Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 681,482 | C→G | 21.5% | G709R (GGC→CGA) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 681,482 | 0 | C→G | 21.5% | 112.2 ‑3.8 ‑0.1 | 198 | G709R (GGC→CGC) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (12/30): ref base (76/77): total (91/107) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.21e-02 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.81e-01 |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
CCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACC > NC_014034/681382‑681582
|
gCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.At < 1:1104107/101‑1 (MQ=255)
cATCGTGGCCGAGCCGCGCCCGGAGGGGGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCACCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCACCG.ATCt < 2:2193460/101‑1 (MQ=255)
cATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGGTCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCt < 2:2961614/101‑1 (MQ=255)
cATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCt < 2:874939/101‑1 (MQ=255)
cATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCt < 1:1578034/101‑1 (MQ=255)
cATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCt < 2:286813/101‑1 (MQ=255)
aTCGTGGCCTGGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCCCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTg < 2:2215312/101‑1 (MQ=255)
aTCGTGGCCGAGGCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTg > 1:2422813/1‑101 (MQ=255)
tCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTgc < 2:3183806/101‑1 (MQ=255)
gCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGa < 2:1157123/101‑1 (MQ=255)
gCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGa < 1:1806921/101‑1 (MQ=255)
ccGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAg < 1:225089/101‑1 (MQ=255)
ccGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAg < 1:1484222/101‑1 (MQ=255)
gAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGcc > 1:206418/1‑101 (MQ=255)
agcccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGccc > 2:4395246/1‑101 (MQ=255)
gcccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCa > 2:2238423/1‑101 (MQ=255)
cccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAg < 1:971956/101‑1 (MQ=255)
gcccAGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGAcgc > 2:160311/1‑101 (MQ=255)
ccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACgcgc > 1:2029343/1‑101 (MQ=255)
cGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGcgcc > 1:3054402/1‑101 (MQ=255)
agagCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCATCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCgccgcc < 1:2657903/101‑1 (MQ=255)
agagCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCgccgcc < 1:1329364/101‑1 (MQ=255)
gcggtccGTCCCGCTGATCTGGGCAGGCGCCGCCGCATCGATCGCCGCGATATGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCt < 2:1995220/96‑1 (MQ=21)
gagCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCt < 1:3746190/101‑1 (MQ=255)
gagCGCCGGCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCt < 1:197067/101‑1 (MQ=255)
ccGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGcc > 2:3057984/1‑101 (MQ=255)
ccGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGcc > 1:1376502/1‑101 (MQ=255)
ccGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGcc < 2:1107803/101‑1 (MQ=255)
cGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcg > 1:1664745/1‑101 (MQ=255)
cgcgCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgtcg > 2:2523639/1‑101 (MQ=255)
cgcgCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgtcg > 1:1057054/1‑101 (MQ=255)
cgcgCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgtcg > 1:1595208/1‑101 (MQ=255)
cgcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCgtcgtc < 1:2182652/101‑1 (MQ=255)
cgcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCgtcgtc < 2:2726811/101‑1 (MQ=255)
gcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCa < 1:1386350/101‑1 (MQ=255)
ggagccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc < 1:738253/92‑1 (MQ=2)
ggagccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc < 2:4043686/92‑1 (MQ=2)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg > 1:68898/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg < 2:2636672/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg < 2:3263145/101‑1 (MQ=255)
tCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGcc < 2:153344/101‑1 (MQ=255)
tCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGcc < 1:2002385/101‑1 (MQ=255)
ccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGccc > 2:3550824/6‑100 (MQ=2)
ccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa < 2:229577/96‑1 (MQ=2)
cgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc < 1:4292345/97‑1 (MQ=2)
cgcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGa > 2:826252/1‑101 (MQ=255)
gcCAGATCCCCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt < 2:3447877/101‑1 (MQ=255)
cccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt < 2:1298262/100‑1 (MQ=2)
cccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt < 2:248389/100‑1 (MQ=9)
accAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt < 2:704030/100‑1 (MQ=9)
gcAGTTCCGCCGCCCCGAGCGCCGCGATCTGCGCGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGCCGCGCCGCCTGCGCCGCCGTCAGCGCCACGATg < 2:1471628/100‑1 (MQ=21)
ccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATg < 1:2497133/101‑1 (MQ=2)
ccAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATg < 1:570036/101‑1 (MQ=255)
ccAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATg > 1:2843771/1‑101 (MQ=255)
cAGATCCGCCGCCTAGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGt < 1:205131/101‑1 (MQ=255)
ccgccgCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCg < 1:1628757/101‑1 (MQ=255)
ggcggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgg > 1:3009061/11‑101 (MQ=9)
gcggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGt < 1:3699636/92‑1 (MQ=9)
gcggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGt < 1:2636600/92‑1 (MQ=9)
gccgccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGt < 1:3058205/101‑1 (MQ=255)
gccgccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGt > 2:4058028/1‑101 (MQ=255)
ggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc < 1:3794663/94‑1 (MQ=9)
cgccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGGGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc > 2:1867025/1‑101 (MQ=255)
gtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc > 2:1377146/7‑101 (MQ=9)
gccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc < 2:2042354/101‑1 (MQ=255)
gccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc < 1:1151264/101‑1 (MQ=255)
tCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa < 2:1263787/101‑1 (MQ=255)
tCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa < 2:4280718/101‑1 (MQ=255)
tCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa > 1:940213/1‑101 (MQ=255)
cGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAg < 1:780467/101‑1 (MQ=255)
cGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAg > 2:175137/1‑101 (MQ=255)
gAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGc > 2:2287087/1‑101 (MQ=255)
caGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgaggc < 2:3630541/100‑6 (MQ=9)
aGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGC.CAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcc > 1:3504570/1‑101 (MQ=2)
gcgcCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccc < 1:2208014/101‑2 (MQ=9)
cgccgcGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCcgc > 2:3915570/1‑101 (MQ=255)
cgccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccct > 1:2597334/1‑99 (MQ=2)
gccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccctt < 1:3082810/101‑4 (MQ=9)
gccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccctt < 2:798942/101‑4 (MQ=9)
cgcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGa > 2:4303367/1‑101 (MQ=255)
gcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGAt > 1:4170241/1‑101 (MQ=255)
gcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGAt < 1:1917335/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg < 2:1585465/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg < 1:3220519/101‑1 (MQ=255)
tCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgcc > 1:3190304/1‑101 (MQ=255)
gTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGccgccgg > 2:2128132/1‑100 (MQ=255)
tGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTg > 2:4161584/1‑101 (MQ=255)
gCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGc < 1:4405694/101‑1 (MQ=255)
gCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGc > 2:3647900/1‑101 (MQ=255)
ggTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCATAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa < 2:2563403/101‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa < 2:3574863/101‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa > 1:4339994/1‑101 (MQ=255)
atctcggtgcCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAg > 2:2030951/9‑101 (MQ=255)
tCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgc < 1:2101243/101‑1 (MQ=255)
tCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgc < 1:685771/101‑1 (MQ=255)
aGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcgc > 2:2347894/1‑101 (MQ=255)
cgcgcCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGcgccg < 1:4016881/101‑1 (MQ=255)
cgcCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCgccccc > 2:636821/1‑101 (MQ=255)
ccG.ATCTGCCCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAc < 1:826334/101‑1 (MQ=255)
cG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAcc > 1:1226624/1‑101 (MQ=255)
|
CCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.ATCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACC > NC_014034/681382‑681582
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 19 ≤
ATCG
< 25 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|