BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,994	A→G	13.7%	D221D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	221,994	0	A→G	13.7%	185.5 0.0 ‑1.1	626	D221D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (44/44): ref base (272/265): total (317/309)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.70e-02

Only 100 of 1600 total aligned reads displayed.


TGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAT  >  NC_014034/221894‑222094


ggtacgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                                                                                      >  1:487674‑M1/63‑101 (MQ=255)


 atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgggggat                                                                                                     <  2:4114831‑M1/40‑1 (MQ=255)


  tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatc                                                                                                    <  1:3070992‑M1/41‑1 (MQ=255)


   ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcg                                                                                                   <  2:875743‑M1/42‑1 (MQ=255)


    cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgg                                                                                                  <  2:3646633‑M1/43‑1 (MQ=255)


    cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                                                  <  1:1115876‑M1/43‑1 (MQ=255)


           tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtc                                                                                           >  1:2107359‑M1/52‑98 (MQ=255)


             ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCg                                                                                         <  1:3361774‑M1/52‑1 (MQ=255)


             ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                         <  2:56062‑M1/52‑1 (MQ=255)


                  ggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                    <  1:119791‑M1/57‑1 (MQ=255)


                   gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                   <  2:48966‑M1/58‑1 (MQ=255)


                         gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                             <  1:4417150‑M1/64‑1 (MQ=255)


                         gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                             >  2:4228481‑M1/38‑101 (MQ=255)


                              cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                        >  2:2245077‑M1/33‑101 (MQ=255)


                              cggtcggggccgtgggatcggtcgggtgcgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                        >  1:221948‑M1/33‑101 (MQ=255)


                               ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                       <  1:1348872‑M1/70‑1 (MQ=255)


                               gACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                       <  2:4059339/101‑1 (MQ=255)


                                gtcggatcgctgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                      >  2:2874366‑M1/31‑101 (MQ=255)


                                 gcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                     >  1:1577101‑M1/30‑101 (MQ=255)


                                  cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                    <  2:2952929‑M1/73‑1 (MQ=255)


                                    ggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGa                                                                  <  2:2378565‑M1/75‑1 (MQ=255)


                                      tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCcgtggggga                                                                <  1:3289506‑M1/77‑4 (MQ=255)


                                       gCGTGGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                               <  2:3272893/101‑1 (MQ=255)


                                       gCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcg                                                               >  2:1794749/1‑101 (MQ=255)


                                          tgggatgggtcggtgccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                            >  1:3828647‑M1/21‑101 (MQ=255)


                                          tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                            <  1:409390‑M1/81‑1 (MQ=255)


                                          tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                            >  1:652221‑M1/21‑101 (MQ=255)


                                          tgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                            >  2:1573832‑M1/21‑101 (MQ=255)


                                           gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                           <  1:909539‑M1/82‑1 (MQ=255)


                                           gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGAtcggtcg                                                           <  1:2950617‑M1/82‑1 (MQ=255)


                                               tcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATc                                                       >  2:1034967‑M1/16‑101 (MQ=255)


                                                 ggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGATCCg                                                     <  1:2290319‑M1/88‑1 (MQ=255)


                                                  gtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGt                                                    <  1:3459143‑M1/89‑1 (MQ=255)


                                                  gTGGGATCGGTCGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                    <  2:2721370/101‑1 (MQ=11)


                                                    gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                  <  2:1974226/101‑3 (MQ=11)


                                                    cgtgtccgtccgATCGGTCGGCTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTCGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTgg                                                  <  2:4311998/94‑1 (MQ=11)


                                                     gggttcgtgggatgggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                 <  2:818666/92‑1 (MQ=11)


                                                      ggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                <  1:2352430‑M1/93‑1 (MQ=255)


                                                      gctccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                >  2:1374699‑M1/9‑101 (MQ=255)


                                                        tccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                              >  1:1860153‑M1/7‑101 (MQ=255)


                                                         cggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg                                             >  1:1430906/1‑101 (MQ=11)


                                                         cggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGAtcg                                             >  2:2637041/1‑101 (MQ=11)


                                                         ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                             >  1:3742973‑M1/6‑101 (MQ=255)


                                                           gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGGGGGCGCGGTGGGGCCCGGGGGA..GGTCGGGGCCGTGGGGtcggccg                                         >  2:3148337/4‑101 (MQ=2)


                                                           gtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggg                                           <  2:3877923‑M1/98‑2 (MQ=255)


                                                           gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                           >  1:3536027/1‑101 (MQ=255)


                                                           ggcggATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                           <  1:3217596/99‑1 (MQ=255)


                                                           cgcgggttggtcgggtcccgtggaacggtcggctccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                           <  2:1326639/93‑1 (MQ=11)


                                                            tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                          <  2:3993080‑M1/99‑1 (MQ=255)


                                                            tcggATCCGTCGAGTCCGTCGGCGCGGTCGGGGCCGTGCGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                          <  2:2112652/101‑1 (MQ=11)


                                                             gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                         <  2:2462359‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                             gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                         >  1:242868‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                                              gggtcggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                        <  1:826161/98‑1 (MQ=11)


                                                              gggtcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                        <  1:1942736/98‑1 (MQ=14)


                                                              ggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGAtcggccgg                                        >  1:2509837/1‑101 (MQ=11)


                                                                gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtgggat                                      <  1:2582947/100‑3 (MQ=11)


                                                                gtcggtcggatccgtggggtcggtcggatccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                      <  1:151645/100‑3 (MQ=11)


                                                                gtcgggcgggtccgtgggattggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtgggat                                      <  1:2862222/100‑3 (MQ=11)


                                                                agcgttcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                      <  2:2305204/96‑1 (MQ=11)


                                                                 tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                                     <  1:4141932/101‑1 (MQ=11)


                                                                  cgttcgggtccgtgggatcggtcgggttcgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                    <  2:3507709/98‑1 (MQ=11)


                                                                  cggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGCCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGATGGGTCGGGTcc                                    >  2:1885483/1‑101 (MQ=11)


                                                                  cggtcgggtccgtgggatttgtcgtgtccgtggcatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGTTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                    <  2:3432607/101‑1 (MQ=11)


                                                                  cggtcgggtccgcgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                    >  1:2019675/1‑101 (MQ=11)


                                                                   ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTTGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                   >  2:370518/1‑101 (MQ=11)


                                                                   ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                   >  2:3943035/1‑101 (MQ=11)


                                                                   cgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGGTGCGTGGGATCGGGAGGGTCCg                                   >  2:94349/2‑101 (MQ=11)


                                                                      cgggtccgtgggatcggtggggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                >  1:1679246‑M2/1‑99 (MQ=255)


                                                                      cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                <  2:1269919‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                                                      cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCGGTGGGGTCGGGCGGGTCCGtgg                                >  2:3796052/1‑99 (MQ=11)


                                                                      cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                >  2:1688612‑M2/1‑99 (MQ=255)


                                                                       gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                               >  2:1518275‑M2/1‑98 (MQ=255)


                                                                       gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAGCGGTCGGATCCGTCGGTTCGGTCGGGTCCgcggg                               >  2:1096629/1‑97 (MQ=11)


                                                                        ggtcggggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                              <  1:551211/101‑1 (MQ=11)


                                                                        gggccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggga                              >  1:973807‑M2/1‑97 (MQ=255)


                                                                        gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTCGGGTCGGGTGGCTCCggggga                              >  1:2691443/3‑96 (MQ=11)


                                                                         gttcgtgggagcggttgggtgcgtgggctcggtcggGTCCGTTGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                             <  2:2781592/98‑1 (MQ=11)


                                                                          tcggtgggttcggtcggttccgtcggatccgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                            <  2:1192136/98‑1 (MQ=11)


                                                                          tccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGtggtgcc                            >  2:1457650/1‑95 (MQ=11)


                                                                          tccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                            >  1:1742937/1‑101 (MQ=11)


                                                                          tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtc                            >  1:129151‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                                                           ccgtgggatcggtcgggtgcgtgggatcgggcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                           >  1:4349939‑M2/1‑94 (MQ=255)


                                                                           ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGacgg                           >  1:3966754/1‑98 (MQ=14)


                                                                              tggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGAtcggtc                        >  2:635182/1‑101 (MQ=11)


                                                                               gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGCtcggtcg                       >  1:2764250/1‑101 (MQ=14)


                                                                               gggatcgggcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                       <  2:2028579/101‑1 (MQ=11)


                                                                                ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg                      <  1:3151998‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                                                 ggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGAGGGCTCGggcggg                     >  2:441102/6‑101 (MQ=11)


                                                                                 gatcggtcggggccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggg                     >  1:735768‑M2/1‑88 (MQ=255)


                                                                                  atcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGgtggggc                    >  2:3215973/1‑100 (MQ=11)


                                                                                  atcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGgtcgggc                    >  1:1050274/1‑100 (MQ=11)


                                                                                    cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgggtcc         >  2:3051528/1‑101 (MQ=11)


                                                                                    cggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtcc                  <  1:3903303/101‑1 (MQ=255)


                                                                                       tcgggtacgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtg               <  2:3345195/101‑2 (MQ=11)


                                                                                         gggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg             <  2:2555047/101‑1 (MQ=11)


                                                                                           atccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggat           <  1:1001929/100‑3 (MQ=255)


                                                                                                tgggttccgtcggTTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtc      <  1:4250921/101‑2 (MQ=11)


                                                                                                 ggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtcg     >  2:706921/1‑99 (MQ=11)


                                                                                                  ggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg    <  1:3661202‑M2/101‑31 (MQ=255)


                                                                                                  ggatcggtcggATCCGTGGGACCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg    >  1:4021328‑M2/1‑71 (MQ=255)


TGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAT  >  NC_014034/221894‑222094

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG