| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 221,973 | 0 | G→C | 1.0% | 1.0 ‑1.3 ‑0.0 | 544 | P228P (CCC→CCG) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: E-value exceeds prediction threshold. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (5/2): ref base (253/283): total (258/286) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.65e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Only 100 of 1458 total aligned reads displayed.
CCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCG > NC_014034/221873‑222073
|
tCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtggga < 1:478697/101‑1 (MQ=255)
aGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtc > 2:2633733/1‑101 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 1:2745384‑M1/28‑1 (MQ=255)
ggCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 2:1576670/101‑1 (MQ=255)
cTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgggggatcggtcggg > 2:2400617/1‑101 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggat > 2:325018‑M1/71‑99 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc > 1:3138304‑M1/70‑101 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatcc < 2:2866006‑M1/33‑1 (MQ=255)
tgtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg < 1:3245833/101‑1 (MQ=255)
tgtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg > 1:2342066/1‑101 (MQ=255)
tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg < 1:2484705‑M1/36‑1 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg < 2:580080‑M1/37‑1 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg < 2:67089‑M1/37‑1 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga < 1:2106105‑M1/39‑1 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcg < 2:875743‑M1/42‑1 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg > 1:2641719‑M1/60‑101 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg > 1:635250‑M1/59‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc > 2:1147160‑M1/57‑101 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtc < 1:2912686‑M1/50‑4 (MQ=255)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGt > 2:129206‑M1/49‑101 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt < 2:48966‑M1/58‑1 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGCGAtc < 1:1322027‑M1/59‑1 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCcgtggggtc < 2:1975841‑M1/59‑4 (MQ=255)
cggtgggatccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCCGGTCCGTGGGAtcg > 2:3966498‑M1/42‑101 (MQ=255)
ccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg > 1:1051091‑M1/42‑101 (MQ=255)
gcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 2:2771580/1‑101 (MQ=255)
gcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:4336675/101‑1 (MQ=255)
cTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg > 2:3080677/1‑101 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt > 2:3657695‑M1/35‑101 (MQ=255)
cggtcggggccgtgggatcggtcgggtgcgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 1:221948‑M1/33‑101 (MQ=255)
gcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg > 1:1577101‑M1/30‑101 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg < 2:2952929‑M1/73‑1 (MQ=255)
gTGGGCGGCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 2:2322869/101‑1 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa < 1:1480492‑M1/75‑1 (MQ=255)
gatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGa < 1:746514‑M1/75‑1 (MQ=255)
gatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa < 1:3665614‑M1/75‑1 (MQ=255)
gccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 2:1215941‑M1/25‑101 (MQ=255)
gCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 1:3382300/101‑1 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg > 1:3459657‑M1/24‑101 (MQ=255)
cGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTAGGGGCCGTGGGAtcgg > 2:3301221/1‑101 (MQ=255)
ggggtccGTGGGGTCGGTGGGATCGGT.GGGTCCCTGGGGTTCGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcgg < 1:950923/95‑1 (MQ=2)
ggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATACGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:3831772‑M1/83‑1 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 1:2563567‑M1/87‑1 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc < 1:3546489‑M1/87‑1 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCg < 2:4019031‑M1/88‑1 (MQ=255)
ggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGATCCg < 1:2290319‑M1/88‑1 (MQ=255)
gcgcgggcccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 2:4091726/91‑1 (MQ=11)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGAGGGTCCgg > 2:3723882/1‑100 (MQ=14)
tGGGCGCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg < 2:1807368/101‑1 (MQ=255)
cggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg < 2:1422164‑M1/91‑1 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggccgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGGCCGTGGGGTGCGTAGGAGCCGTggg > 2:3888283/10‑101 (MQ=11)
ggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa < 1:282336‑M1/93‑1 (MQ=255)
gatcggtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa < 1:895464/99‑1 (MQ=11)
ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg > 1:3742973‑M1/6‑101 (MQ=255)
ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg > 1:3028697/1‑101 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTACGTCGGACCCGTGGGGtcgg > 2:382547/5‑101 (MQ=11)
cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGCGGGAtcgg < 2:3392958‑M1/97‑1 (MQ=255)
cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGtcgg < 2:4141671‑M1/97‑1 (MQ=255)
gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 1:1661257/1‑101 (MQ=255)
ggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTGGGATCCGTGGGAtcgggcg > 2:2712978/8‑101 (MQ=11)
gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg > 1:541664/2‑101 (MQ=11)
ggaatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 1:3307112/4‑101 (MQ=11)
gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 2:2462359‑M1/100‑1 (MQ=255)
cggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAgcggggg > 2:1075154/1‑98 (MQ=11)
cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCTTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg > 1:318561/1‑101 (MQ=255)
gggtcggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg < 1:826161/98‑1 (MQ=11)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg < 1:1387319/101‑1 (MQ=11)
ggtcggtggggtgcgggggatcggtcgggtccgtggggTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg < 1:1238946/99‑1 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGGCGGGGGATCGGTCggg > 2:3458719/1‑101 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtggga < 2:2271056/101‑2 (MQ=11)
gtccgtgggttccgtggggtcggtggagtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt < 2:746434/91‑1 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGATCGGTGGGGgcgggcggcc > 2:2199545/1‑99 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtgggat < 2:1879130/101‑3 (MQ=11)
tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc < 1:4141932/101‑1 (MQ=11)
cggtcgtttgcgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 2:3510910/101‑1 (MQ=11)
cggtcgggtccgcgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc > 1:2019675/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTGGGGTCCGTGGGGGCCGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGATCGCTCGTGTCCg > 1:1129709/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTAGGGTCGGGCGGATGCGAGGGGTGGGGAGGGTCCg > 2:4250652/1‑101 (MQ=2)
gggcgggtgcgtggggtctgtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg < 1:1765835/98‑1 (MQ=11)
cgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGGTGCGTGGGATCGGGAGGGTCCg > 2:94349/2‑101 (MQ=11)
gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg > 1:4271530/1‑100 (MQ=11)
tcggatccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg > 2:2544427‑M2/1‑100 (MQ=255)
gtgttccgtgggatcgggcgggtccggggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGGCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg < 1:3888537/97‑3 (MQ=14)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCAGTTCCgcgg > 2:1338737/1‑98 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg < 2:1008754‑M2/101‑3 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg > 2:1688612‑M2/1‑99 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGtgg > 1:4100213/1‑99 (MQ=14)
cggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGtgg > 1:185306/1‑99 (MQ=11)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGGGGGATCCGtgg > 1:1004321/1‑99 (MQ=11)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg > 2:1485280/1‑99 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 1:2410063‑M2/1‑98 (MQ=255)
gggtccgtaggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGGTCCGTGGGGGCCGTGgg > 2:826079/1‑101 (MQ=11)
gtccgtgggtttcgtccggtgcgtcggacgggtcgcCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 2:3162210/101‑1 (MQ=11)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt > 1:1941616/1‑101 (MQ=11)
atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGAGATCGGTCGGGTCCGTgggat < 2:2052422‑M2/100‑6 (MQ=255)
tccgtgggatcggtaggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCCTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:4423525/101‑1 (MQ=11)
ccgtgggatcggtcgggtgcgtgggatcgggcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg > 1:4349939‑M2/1‑94 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGacgg > 1:3966754/1‑98 (MQ=14)
ccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg < 2:4416156‑M2/101‑8 (MQ=255)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 1:4018708/1‑101 (MQ=11)
|
CCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCG > NC_014034/221873‑222073
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|