| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,033 | 0 | G→C | 7.9% | 235.9 ‑7.5 ‑0.4 | 1542 | T208T (ACC→ACG) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has biased read strand distribution supporting polymorphism. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (37/91): ref base (635/778): total (672/870) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.30e-04 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.67e-01 | ||||||||||
Only 100 of 1952 total aligned reads displayed.
GCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTG > NC_014034/221933‑222132
|
gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGCatcggc < 1:748616‑M1/80‑2 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 1:1467774‑M1/22‑101 (MQ=255)
tccGTGGGGTCCGGCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATc < 2:825592/99‑1 (MQ=14)
ccggTGGGTTCCGTCGGGTCGGTCTGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 2:2826525/98‑1 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc > 1:384615‑M1/15‑101 (MQ=255)
cGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg < 1:2683422/101‑1 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGt > 1:2625877/1‑101 (MQ=11)
ggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa > 2:3203830‑M1/9‑101 (MQ=255)
tgccgtgggttcggtccggggcggggggtcggtcgggtccgtggggTCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt < 2:1111170/91‑1 (MQ=2)
gggcgtgggatcggtcgggaccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 2:237256/94‑1 (MQ=11)
cTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGATCCGTGGGAt > 2:4186199/1‑101 (MQ=255)
tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc > 2:1755049/1‑101 (MQ=255)
tccgtgGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCcgtggggtc > 1:4669116‑M1/7‑98 (MQ=255)
gcggggggattggtcgggtcggtgggatcggtcggggtcgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:3569315/95‑1 (MQ=14)
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGAtcgg > 2:198955/5‑101 (MQ=11)
gtgggggcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgt < 1:531463/94‑1 (MQ=11)
gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 2:4367222‑M1/4‑101 (MQ=255)
gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGctccgtggggtccgg < 1:2023569‑M1/98‑7 (MQ=255)
gtcgagaccctcggatcggtcggatcggtggggtcggtcgggtccgTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTTCGTCGGAtcggt < 1:2530837/91‑1 (MQ=14)
tgGGCTCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 1:1957852‑M1/3‑101 (MQ=255)
tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 2:1672585‑M1/3‑101 (MQ=255)
tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGgatccgtggggtccgtg > 2:2213516‑M1/3‑94 (MQ=255)
tcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 1:3140330/101‑1 (MQ=255)
gggatcgttcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 2:4547174/100‑1 (MQ=11)
gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:2753097‑M1/2‑101 (MQ=255)
cggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTACACTCGGTCGGGGCCGTGGGATGGGTCGGGTCAGTTGGAtcggtcg > 2:746382/1‑101 (MQ=11)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg < 2:2690769/101‑1 (MQ=11)
ggatcggtagggtcggtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 2:3550932/101‑1 (MQ=11)
ggagcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:1184687/101‑1 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGgccgtcgga > 1:1576024/1‑100 (MQ=11)
atcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat > 1:1653854/1‑99 (MQ=11)
cggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCCGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 1:4383816/1‑101 (MQ=11)
cgggcggggccgtgggctgggtcggggccgtgggctCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:3234614/101‑1 (MQ=11)
tcggatccgtgggatcggtcgggtcggtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg < 2:2064051/101‑2 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCTGTCGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGGTTGGTCGGATGCGtgg > 2:29037/1‑99 (MQ=11)
cgggtccgtcggggcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg < 1:1732995/101‑3 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGGCCGGGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGGGGGGTCGGTCGGATCCgcgtg > 1:4461037/1‑97 (MQ=14)
gggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAACGGGCGGGGCCGTGGGAACGGGCggggacgttgg > 2:1594157/1‑93 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGggg > 1:1333240/1‑100 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga > 1:2112567‑M2/1‑97 (MQ=255)
atccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 2:1390501/100‑1 (MQ=11)
tccgtggggtcgggcgggtccgtggggtcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 1:4110731/101‑1 (MQ=11)
ccgtgggatttgtccgctccctgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg < 2:3726582/101‑1 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgg < 1:2984970‑M2/101‑9 (MQ=255)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 1:2817207/1‑101 (MQ=14)
tgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc < 1:2347986‑M2/101‑11 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGGCCGTGGGAtcgggggg > 2:4031461/1‑97 (MQ=11)
cggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc < 2:1003972‑M2/101‑17 (MQ=255)
ggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccg > 1:3425158/1‑101 (MQ=11)
gtcgggtccgtgggttctgttgaATCCGTGGGATCCGTCAGATCCGTGCGATCGTTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt < 2:3043192/101‑1 (MQ=11)
gtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGgtcggatccgg > 2:4435086/1‑100 (MQ=11)
tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtc < 1:125622/101‑1 (MQ=11)
tcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtc < 2:2294052/101‑1 (MQ=255)
gcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtc < 1:586132/100‑1 (MQ=11)
cgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgggg > 2:3468085/1‑98 (MQ=11)
cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcg < 2:3137914/101‑1 (MQ=255)
gggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTAGGTCGGGCCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg > 1:3971322/1‑101 (MQ=11)
ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg > 2:3658674/4‑101 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg > 1:3760059/4‑101 (MQ=255)
gatccgtaggatgggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg < 1:1003866/99‑1 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtc < 1:2740636‑M2/101‑25 (MQ=255)
cggtggggtccgtgggGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgggtcc < 1:4191315/99‑1 (MQ=11)
ccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtcc < 2:3969085/101‑1 (MQ=11)
cgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcag < 1:3661487‑M2/101‑27 (MQ=255)
gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt > 1:456166/1‑101 (MQ=14)
gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtggggtcggt > 1:1820643/1‑101 (MQ=14)
tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtc > 2:1280464/1‑100 (MQ=11)
gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGCCCGGGcgggtcgctggcgtccgtcg > 2:2145995/1‑99 (MQ=1)
ggacccctgcgATCCTTGGGATTGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgg < 2:654023/91‑1 (MQ=1)
ggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGa < 2:4103016/96‑1 (MQ=11)
atcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt < 2:2452509‑M2/101‑33 (MQ=255)
cggtcggATCCGTGAGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtcc < 2:1211072/101‑2 (MQ=11)
gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGTCCGTCGGAtccgt > 1:661608/1‑101 (MQ=11)
tcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtg < 2:2547243‑M2/101‑38 (MQ=255)
cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTGCGGGGGGTCGGTGGGAtccgtgg > 2:521604/1‑99 (MQ=11)
gtcggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt < 2:4651814/94‑1 (MQ=17)
aTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtgggatccgtggggt < 1:2896304‑M2/101‑42 (MQ=255)
aTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggagcggtcggatccgtggggt < 1:2171501‑M2/101‑42 (MQ=255)
tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatc > 1:2240076‑M2/1‑59 (MQ=255)
ccGTGGGATCGGTCGCCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg > 2:2625692‑M2/1‑58 (MQ=255)
gTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt < 1:3493373‑M2/101‑46 (MQ=255)
aggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGCTCCGTGGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg > 2:3377988/2‑99 (MQ=11)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg < 1:3323288‑M2/101‑49 (MQ=255)
ggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg > 1:2437902/1‑101 (MQ=255)
gATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgga > 2:427392‑M2/1‑52 (MQ=255)
gATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCGGTGGGGtcggtcggggaagagggg > 2:3902843/1‑91 (MQ=14)
ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccg < 1:825668‑M2/101‑54 (MQ=255)
tgggaatcGTGGGATCCGTCGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:3842508/94‑1 (MQ=18)
tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg < 1:4054670‑M2/101‑56 (MQ=255)
tcaaggccGTCGGATCGGTTGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:2993356/95‑1 (MQ=17)
ggggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg > 1:904153‑M2/2‑45 (MQ=255)
gggTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg > 2:1493871‑M2/1‑44 (MQ=255)
gggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGCCGGAtcggtccg > 1:1075131/1‑99 (MQ=14)
tCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTc > 1:3916564/1‑101 (MQ=17)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg > 1:3041360‑M2/1‑40 (MQ=255)
cGTGGGATCTGGCGGACCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCg < 2:3319341/101‑1 (MQ=2)
gcgggACCGGTCGGACCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGt < 2:915994/99‑1 (MQ=17)
tcggatCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtc < 2:1909496‑M2/99‑65 (MQ=255)
cgggtcggtcggATCGGTGGGATCTGTCGGGTCCGTCGGCTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 2:585884/97‑1 (MQ=14)
aTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTggggt > 1:4309263/1‑100 (MQ=18)
|
GCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTG > NC_014034/221933‑222132
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|