Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA NC_014034 222,090 G→C 9.3% P189P (CCC→CCG RCAP_rcc00185 ← hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position change freq score reads annotation genes product
*NC_014034222,0900G→C 9.3% 77.2 ‑3.8 ‑0.3387P189P (CCC→CCGRCAP_rcc00185hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (11/25):  ref base (178/172):  total (190/197)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.29e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.04e-01

Only 100 of 491 total aligned reads displayed.

TGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGG  >  NC_014034/221990‑222190
                                                                                                    |                                                                                                    
tgggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTg                                                                                                      <  1:945782/101‑1 (MQ=14)
 gggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTgg                                                                                                     <  2:1137504/101‑1 (MQ=11)
   ggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCACGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTgggg                                                                                                   >  1:3737297/6‑100 (MQ=11)
   ggtccgtcggACCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGa                                                                                                   <  2:2617831/96‑1 (MQ=11)
   gatgggggggATCCGGGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGa                                                                                                   <  1:2153472/93‑1 (MQ=11)
    gtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGCCCGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                                  >  1:736895/8‑101 (MQ=14)
    gtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTGGGac                                                                                                  >  1:641517/5‑100 (MQ=14)
    atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTgggcc                                                                                                  >  2:2748065/1‑99 (MQ=14)
    atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                                  <  2:104324/101‑1 (MQ=14)
    atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                                  >  2:3179818/1‑101 (MQ=14)
    atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGag                                                                                                  >  2:3978022/1‑100 (MQ=14)
     tccgtcggAGCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtc                                                                                                 <  2:4018452/98‑1 (MQ=11)
     tcagtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtc                                                                                                 <  1:1016379/98‑1 (MQ=11)
      ccgtcggTTCCGTGGGTTCGGTCGGATGCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtcc                                                                                                <  2:3395885/99‑2 (MQ=11)
      ccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtcc                                                                                                >  1:429211/3‑100 (MQ=11)
      ccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtcc                                                                                                <  2:3116727/99‑2 (MQ=11)
       cgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGtcgg                                                                                               >  1:3053644/5‑101 (MQ=14)
        gtcgggggcGTGGGATGGGTCGGGGCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                              <  1:3876448/93‑1 (MQ=11)
        gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggc                                                                                              >  1:3589892/1‑100 (MQ=11)
        gtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTGCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                              >  1:970985/1‑101 (MQ=14)
         tcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                             <  2:967360/101‑1 (MQ=14)
         tcggAGCCGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtg                                                                                             <  2:611057/101‑2 (MQ=11)
         gtggggccGGGGGGTCGGTCGGAGCCGTGGGATCCGGCGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtg                                                                                             <  1:441142/95‑2 (MQ=2)
         gcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                             <  1:3154567/100‑1 (MQ=14)
          cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGGGGGGTCGGTGGCGtcggtgg                                                                                            >  2:2931943/1‑99 (MQ=11)
          cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtgg                                                                                            >  1:1344907/1‑99 (MQ=11)
           gggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtggg                                                                                           >  1:1446411/4‑101 (MQ=11)
           gggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTGCGTCGGATCGGTGGGAtcggtcgg                                                                                           >  2:2993506/4‑101 (MQ=11)
           ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATAGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg                                                                                           >  1:4003287/1‑101 (MQ=11)
            ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcggg                                                                                          >  1:1611775/3‑100 (MQ=11)
            gctCCGCGGGGTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcggg                                                                                          <  2:1742818/99‑2 (MQ=14)
             gtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgggt                                                                                         <  1:1202808/100‑3 (MQ=11)
             aTCGGTCGGATCCGTGTGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGAGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                                                         <  2:734707/101‑1 (MQ=17)
                ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                      >  1:2449161/5‑101 (MQ=17)
                 tctggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                     <  1:483192/98‑1 (MQ=14)
                 gtaggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                     <  1:1726622/98‑1 (MQ=14)
                 gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCgg                                                                                     >  1:4231758/1‑100 (MQ=14)
                  tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTg                                                                                    >  2:3828265/1‑101 (MQ=14)
                  tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                                    >  1:2829870/1‑101 (MQ=14)
                  gcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                    <  1:786881/99‑1 (MQ=255)
                    ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGggg                                                                                  >  2:3728798/1‑101 (MQ=14)
                    ggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                  >  1:4082981/1‑101 (MQ=255)
                    ggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTAGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGggg                                                                                  >  2:803743/1‑101 (MQ=18)
                     gATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGa                                                                                 <  2:208795/101‑1 (MQ=14)
                       tccgtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                                                               <  2:2159293/98‑1 (MQ=14)
                        gggtgggGTCCGGGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                              <  1:875828/100‑1 (MQ=21)
                        gggtcggGTCCGTCGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg                                                                              <  1:1161086/100‑1 (MQ=14)
                        cggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGACCCGTGGGGCCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtcg                                                                              >  1:3001006/1‑101 (MQ=14)
                           cggggTTCGTGGGTTCGGTGGGGGCCGTGGGATCGTCCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                           <  1:2344432/99‑1 (MQ=18)
                            cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGACGGGTCCGGGGGAtcgggcg                                                                          >  2:2566602/1‑101 (MQ=14)
                             gggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggttgg                                                                         >  2:1387931/1‑101 (MQ=14)
                               gTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTCGGTGCCGTGGGCGCCGTCGGGGCGGTGGGGtgggtggagg                                                                       >  2:4153104/1‑96 (MQ=2)
                               gTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                       <  1:3390478/101‑1 (MQ=17)
                               gTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGt                                                                       >  1:1282374/1‑101 (MQ=17)
                                 ccGTGTGTTCGGTGGGGTCCGTGGCATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     <  2:2778300/101‑1 (MQ=2)
                                 ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcg                                                                     >  2:3577032/1‑100 (MQ=255)
                                 ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     <  1:1388028/101‑1 (MQ=255)
                                 ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGGcc                                                                     >  1:35597/1‑101 (MQ=11)
                                 ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     <  1:2624539/101‑1 (MQ=14)
                                  cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                    >  2:1314438/1‑101 (MQ=255)
                                  cGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCg                                                                    >  2:490982/1‑101 (MQ=17)
                                   gtcggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTCGGGTCCGt                                                                   >  1:349569/4‑101 (MQ=17)
                                     gggATCGGTCGGATCCGTGAAATCGGTCGGGCCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGGCCCGTGGGACGGGCCGGGTCCGACCGCTCGGTCggggcggtat                                                                 >  2:437310/1‑94 (MQ=2)
                                     cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGGCGGGTCGGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGATGGGTCGGGTCCGGgg                                                                 >  2:1473248/2‑101 (MQ=14)
                                      ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGGTCGGTggg                                                                >  1:3977322/1‑101 (MQ=17)
                                       gATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGATCGGGGGGCTCGGTGGAGGCAGTggga                                                               >  2:2018988/1‑100 (MQ=11)
                                        gtcggtgggGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggat                                                              <  1:2071151/100‑3 (MQ=14)
                                        gtcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggat                                                              <  2:42591/100‑3 (MQ=14)
                                        aTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGACGGCTCCGTGGGGACGGGCGGATCCGTAGAGACCGGGGGCACGGTCAGGCCCATGGACTCGGTCGGGACCGtaacat                                                              >  2:2344282/1‑96 (MQ=0)
                                        aTCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGCCCGCGGGATCGGTCGGGGCCGGAGGACCGGACGGGGCCGTgggcg                                                              >  2:1634616/1‑99 (MQ=2)
                                         tcgttctgATCCTTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGAGGTCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                             <  2:3483555/101‑4 (MQ=11)
                                         acggtcggAGCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                             <  1:2251199/100‑4 (MQ=14)
                                          cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtg                                                            >  1:3950391/1‑101 (MQ=255)
                                          cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTcgggtcc                                                            >  1:3449097/1‑98 (MQ=11)
                                           ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgg                                                           >  2:1805964/1‑96 (MQ=14)
                                            gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggt                                                          <  2:2867624/101‑1 (MQ=255)
                                             tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggtc                                                         >  1:60605/1‑94 (MQ=14)
                                              cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggtgg                                                        >  1:2558561/1‑101 (MQ=255)
                                               ggATCCGTGTGATCGGTCGGGTCCGTTGGCTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggtcgg                                                       <  2:1717620/101‑10 (MQ=14)
                                               ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTggggtcggtcgg                                                       >  1:3283536/1‑93 (MQ=14)
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                                                                                                    |                                                                                                    
TGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGG  >  NC_014034/221990‑222190

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 15 ≤  ATCG  < 23 ≤  ATCG  < 31 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG