| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 221,961 | 0 | G→C | 6.2% | 63.0 ‑5.5 ‑2.8 | 518 | T232T (ACC→ACG) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (24/10): ref base (217/267): total (241/277) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.16e-03 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.58e-03 | ||||||||||
Only 100 of 1147 total aligned reads displayed.
CGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCG > NC_014034/221861‑222061
|
cGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcg < 1:3387036/101‑1 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt < 2:1083217‑M1/8‑1 (MQ=255)
cccGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgg > 1:2323019/1‑101 (MQ=255)
ccGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcggg < 1:2030949/101‑1 (MQ=255)
gtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggt < 1:2639566‑M1/13‑1 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt < 2:1561823‑M1/13‑1 (MQ=255)
cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtcg < 1:561009‑M1/15‑2 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccg < 2:3930193‑M1/16‑1 (MQ=255)
cacCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccg < 2:3812482/101‑1 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat < 1:4276627‑M1/22‑1 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc > 2:877064‑M1/79‑101 (MQ=255)
gCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatc < 2:4041019/101‑1 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatgg < 1:931482‑M1/24‑3 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg < 2:2621814‑M1/24‑1 (MQ=255)
gtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt < 1:1004475‑M1/26‑1 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggc < 1:3261733‑M1/26‑2 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggt < 1:2108107‑M1/26‑1 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg < 2:3283479‑M1/29‑1 (MQ=255)
tccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatc > 1:289118‑M1/70‑98 (MQ=255)
cGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGGGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc > 1:1344715/1‑101 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccg < 1:2957750‑M1/34‑1 (MQ=255)
ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccg < 2:3981596‑M1/34‑1 (MQ=255)
gtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaccgggcgggtccgtggaatcggtcgggtccgg < 2:1219749‑M1/35‑2 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgg < 2:3873615‑M1/37‑1 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg < 1:1712135‑M1/38‑1 (MQ=255)
ggtccgtcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggc < 1:129227‑M1/39‑2 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccttgggatcgggcgggtccgtgggcg < 2:2538724‑M1/40‑3 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc > 2:1147160‑M1/57‑101 (MQ=255)
tgggagcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc > 1:404489‑M1/57‑101 (MQ=255)
aGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGgtccgtgggatcgggcggggccgtgggatcggtcgg > 2:800779/1‑101 (MQ=255)
gCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGa > 1:1946164/1‑101 (MQ=255)
cGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAt > 2:3217367/1‑101 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt < 1:1516481‑M1/49‑3 (MQ=255)
gtcggatcggtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 1:2299270‑M1/49‑101 (MQ=255)
gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgg < 2:2669032‑M1/53‑2 (MQ=255)
gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaacggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 1:3815086‑M1/49‑101 (MQ=255)
ccGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg < 1:662528/101‑1 (MQ=255)
ggtccgtgtggtcggtcgggtccgtgggaccggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa > 2:1009113‑M1/45‑101 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa > 2:4099953‑M1/45‑101 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGa < 1:119791‑M1/57‑1 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg < 2:223599‑M1/60‑1 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 2:1919223‑M1/62‑1 (MQ=255)
gtgggagcggtcgtgtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 2:3069976‑M1/40‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtc > 1:1062679‑M1/39‑101 (MQ=255)
gcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 1:387690/1‑101 (MQ=255)
gggatgggtcggctccgttggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg > 2:4438679‑M1/38‑101 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccttgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:1464834‑M1/38‑101 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:495950‑M1/65‑1 (MQ=255)
gtcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcggtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt > 1:2462516‑M1/35‑101 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt > 2:3657695‑M1/35‑101 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcggggc < 2:231927‑M1/68‑3 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 1:4146503‑M1/33‑101 (MQ=255)
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cgggtctgtgggatcggtcgggtccgggGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg > 1:3719446‑M1/29‑101 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGCATCGGTCGGATCCGTggg < 1:4427127‑M1/74‑1 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt > 2:641449‑M1/26‑101 (MQ=255)
tccGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtc < 1:2212989/99‑1 (MQ=11)
ggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATAGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtg > 1:3971212/1‑100 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg > 1:3459657‑M1/24‑101 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg > 1:1439793‑M1/24‑101 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtcgg < 2:2736920‑M1/79‑1 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg < 2:945697‑M1/79‑1 (MQ=255)
cgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg < 2:4356026‑M1/79‑1 (MQ=255)
gggggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 1:255698‑M1/22‑101 (MQ=255)
tCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 1:1116024/101‑1 (MQ=255)
tgtttccGTGGGATCCGTCGGTTCCGTGGGATCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtcg < 2:2393703/95‑1 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 1:3656188‑M1/20‑101 (MQ=255)
ggagcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 2:2455627‑M1/19‑101 (MQ=255)
gatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggtcggg < 2:1820332‑M1/84‑2 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGgatcggtcgggt < 2:4219528‑M1/85‑3 (MQ=255)
ccgtcgtatcgggcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATcg < 2:732361/93‑2 (MQ=14)
ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg < 2:3349846‑M1/88‑1 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg > 1:851978‑M1/14‑101 (MQ=255)
ggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 1:3211912‑M1/88‑1 (MQ=255)
gctcggCTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGCTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 2:2822447/97‑1 (MQ=11)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 2:1387222/1‑101 (MQ=1)
cgtgtccgtccgATCGGTCGGCTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTCGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTgg < 2:4311998/94‑1 (MQ=11)
gttccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa < 2:557347/93‑1 (MQ=11)
gatcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGACGGGTCCGTCGGa > 1:1784224/3‑101 (MQ=1)
cTCGGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 1:4104342/101‑1 (MQ=255)
tccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc > 1:1860153‑M1/7‑101 (MQ=255)
gccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc > 1:2737110‑M1/7‑101 (MQ=255)
cggtgtgatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcc < 2:1615586/95‑2 (MQ=11)
cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg > 2:3434638/1‑101 (MQ=255)
cgtggtatcggtcgggtccgtgggatcggtcgagtccgtgggGGCCGTCGGATGCGTTGGATCGGTCGGAGCCCTGGGATCAGTCCGATCCGCGGGAtcgt > 1:307578/7‑100 (MQ=2)
cgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtcgg > 2:1739849/2‑101 (MQ=11)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGGGGGCGCGGTGGGGCCCGGGGGA..GGTCGGGGCCGTGGGGtcggccg > 2:3148337/4‑101 (MQ=2)
gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 1:2404539/1‑101 (MQ=255)
gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 1:4356727/1‑101 (MQ=255)
gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 1:3536027/1‑101 (MQ=255)
tcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtc < 1:2781630/101‑1 (MQ=11)
tcggATCCGTCGAGTCCGTCGGCGCGGTCGGGGCCGTGCGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:2112652/101‑1 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGCTACGTGGGGtccgtcg > 2:1294716/2‑101 (MQ=11)
gggatcgggcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 1:3328817/100‑1 (MQ=11)
cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg > 1:1646921/1‑101 (MQ=255)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtggGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg > 1:3147835/1‑101 (MQ=14)
gtcggtcgggtccttgtgaggggttggattcgttgtaTGGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat < 2:1991360/100‑3 (MQ=11)
caggtcgggtctgtgagttccgtcgcggccgtgggataGGTCGGCTCCGTGGCATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 2:3601288/99‑1 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATTGGTCGGATCCg > 1:75488/1‑101 (MQ=11)
ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTTGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 2:370518/1‑101 (MQ=11)
|
CGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCG > NC_014034/221861‑222061
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|