| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,395,497 | C→G | 17.6% | intergenic (+309/‑622) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,395,497 | 0 | C→G | 17.6% | 107.8 ‑0.1 ‑2.0 | 239 | intergenic (+309/‑622) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (23/19): ref base (103/94): total (126/113) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.65e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e-02 | ||||||||||
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
TGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAA > NC_014034/1395397‑1395597
|
tGCCCCCGCTGGCCCTGGGGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAc < 1:4646387/101‑1 (MQ=255)
tGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAc > 2:3542194/1‑101 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtgt < 2:2888007/101‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTc < 2:60773/101‑1 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGc > 1:2693398/1‑101 (MQ=255)
ccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccccc < 1:2061497/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc < 2:939740/101‑1 (MQ=255)
gCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcgc > 1:2358714/1‑101 (MQ=255)
ccGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcgcg < 2:3344091/101‑1 (MQ=255)
cggtgatcggtgatCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgg > 2:1593180/1‑101 (MQ=255)
cggtgatcggtgatCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgg < 2:2759015/101‑1 (MQ=255)
gtgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgggg > 2:708537/1‑101 (MQ=255)
gtgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgggg > 2:508400/1‑101 (MQ=255)
tgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCggggg > 2:2701713/1‑101 (MQ=255)
atcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCg < 1:3220934/101‑1 (MQ=255)
tcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGt < 2:4051398/101‑1 (MQ=255)
tcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGt < 2:4549414/101‑1 (MQ=255)
ggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg > 2:54828/1‑101 (MQ=255)
cgctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa > 1:1953227/11‑101 (MQ=2)
gctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt > 1:3650513/10‑101 (MQ=2)
gatcAGCGGTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:4224377/101‑1 (MQ=255)
ggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa < 2:250422/95‑1 (MQ=2)
ggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 1:4081883/7‑101 (MQ=2)
atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 2:3502707/101‑1 (MQ=255)
atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:1456295/101‑1 (MQ=255)
atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:1371864/101‑1 (MQ=255)
cAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 1:291522/101‑1 (MQ=255)
cAGCGGTCCCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGGTCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCAACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 1:2300515/101‑1 (MQ=255)
acgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 2:3884376/97‑1 (MQ=2)
cgtgtgcaccccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACGCCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCGCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc < 2:2539883/91‑1 (MQ=2)
aGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 2:4635004/1‑101 (MQ=255)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa < 1:476068/99‑1 (MQ=2)
tggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACag > 1:4272097/2‑100 (MQ=2)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACagc > 2:2488923/1‑99 (MQ=2)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt < 2:3591163/101‑1 (MQ=255)
ggTCGCGCCCCCCGCGGGGTCGTGGATCCAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt < 2:1963641/101‑1 (MQ=255)
ggTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt < 1:2210832/101‑1 (MQ=255)
tCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctt > 1:3671143/1‑100 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgcttt > 2:1315789/1‑99 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtctc > 1:1303414/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttc < 2:2351041/101‑4 (MQ=2)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttc > 1:959619/1‑98 (MQ=2)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGT.TACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttc > 1:1533124/1‑98 (MQ=0)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttca < 1:898733/101‑5 (MQ=2)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCgg < 1:3479402/101‑1 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCCTGGATCGAAACATCTCgg > 2:796291/1‑101 (MQ=255)
cccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaa < 2:3707979/100‑6 (MQ=0)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTg < 1:4032220/101‑1 (MQ=255)
cccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaatg > 2:2795852/1‑94 (MQ=2)
cccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaatg > 1:4473903/1‑94 (MQ=2)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaatgg > 1:3929405/1‑93 (MQ=2)
cccGTGGGGGCGTGGATCGAAATATCGCCGCTTTGGCGGTCGCCAGGCTGGTAACGTGTCGTTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCg < 2:4391808/101‑1 (MQ=38)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCg < 2:1716733/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGt > 2:1986835/1‑101 (MQ=255)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGt > 1:3353402/1‑101 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTc < 1:2461843/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCg < 1:2564903/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCg < 1:1837562/101‑1 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCt > 2:3386569/1‑101 (MQ=255)
ggggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTc > 1:1514033/1‑101 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCg > 1:4619194/1‑101 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCg < 1:564219/101‑1 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCg > 2:209327/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGt < 2:1764722/101‑1 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGt < 1:3457801/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTcc > 1:3868931/1‑101 (MQ=255)
cGTCGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTcc > 2:311519/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCa > 1:662404/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGcc < 1:2816088/101‑1 (MQ=255)
tCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCgg > 1:4320464/1‑101 (MQ=255)
cGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGc > 1:3551084/1‑101 (MQ=255)
gAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGcc > 2:1424380/1‑101 (MQ=255)
aaCATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTg > 1:2499513/1‑101 (MQ=255)
aaCATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGGAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTg > 1:4133367/1‑101 (MQ=255)
cATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAGCTCCGTGCCGTAGCTCGTCCCGCCTGCCTgtt > 2:3441500/1‑99 (MQ=37)
aTCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtc < 2:1849123/101‑1 (MQ=255)
aTCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtc > 1:4386843/1‑101 (MQ=255)
aTCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtc < 2:3750842/101‑1 (MQ=255)
tCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcg < 2:2102500/101‑1 (MQ=255)
cgccgcTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgt < 1:4364852/101‑1 (MQ=255)
cgcTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGc > 1:424543/1‑101 (MQ=255)
cTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTc < 1:30670/101‑1 (MQ=255)
cTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTc < 2:4300622/101‑1 (MQ=255)
tttGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcc < 2:1550479/101‑1 (MQ=255)
tGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcccc > 2:1019099/1‑101 (MQ=255)
ggCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTccccc > 2:3191718/1‑101 (MQ=255)
gCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcccccc > 2:1489786/1‑101 (MQ=255)
cGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCggg > 2:4240508/1‑101 (MQ=255)
cGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCggg < 1:508448/101‑1 (MQ=255)
gACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCgggg > 1:4581691/1‑101 (MQ=255)
gACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCcggg > 1:2991581/1‑101 (MQ=255)
ggCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGt < 2:1225069/101‑1 (MQ=255)
ggCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGt > 2:816858/1‑101 (MQ=255)
cTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg < 2:2986178/101‑1 (MQ=255)
gctaccGTGTCGCCCCCCACGCGGGGGCGGGTGCCGAACCACCTCGGTGCCGACGCTTGTCCAGCCGGCCTGCTCGCCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:1098424/96‑1 (MQ=19)
gTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:2264359/101‑1 (MQ=255)
gTAACGGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATCGAAGCATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:806146/101‑1 (MQ=255)
tAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 1:641422/1‑101 (MQ=255)
aaCGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 2:363133/1‑101 (MQ=255)
cGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 2:662342/101‑1 (MQ=255)
|
TGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAA > NC_014034/1395397‑1395597
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|