg > 2:395109/2‑101 (MQ=11)
cggATCCGGGGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtccgtgg < 2:2858463/101‑3 (MQ=18)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtgcgccgg > 2:2016158/1‑94 (MQ=11)
ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg < 1:1553295/101‑1 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcgGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGACCGGACGGGTCCGTGGGATCGGTCggg > 2:1719136/1‑101 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCTGTGGGGTCGGCGGGTGCGGTGgggg > 2:2230764/1‑100 (MQ=11)
atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGACGCGTGGGAGCGGGCgggc > 2:1798139/1‑100 (MQ=11)
tcggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtggggTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 1:2385824/101‑1 (MQ=14)
tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc < 2:580899/101‑1 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggtgtCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:4008390/101‑1 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCCGGTcc > 1:394667/1‑101 (MQ=11)
cggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATcg < 2:1938995/101‑2 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGAGCGGTGGGGgcggtgggaccgg > 2:2328789/1‑96 (MQ=11)
ctggggcccgtgggatccgccgggtccgtgggatcggtcGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt < 2:4352146/98‑1 (MQ=11)
tcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTg < 1:259414‑M2/101‑2 (MQ=255)
ggtccgttgtatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa < 2:1569463/101‑1 (MQ=11)
gatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGtggca > 2:4625577/3‑97 (MQ=11)
gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat > 1:2725453‑M2/1‑96 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTTGGATCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAt < 1:3393570/101‑1 (MQ=14)
gtccgtgggagcggtcgggtccgtgggagcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat > 1:1765620‑M2/1‑96 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc > 1:3468339‑M2/1‑95 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:858382/101‑1 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 2:3895072/101‑1 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc > 1:3714240‑M2/1‑95 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCTGGGCCGTGGGAgcg > 2:377632/1‑101 (MQ=11)
cggaggttcggtcgggtcggtcgggtcggtcggGTCCGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg < 2:3620138/94‑1 (MQ=11)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGCATCCGTGGGGgcggt > 2:4536278/1‑101 (MQ=11)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt < 2:743433‑M2/101‑10 (MQ=255)
gtgggagcgggcggggccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 1:4169110/101‑1 (MQ=11)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 1:2667794/1‑101 (MQ=14)
ggggatcggtcggatcggggggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtc < 1:1619032/100‑1 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg < 2:3337218‑M2/101‑12 (MQ=255)
gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtgg > 2:3502910/1‑99 (MQ=11)
ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATTGGTCGGGTCCGTGGGGtagggcgg > 2:3425746/1‑101 (MQ=11)
gatcggtcggatccgggggatcggacggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtccggccgg > 2:3087978/1‑94 (MQ=11)
cggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGggcgggtcc > 2:1440840/1‑101 (MQ=11)
cggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGTTCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtcc > 1:3867011/1‑101 (MQ=14)
ggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGCTCGgtcgggtcgg > 2:908137/1‑99 (MQ=11)
gtgtgatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGgtcggatccgt < 1:4626990/95‑1 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGGCGGTGGGGTCGgtcgggtccgggtg > 2:2714472/1‑97 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcggGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg > 1:3202987‑M2/1‑80 (MQ=255)
gatccgtaggatgggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg < 1:1003866/99‑1 (MQ=11)
gtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggt > 2:635569‑M2/1‑78 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcg > 2:3692661‑M2/1‑76 (MQ=255)
gtgggttccgtctgATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt < 2:2095881/101‑1 (MQ=14)
gtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCCGtggggtccgccgggtccgg > 2:4098854/4‑100 (MQ=11)
tgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc < 2:240449‑M2/101‑29 (MQ=255)
gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg > 1:770790/1‑99 (MQ=11)
gggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTggg > 2:3180602/10‑101 (MQ=11)
gtccgtgggATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:1994970/94‑1 (MQ=17)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc < 1:2082698‑M2/101‑35 (MQ=255)
gtcggATTGGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtccgt < 1:2150713/101‑1 (MQ=11)
tcggGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc < 1:4290638/101‑1 (MQ=11)
tcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAGCGGTCGGGGCCCGGGGGGCCGTCGGAtccgtg > 2:2924872/1‑100 (MQ=11)
gggttcgtgggGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg > 1:2493262‑M2/6‑62 (MQ=255)
ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcggg > 1:553197/3‑100 (MQ=11)
gtcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat > 1:1321155‑M2/2‑60 (MQ=255)
tCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATc < 1:1704658/101‑1 (MQ=11)
tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc < 2:125369‑M2/101‑43 (MQ=255)
cggTGGGATCCGTGGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 1:2776606/99‑1 (MQ=18)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg < 2:4022301‑M2/101‑44 (MQ=255)
ccGTAGGATCGGTCGGGTCCCTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgggtac > 2:278924/1‑97 (MQ=11)
ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg < 1:354585/97‑1 (MQ=18)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg < 1:3289917‑M2/101‑45 (MQ=255)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcgg < 1:4547469‑M2/101‑45 (MQ=255)
taggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtgggggccggc > 2:1327203/3‑94 (MQ=14)
gggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 1:3645860‑M2/101‑48 (MQ=255)
aTCCGTGGGGTTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTAGGATCGGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 2:2472939/101‑1 (MQ=18)
ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg < 1:61080/101‑1 (MQ=17)
tcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg < 2:3022218‑M2/101‑56 (MQ=255)
cggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg < 1:686325‑M2/101‑57 (MQ=255)
|
GCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCG > NC_014034/221918‑222118
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 12 ≤
ATCG
< 21 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|