BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,054	C→G	0.8%	P201P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,054	0	C→G	0.8%	7.0 ‑0.3 ‑0.3	1155	P201P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (4/7): ref base (478/665): total (483/672)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.70e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.55e-01

Only 100 of 1694 total aligned reads displayed.


TCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGT  >  NC_014034/221954‑222154


 gtggtttgtcgtgaccgtggggtcggtccggtccgcgggatccGTCCGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                     <  2:1413532/94‑1 (MQ=14)


 gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                     <  2:3670468/100‑1 (MQ=11)


 gGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                     >  2:169005‑M1/2‑101 (MQ=255)


 cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCTTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                     >  1:318561/1‑101 (MQ=255)


  ggggcggtgggatccgtggggtcggtcggggccgtgggatCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                    <  2:1784105/97‑1 (MQ=11)


   ggtccatcgggtcagtcggagcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCggg                                                                                                   <  2:4353552/95‑1 (MQ=14)


    atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtctgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCAGTGGGATCGCTCGGATCCGTGGGAtggggcggtt                                                                                                  >  1:2756505/1‑99 (MQ=14)


    atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                                                                  >  2:3756685/1‑99 (MQ=11)


       cgtcggggcggcgggctcgatcgggtctgttggctcgGGCGGGGTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                               <  1:326696/100‑1 (MQ=2)


       cgtcgggcccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                               <  2:3306880/100‑1 (MQ=14)


         tcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc                                                                                             <  1:134543/101‑2 (MQ=11)


          cgggtccgtgggatcgttcgggtccgtgggatcggcCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                                                                                            >  1:3898669/1‑99 (MQ=14)


          cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                                                            <  1:3993336/101‑3 (MQ=14)


          cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                            <  1:4149649‑M2/101‑3 (MQ=255)


          cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGtgg                                                                                            >  1:4100213/1‑99 (MQ=14)


          cgggaccgtgggatgggtcgggtccgtgaggtcggtCCGATACGTGAGATCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                                                            <  2:4243589/101‑3 (MQ=11)


           gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGGGGccttggg                                                                                           >  1:925550/1‑96 (MQ=11)


             gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggt                                                                                         >  1:3605119‑M2/1‑96 (MQ=255)


               ccgtgggatcggtcgggtgcgtgggatcgggcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                                                                       >  1:4349939‑M2/1‑94 (MQ=255)


               ccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                                                                       <  1:1417161‑M2/101‑8 (MQ=255)


                cgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                      >  2:386101/1‑101 (MQ=11)


                cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGagggg                                                                                      >  2:785057/1‑97 (MQ=11)


                cggggtgtcggttgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                      <  2:597539/94‑1 (MQ=11)


                  tgggatcggtcggttccgtcggatcggtcgtGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                    <  2:1471865/101‑1 (MQ=11)


                  tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGCGGGATCGGTCGGATCCGTGGGTTCCGTACGGTCCGTGGGGtcggac                                                                                    >  2:3402514/1‑99 (MQ=11)


                   gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                                                                   <  2:2249611‑M2/101‑12 (MQ=255)


                   gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGAtcggtcg                                                                                   >  2:1337914/1‑101 (MQ=11)


                     gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggg                                                                                 <  1:2007199‑M2/101‑14 (MQ=255)


                     gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggg                                                                                 <  1:694526‑M2/101‑14 (MQ=255)


                     gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggg                                                                        >  1:342811/1‑101 (MQ=11)


                      gtccgtggtatccgtcgggtcggtgggATCGGTCGGATCCGTTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggt                                                                                <  2:3247085/91‑1 (MQ=11)


                       tcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGCGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGcgcgggtc                                                                               >  1:557399/1‑101 (MQ=11)


                        cggtcgggtgcggggggtcgggcggATCCGTGGGACCGGGCGGGTCCCGTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                                                                              <  2:1527888/101‑1 (MQ=11)


                        cgggtgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatcc                                                                              <  1:382586/96‑1 (MQ=11)


                          gtcggatcggtgggaccggtcggAT.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGTTCGgtcgggtccgtc                                                                           <  2:4057686/101‑1 (MQ=14)


                            cgggtccctggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtgg                                                                          <  1:4047920/101‑3 (MQ=11)


                             ggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg                                                                         >  1:1725886/4‑101 (MQ=11)


                              gatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtcggggccgggggg                                                                        >  2:868217/3‑96 (MQ=14)


                               tgccgtggggtccgttggATCCGTGGGGTCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggt                                                                       <  1:780274/99‑1 (MQ=11)


                               atccgttgtatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggat                                                                       <  2:2871380/100‑3 (MQ=14)


                               atccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggat                                                                       <  1:1001929/100‑3 (MQ=255)


                                   gtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGgggggcccgtcgggtccgg                                                                   >  2:2781440/4‑100 (MQ=11)


                                    tggggtccgtaggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTACGTGGGATAGgtcgggtccgtggggtaagtc                                                                  >  1:2275210/1‑96 (MQ=11)


                                    tgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                  <  1:2166776‑M2/101‑29 (MQ=255)


                                       ggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCACGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTgggg                                                               >  1:3737297/6‑100 (MQ=11)


                                           ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccg                                                           <  2:3012049‑M2/101‑36 (MQ=255)


                                            gtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                          >  2:1198474/4‑101 (MQ=14)


                                            gtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGGCGGTGGGGtgggt                                                          >  2:398447/1‑101 (MQ=11)


                                            gtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTTGGGTCGGTgggggccgt                                                          >  2:1034206/1‑95 (MQ=11)


                                            gtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgt                                                          <  1:1794868/101‑1 (MQ=11)


                                             tgggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtagggtccgtg                                                         <  2:2319248‑M2/99‑38 (MQ=255)


                                              cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcggggccgtgg                                                        <  2:1609072‑M2/101‑39 (MQ=255)


                                              cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGGGGGGTCGGTGGCGtcggtgg                                                        >  2:2931943/1‑99 (MQ=11)


                                              cggATCCGACCGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                        <  1:3951593/101‑1 (MQ=17)


                                                 gtcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgggag                                                     <  1:1192227‑M2/100‑42 (MQ=255)


                                                  tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATGGGCCGGGTCGGTGGGGTCGGTGGGAtcgggagggtc                                                    >  1:4424391/1‑94 (MQ=11)


                                                    ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                  >  1:1061773/5‑101 (MQ=17)


                                                    cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgagggatcggtgcggtccgtgggatcgg                                                  <  2:2409864‑M2/101‑45 (MQ=255)


                                                     gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGCCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgc                                                 >  1:148317/1‑100 (MQ=14)


                                                     gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                 >  1:190448/1‑101 (MQ=14)


                                                      tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                >  1:2829870/1‑101 (MQ=14)


                                                        ggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                              >  2:3112359/1‑101 (MQ=255)


                                                         gttaagtcgtGTCCCTGNGTTCGGGNGGGTNCGTGGAATCGGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCNGTCGGGTCCGTAGGa                                             <  1:850519/96‑1 (MQ=0)


                                                         gATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                                             >  2:1106692‑M2/1‑52 (MQ=255)


                                                         gATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGACGGGCCCGTGCGACCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGCCGGGTCCGCCGGGTCCGTGGGATCGTTCGGATCCGAGGGa                                             >  2:1997300/1‑101 (MQ=18)


                                                           tcggtcggGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                           >  1:3138304‑M2/1‑50 (MQ=255)


                                                           tccgtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                           <  2:2159293/98‑1 (MQ=14)


                                                             ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggggccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccg                                         <  2:2505988‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                              gtcggGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt                                        >  2:3483409‑M2/1‑47 (MQ=255)


                                                              gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgt                                        <  1:1114048‑M2/101‑55 (MQ=255)


                                                              gtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtcggt                                        >  2:1879785/1‑101 (MQ=14)


                                                               gtgggttCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                                       >  1:980745‑M2/3‑46 (MQ=255)


                                                                cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                      <  2:67089‑M2/101‑57 (MQ=255)


                                                                 gggTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                     <  1:2427296‑M2/101‑58 (MQ=255)


                                                                 gggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg                                     >  1:1657094/1‑101 (MQ=17)


                                                                  ggTACGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                    >  1:487674‑M2/1‑43 (MQ=255)


                                                                   gTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                   >  1:4253719/1‑101 (MQ=255)


                                                                   gTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGt                                   >  1:1282374/1‑101 (MQ=17)


                                                                    gccgTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatc                                  >  1:3341962‑M2/2‑41 (MQ=255)


                                                                     ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcg                                 >  2:3577032/1‑100 (MQ=255)


                                                                      cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCg                                <  1:2669204/101‑1 (MQ=11)


                                                                       gtcggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTCGGGTCCGt                               >  1:349569/4‑101 (MQ=17)


                                                                       gTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                               >  2:948868‑M2/1‑38 (MQ=255)


                                                                        tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtg                              <  2:2071014‑M2/101‑65 (MQ=255)


                                                                         gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcg                             <  2:1284493‑M2/101‑66 (MQ=255)


                                                                           gATCGGTCGGATCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTggga                           <  2:3930788/101‑2 (MQ=17)


                                                                                gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgg                      <  1:3017546‑M2/101‑73 (MQ=255)


                                                                                 tggggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggtg                     <  1:2566765/96‑1 (MQ=255)


                                                                                  cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggtcg                    <  1:2907312/101‑9 (MQ=14)


                                                                                        cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtgggatcgg              <  1:2077678‑M2/101‑81 (MQ=255)


                                                                                        cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgg              <  2:4433665‑M2/101‑81 (MQ=255)


                                                                                          tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc            >  1:2494380‑M2/1‑19 (MQ=255)


                                                                                          tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc            <  1:2322739‑M2/101‑83 (MQ=255)


                                                                                             gatcggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcgga         >  1:1556018‑M2/1‑16 (MQ=255)


                                                                                              atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggac        <  2:50331‑M2/101‑87 (MQ=255)


                                                                                               tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtc       >  2:4116470‑M2/1‑14 (MQ=255)


                                                                                                cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggccgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggcgggggcc      <  2:2582776‑M2/101‑89 (MQ=255)


                                                                                                 ggtcgggtccgtgggattggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtcgg     <  2:270594‑M2/101‑90 (MQ=255)


                                                                                                 ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccg     <  2:3170243‑M2/101‑90 (MQ=255)


                                                                                                  gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgt    <  1:611727‑M2/101‑91 (MQ=255)


TCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGT  >  NC_014034/221954‑222154

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG