New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_014034 221962 =417 (2.360)82 (0.460) 40/156 9.7 0.22 coding (695/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
?NC_014034 = 222128 180 (0.800)coding (529/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
Rejected: Position hash score below cutoff.

Only 100 of 1190 total aligned reads displayed.

GGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTC.GGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGT  >  NC_014034/221862‑222062
                                                                                                    |                                                                                                     
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcgg                                                                                                       <  1:1526436‑M1/7‑1 (MQ=255)
       gACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtc                                                                                                <  2:1767963/101‑1 (MQ=255)
         cacCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccg                                                                                              <  2:3812482/101‑1 (MQ=255)
          acCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgg                                                                                             >  1:3507360/1‑100 (MQ=255)
            cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                                                                           >  2:2312270‑M1/83‑101 (MQ=255)
            cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcagtgggatgggtcgggtccgtgg                                                                                           <  1:3849933‑M1/19‑1 (MQ=255)
              gcGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtggga                                                                                         <  2:885941/100‑1 (MQ=255)
                gCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                                       <  2:4041019/101‑1 (MQ=255)
                 ccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                      >  2:3284225‑M1/78‑101 (MQ=255)
                 ccGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                      <  2:2391339/101‑1 (MQ=255)
                  cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                                     >  2:816626‑M1/77‑101 (MQ=255)
                   gtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                                    <  1:1004475‑M1/26‑1 (MQ=255)
                   gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                                                                                    <  2:2223148‑M1/26‑1 (MQ=255)
                     gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                                                  <  2:652153‑M1/28‑1 (MQ=255)
                           ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccg                                                                            <  1:4329376‑M1/34‑1 (MQ=255)
                           ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccg                                                                            <  2:3981596‑M1/34‑1 (MQ=255)
                             gtgggttcgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                                                                          >  1:980745‑M1/66‑101 (MQ=255)
                               ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                                        <  2:735688‑M1/38‑1 (MQ=255)
                                tggtggTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGAtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                                                       <  1:534991/101‑1 (MQ=255)
                                 gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccttgggatcgggcgggtccgtgggcg                                                                      <  2:2538724‑M1/40‑3 (MQ=255)
                                   ccgtggggtccgtcggctccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                    >  2:1050186‑M1/60‑101 (MQ=255)
                                    cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                   >  1:635250‑M1/59‑101 (MQ=255)
                                     gtgggatcggtcgggtcggtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                  >  2:948868‑M1/58‑101 (MQ=255)
                                     gggggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                  >  1:3285926‑M1/58‑101 (MQ=255)
                                        aGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                               <  2:1567353/101‑1 (MQ=255)
                                          cGTCGCCGGGTCGCGCTCATCGGCGGTGGGCGGCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                             <  1:1304708/101‑1 (MQ=255)
                                            cggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                           >  1:3353720‑M1/51‑101 (MQ=255)
                                              gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgg                                                         <  2:3655935‑M1/53‑2 (MQ=255)
                                              gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgg                                                         <  2:2669032‑M1/53‑2 (MQ=255)
                                              gCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                         <  1:342407/101‑1 (MQ=255)
                                               tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                        <  2:576058‑M1/54‑1 (MQ=255)
                                               gcggatccgtgggatcggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                        >  1:4019863‑M1/48‑101 (MQ=255)
                                               ccGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                        >  2:3874188/1‑101 (MQ=255)
                                                cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                       <  1:2603438‑M1/55‑1 (MQ=255)
                                                cGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                       <  1:4137912/101‑1 (MQ=255)
                                                  ggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                     <  1:119791‑M1/57‑1 (MQ=255)
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                                                       gtgggagcggtcgtgtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                >  2:3069976‑M1/40‑101 (MQ=255)
                                                        tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtc                                               >  1:1062679‑M1/39‑101 (MQ=255)
                                                        tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                               <  2:3451843‑M1/63‑1 (MQ=255)
                                                         ggggtcggtcgggtgcgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                              >  1:3604276‑M1/38‑101 (MQ=255)
                                                         gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                              >  2:4228481‑M1/38‑101 (MQ=255)
                                                         gggatcggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                              >  2:1185680‑M1/38‑101 (MQ=255)
                                                             tCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                          <  1:2122477/101‑1 (MQ=255)
                                                              cggtcgggtcggtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                         >  2:3151774‑M1/33‑101 (MQ=255)
                                                              cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                         >  1:2691365‑M1/33‑101 (MQ=255)
                                                               ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                        <  1:1348872‑M1/70‑1 (MQ=255)
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                                                                aCGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                       <  2:2936354/101‑1 (MQ=255)
                                                                  gggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                     >  1:734787/8‑99 (MQ=11)
                                                                  cgggtcagtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                     >  2:4361839‑M1/29‑101 (MQ=255)
                                                                   gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCggg                                    <  2:14161‑M1/74‑1 (MQ=255)
                                                                   gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                    <  2:2103896‑M1/74‑1 (MQ=255)
                                                                   gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                    >  2:3235070‑M1/28‑101 (MQ=255)
                                                                    ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGACGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                   <  2:1112287‑M1/75‑1 (MQ=255)
                                                                    gatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGCGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTcggg                                   >  2:1273889/6‑100 (MQ=11)
                                                                     gtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                  <  1:2864132‑M1/76‑1 (MQ=255)
                                                                     gtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                  >  1:3759136‑M1/26‑101 (MQ=255)
                                                                     atccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGgac                                  <  1:3675640‑M1/76‑2 (MQ=255)
                                                                      tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                 >  1:3950777‑M1/25‑101 (MQ=255)
                                                                       cggtggggtccGTGGGATCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                <  1:3119913/91‑1 (MQ=11)
                                                                        cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtcgg                               <  2:2736920‑M1/79‑1 (MQ=255)
                                                                        cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                               >  1:2925269‑M1/23‑101 (MQ=255)
                                                                         gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                              <  1:1441598‑M1/80‑1 (MQ=255)
                                                                         gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                              <  2:3933515‑M1/80‑1 (MQ=255)
                                                                          tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                             <  1:409390‑M1/81‑1 (MQ=255)
                                                                          tCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                             <  1:1116024/101‑1 (MQ=255)
                                                                            ggagcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc.gg                          >  2:2455627‑M1/19‑101 (MQ=255)
                                                                                gcggtggCTCGGTGGGGGCGGTGGGGGGGGTGGGGCCGGGAGGGGCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTC.GGGTcc                      <  1:3050787/96‑1 (MQ=9)
                                                                                 ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTC.GGATCCg                     <  2:3349846‑M1/88‑1 (MQ=255)
                                                                                 gctcggCTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGCTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTC.GGGTCCg                     <  2:2822447/97‑1 (MQ=11)
                                                                                    gcgatcggtccgGTCCGTGGCGTCGGTCGGATCCGGGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTC.GGGTCCGtcg                  <  2:148296/97‑3 (MQ=2)
                                                                                    cgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCTGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTC.GGATCCGTgg                  <  1:2305349‑M1/91‑1 (MQ=255)
                                                                                     gggtgcgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTC.GGATCCGTggg                 >  2:1328266‑M1/10‑101 (MQ=255)
                                                                                     gggtccgtgggatcggtcgggcccgtgggatcggtcggggccgtgGGATCGGGCGGGTCAGACGGATCGGACGGGTACGAGGGGTCCATC.GAATACGGggg                 >  1:2231372/10‑101 (MQ=2)
                                                                                     ggatcggtgggGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTG.GGATCCGTggg                 <  2:4103545/98‑1 (MQ=11)
                                                                                      ggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTC.GGATCCGTGGGa                <  1:2352430‑M1/93‑1 (MQ=255)
                                                                                       gtctgtgggatcggtcgggtccgtgggagcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTC.GGATCCGTGGGAt               <  1:323028/94‑1 (MQ=11)
                                                                                       gtccgtgGGGTCGGTCGGGTCCGTGGTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTC.GGATCCGTGGGAt               >  1:2509608‑M1/8‑101 (MQ=255)
                                                                                       atccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTC.GGATCCGTGGGAt               >  2:3703403‑M1/8‑101 (MQ=255)
                                                                                          cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGACCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTC.GGATCCGTGGGaacag            >  1:915925/5‑97 (MQ=11)
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                                                                                           gtcggGTCGGGGGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTC.GGGTCCGTGGGAtcggt           <  1:2052559/101‑1 (MQ=11)
                                                                                           gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTC.GGATCCgaccgatccca           <  2:4322508/101‑11 (MQ=255)
                                                                                            tggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTG.GGATCCGTGGGAtcggtc          <  2:3554516/93‑1 (MQ=14)
                                                                                            tggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCGGTG.GGGGCCGTGGGAtcgggg          >  2:1999071/9‑99 (MQ=11)
                                                                                            tgggattggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTC.GGATCCGTGGGAtcggtc          <  2:1646815/99‑1 (MQ=11)
                                                                                             ggtatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTC.GGGTCCGTGGGAtcggtcg         <  1:4390782/98‑1 (MQ=11)
                                                                                             gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTC.GGATCCgtgggatggggcg         <  1:1717731‑M1/100‑7 (MQ=255)
                                                                                             cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGC.GGGTCCGCCGGAtctgtcg         >  1:3183817/1‑101 (MQ=11)
                                                                                              gggtcggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTC.GGATCCGTGGGAtcggtcgg        <  1:826161/98‑1 (MQ=11)
                                                                                               gatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTC.GGATCCGTGGGAtcggtcgga       >  1:1649244/1‑100 (MQ=11)
                                                                                                gtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTG.GGATCCGTGGGGTCGGTCGGGt      >  1:4245885/5‑101 (MQ=14)
                                                                                                atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtctgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCAGTGGGATCGCTC.GGATCCGTGGGAtggggcggtt      >  1:2756505/1‑99 (MQ=14)
                                                                                                  cggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTC.GGGTCCGTGGGAtgggtgggagac    >  2:1833545/1‑97 (MQ=11)
                                                                                                  cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTC.GGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc    <  2:454772/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                   ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGTCCGTC.GGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg   >  1:1788723/1‑101 (MQ=14)
                                                                                                   ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTC.GGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCCg   >  1:198961/1‑101 (MQ=11)
                                                                                                   ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTC.GGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg   <  2:2632123/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                    gtcgggtccgtgggatcggtggggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGTCCGTCGGGATCCG.GGGGTTGGGCGGGTcccg  >  1:477624/1‑99 (MQ=11)
                                                                                                    |                                                                                                     
GGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTC.GGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGT  >  NC_014034/221862‑222062

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 15 ≤  ATCG  < 23 ≤  ATCG  < 31 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG