| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 681,501 | A→C | 26.1% | R702R (CGT→CGG) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 681,501 | 0 | A→C | 26.1% | 160.1 ‑3.3 ‑1.2 | 226 | R702R (CGT→CGG) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (22/38): ref base (88/78): total (110/116) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.51e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.84e-02 | ||||||||||
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
CAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCG > NC_014034/681402‑681601
|
cagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGAc < 2:23854/101‑1 (MQ=255)
cagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGAc > 2:1492412/1‑101 (MQ=255)
agcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGAcg < 2:3460454/101‑1 (MQ=255)
cGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGcgcc > 1:424765/1‑101 (MQ=255)
agagCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCgccgcc > 1:2995339/1‑101 (MQ=255)
agagCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCgccgcc > 2:28866/1‑101 (MQ=255)
cgcCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTgcg < 2:2278728/101‑1 (MQ=255)
cGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcg > 1:109252/1‑101 (MQ=255)
tCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgtc < 2:2791967/101‑1 (MQ=255)
cgcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCgtcgtc > 1:3846367/1‑101 (MQ=255)
gcTGATCTGCGCCAGCTCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCa < 1:4392501/101‑1 (MQ=255)
gcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCa > 2:177063/1‑101 (MQ=255)
gtGACCTGCGCCAGCTCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAg < 2:4567994/100‑1 (MQ=255)
tGATCTGCGCCAGATCCGCGGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc > 2:2594700/1‑101 (MQ=255)
tGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc > 1:4382044/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAggg > 1:2286080/1‑99 (MQ=255)
agccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcgc < 2:501424/94‑1 (MQ=2)
aTCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGAGCCGAGCCCAGACGCGCCGGCTGCCACGTCGTCAgcgc > 2:2780064/1‑101 (MQ=25)
gccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGcc < 1:3896678/95‑1 (MQ=2)
cTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa < 2:3555257/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa < 1:2866079/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc < 2:4500227/101‑1 (MQ=255)
cgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc < 1:1572588/97‑1 (MQ=2)
gcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACg < 1:513803/98‑1 (MQ=2)
cccAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt < 1:870736/100‑1 (MQ=255)
cAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGt > 1:1467419/1‑101 (MQ=255)
aGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTc < 1:4219847/101‑1 (MQ=255)
gacccgccgCCCCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa < 1:1641566/98‑1 (MQ=255)
aTCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGACAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTcct > 2:2318498/1‑99 (MQ=255)
tCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATc > 1:2728406/1‑101 (MQ=255)
cggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCCCGATGTCATCGGTg > 2:2957314/9‑101 (MQ=9)
cggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTg < 2:1107852/93‑1 (MQ=9)
ggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc > 2:2166681/8‑101 (MQ=9)
ggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc > 2:3986805/8‑101 (MQ=9)
cgccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc > 1:2114349/1‑101 (MQ=255)
cgccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc < 2:336626/101‑1 (MQ=255)
gtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc < 1:262082/95‑1 (MQ=9)
gtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc > 2:773499/7‑101 (MQ=9)
ttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCTCCACGATGTCATCGGTGccga < 2:219624/97‑3 (MQ=9)
cTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaa > 1:2082330/1‑101 (MQ=255)
tccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgag < 1:2825950/98‑4 (MQ=9)
tCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa > 2:4027787/1‑101 (MQ=255)
ccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgagg < 2:332547/99‑5 (MQ=9)
cGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAg > 2:2554466/1‑101 (MQ=255)
caGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgaggc > 1:1743236/2‑96 (MQ=9)
aGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGcc < 2:3846082/101‑1 (MQ=255)
aGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcc > 2:270665/1‑101 (MQ=9)
aGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGC.CAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcc > 1:1259292/1‑101 (MQ=2)
gcgcCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccc < 2:4083528/101‑2 (MQ=9)
gcgcCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccc < 1:586247/101‑2 (MQ=9)
cgccgcAACCTGCGTGCGCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccct < 2:867686/101‑3 (MQ=2)
gccgcGATCTGCGTGCTGGTCCGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCcgcg < 2:2013009/101‑1 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCcgcg > 1:1388195/1‑101 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCcgcg > 2:2669985/1‑101 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCcgcg > 2:2504900/1‑101 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCcgcg > 2:4420740/1‑101 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCcgcg < 1:4316790/101‑1 (MQ=255)
gccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccctt < 1:3693229/101‑4 (MQ=2)
gccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccctt < 2:3292091/101‑4 (MQ=9)
gccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccctt < 1:667447/101‑4 (MQ=2)
gccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccctt < 2:3957563/101‑4 (MQ=9)
cccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccctt < 2:2828514/100‑4 (MQ=2)
cgcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGa < 1:1554733/101‑1 (MQ=255)
cgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATc < 1:3662809/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg < 2:3503218/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg > 1:814188/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgc > 1:4453877/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgc < 1:2143054/101‑1 (MQ=255)
cTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgccg < 1:1115076/101‑1 (MQ=255)
gTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGCCGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGt < 1:4079524/101‑1 (MQ=255)
gCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGc > 1:3409667/1‑101 (MQ=255)
cTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGcc > 1:2790705/1‑101 (MQ=255)
tGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGccc > 1:914778/1‑101 (MQ=255)
ggTCGGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa < 1:243664/101‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa > 2:1270008/1‑101 (MQ=255)
ggTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa < 2:2995110/101‑1 (MQ=255)
cgcgcCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATTGCCGCCGTGCCCAGcgccg > 1:2643352/1‑101 (MQ=255)
cccgcCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGcgccg < 2:1032194/99‑1 (MQ=255)
gcCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCa > 1:2191635/1‑101 (MQ=255)
gcCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCa > 2:1409090/1‑101 (MQ=255)
gcCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCa > 1:1782283/1‑101 (MQ=255)
gcCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCa > 1:4553438/1‑101 (MQ=255)
g.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCg > 1:3936529/1‑101 (MQ=255)
acacgggctgAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGt > 2:3768488/10‑101 (MQ=255)
cggcgcGGAGCCCAGCCGCCCGTCCTGGGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCTCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCg < 2:4254640/99‑1 (MQ=25)
cTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCg < 1:2214606/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGc > 1:4193086/1‑101 (MQ=255)
gcgcCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGcc < 1:2903853/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGcc < 2:3205687/101‑1 (MQ=255)
cgcCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCg > 2:1166015/1‑101 (MQ=255)
gcCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGa > 2:418317/1‑101 (MQ=255)
ccGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGaa < 1:1078106/101‑1 (MQ=255)
cGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCTCGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAg < 1:3252850/101‑1 (MQ=255)
gAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGc > 2:1572887/1‑101 (MQ=255)
aGCCCAGCCGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGTCACCGTCGCCGAAGcc < 2:1190596/101‑1 (MQ=255)
gCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCa > 1:4521414/1‑101 (MQ=255)
ccAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAgc < 1:2337569/101‑1 (MQ=255)
ccAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAgc < 1:401004/101‑1 (MQ=255)
gACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGcgcc > 2:4383874/1‑101 (MQ=255)
gACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGcgcc > 1:3471400/1‑101 (MQ=255)
|
CAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCG > NC_014034/681402‑681601
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|