| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,057 | 0 | G→A | 14.1% | 0.0 ‑5.8 ‑0.1 | 1250 | D200D (GAC→GAT) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has biased read strand distribution supporting polymorphism. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (57/120): ref base (474/598): total (531/719) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.06e-03 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.84e-01 | ||||||||||
Only 100 of 1780 total aligned reads displayed.
GATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGC > NC_014034/221957‑222157
|
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATGTGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg > 1:4004923/1‑101 (MQ=14)
gtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGGCGGGGCCGTGGGATCGGCCGGGCCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCgggc > 1:2691363/5‑100 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGgggg > 2:164985/1‑100 (MQ=11)
tctgtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc < 1:3880178/95‑1 (MQ=11)
tcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc > 2:1455323/1‑101 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 1:810817/1‑101 (MQ=11)
ggttgtgtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCg < 2:2342733/95‑1 (MQ=11)
ctggggcccgtgggatccgccgggtccgtgggatcggtcGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt < 2:4352146/98‑1 (MQ=11)
tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcagTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg > 2:393313‑M2/1‑100 (MQ=255)
tcgggtcagcgggagccgtcgcgtcctggggatcggGTGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg < 1:4454835/101‑2 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 1:2357075‑M2/101‑3 (MQ=255)
cggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGTTCCGtgg > 1:3787526/1‑99 (MQ=11)
cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg > 1:583627/1‑99 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGgg > 1:3951036/1‑101 (MQ=11)
gggccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga > 1:1925770‑M2/1‑97 (MQ=255)
gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGACGGGTCGGTGGGATAGGTCGGGTCCgagggt > 2:4087456/3‑96 (MQ=11)
gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTTGGATCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAt < 1:3393570/101‑1 (MQ=14)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg < 1:1457068‑M2/101‑8 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGTTCGTTGGGAGCGCTCAGATCCGTGGGAtcg > 2:3845194/1‑101 (MQ=11)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 1:2815577/1‑101 (MQ=11)
tgggatcggtcggggccgtgggatcggtctgATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc > 1:531521‑M2/1‑91 (MQ=255)
ggggatcggtcggatcggggggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtc < 1:1619032/100‑1 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGTGGGGTCGGTCGGATGCATGGGATCGGCCGGGTCCCCGGGAtcggtcg > 1:3219/1‑101 (MQ=14)
atcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGttgggcggaa > 2:3721821/1‑99 (MQ=11)
cggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc > 2:2874051/1‑101 (MQ=11)
ccgtggggtcggtggggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtcc < 1:886506/96‑1 (MQ=11)
gtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTGGGATGGGGCGGGTCGGTGGGGTGGgtcggatccgg > 2:4009477/1‑100 (MQ=11)
tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggcccgtc > 1:4085712/1‑101 (MQ=11)
tcgggtccggggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccgtg < 2:1176909/101‑2 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggccgggtccgtgg < 2:3460611‑M2/101‑21 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg > 1:3034834/4‑101 (MQ=11)
ggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg > 1:3551190/4‑101 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggga < 2:61839‑M2/101‑23 (MQ=255)
gatccgtaggatgggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg < 1:1003866/99‑1 (MQ=11)
gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgggtccgtgggat < 2:2497166‑M2/101‑24 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtggggt > 1:1544131‑M2/1‑78 (MQ=255)
ccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc > 1:2753295/1‑101 (MQ=14)
gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt > 1:456166/1‑101 (MQ=14)
gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggggccgtgggatcggt < 2:1340928‑M2/101‑28 (MQ=255)
tgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc < 1:2184459‑M2/101‑29 (MQ=255)
tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtc > 1:2104185/1‑100 (MQ=11)
gcgggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTg < 2:3198379/93‑1 (MQ=11)
ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgg > 2:2264653‑M2/1‑71 (MQ=255)
gatcggtcggGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGa < 1:438138/101‑1 (MQ=14)
ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg < 1:3692936‑M2/101‑36 (MQ=255)
ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg > 1:2967106/1‑101 (MQ=11)
gccggGTCCGTGGGAGCTGTCGGCTCCGTGCGTTCGCGCGGCTCCGTCGAATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggt < 2:1933650/99‑1 (MQ=9)
tcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGAGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgcg > 2:2187344/1‑97 (MQ=11)
cggGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg > 1:2015506‑M2/1‑63 (MQ=255)
gggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGtcgggcgg > 2:2434580/4‑101 (MQ=14)
ggtccGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga > 1:64014‑M2/3‑61 (MQ=255)
aTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtgggatccgtggggt < 1:2896304‑M2/101‑42 (MQ=255)
aTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt > 1:1705289/1‑101 (MQ=11)
tCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGACGGATCCGTGGGATCGTTCGGGTCCGCCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 1:1185119/101‑1 (MQ=14)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg < 1:3289917‑M2/101‑45 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgg > 2:201886/1‑100 (MQ=11)
tcggATCCGTGGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg < 2:3645592/99‑1 (MQ=18)
tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGACCGGTCGGGTCCGTg > 2:4247650/1‑101 (MQ=11)
ggggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatctgtc > 2:2595261‑M2/2‑55 (MQ=255)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcg < 2:3544811‑M2/101‑48 (MQ=255)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg < 1:4145885‑M2/101‑49 (MQ=255)
gATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtagggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaccggtgggg < 2:1821983‑M2/101‑50 (MQ=255)
gtccgtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 2:85152/94‑1 (MQ=255)
tcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtc < 2:3034590/101‑1 (MQ=14)
ggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg > 1:2266865/2‑101 (MQ=255)
gggTCCGTGGGCTCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg > 2:2671359‑M2/1‑44 (MQ=255)
gggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTTGGGTCCGTCGGAtcggtcgg > 2:125608/1‑101 (MQ=17)
ggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggg < 2:73771‑M2/101‑58 (MQ=255)
gTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTGGGGt > 1:968497/1‑101 (MQ=14)
tCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc > 1:3468240‑M2/1‑41 (MQ=255)
ccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggntccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg < 1:2549806‑M2/101‑62 (MQ=255)
cGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg < 1:1769055‑M2/101‑63 (MQ=255)
tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc < 2:4159407‑M2/101‑65 (MQ=255)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg > 2:2933530‑M2/1‑36 (MQ=255)
gtcggttggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGc < 1:722414/100‑1 (MQ=255)
tcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatc < 1:3641430‑M2/101‑70 (MQ=255)
cggtcggATCCGTGGGCGCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcg < 2:2805045/101‑5 (MQ=14)
cggATGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggtatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg > 2:4603997‑M2/1‑27 (MQ=255)
ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggtcgg > 1:4652115/1‑92 (MQ=14)
aTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggat > 1:125383‑M2/1‑24 (MQ=255)
tccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatc > 1:2434746‑M2/1‑23 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggt > 2:3130816/1‑101 (MQ=255)
ttggACCGGTGGGGCCGGTGGCATCGGTCGAGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtctgtc < 2:49212/99‑1 (MQ=18)
ggatcggtcgtgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgg > 2:924451‑M2/1‑17 (MQ=255)
ggATCGGTCGGGTTCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtcgg < 1:3128357/101‑1 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggat > 2:1060221‑M2/1‑15 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggat < 1:1070100‑M2/101‑87 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatc > 1:4213216‑M2/1‑14 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatcc > 2:4427076‑M2/1‑13 (MQ=255)
cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTTGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCg < 2:15763/101‑1 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccg < 2:2112417‑M2/101‑90 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccg < 1:2632152‑M2/101‑90 (MQ=255)
ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGc > 2:1720676/1‑101 (MQ=255)
tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg < 2:4502122‑M2/101‑92 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg < 2:2725255‑M2/101‑94 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggga > 2:564986‑M2/1‑7 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtggga < 2:337334‑M2/101‑95 (MQ=255)
gttcgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat > 2:3289672‑M2/1‑6 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggat > 1:4296279‑M2/1‑6 (MQ=255)
gTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgc > 1:1347498/1‑101 (MQ=255)
|
GATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGC > NC_014034/221957‑222157
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 14 ≤
ATCG
< 22 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|