| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,797,126 | 2 bp→GC | 100% | coding (150‑151/2238 nt) | RCAP_rcc01660 → | signal transduction histidine kinase |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,797,126 | 0 | C→G | 100.0% | 607.8 | 163 | T50T (ACC→ACG) | RCAP_rcc01660 | signal transduction histidine kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (84/79): ref base (0/0): total (84/79) | ||||||||||
| * | NC_014034 | 1,797,127 | 0 | G→C | 100.0% | 606.3 | 162 | G51R (GGC→CGC) | RCAP_rcc01660 | signal transduction histidine kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (83/79): ref base (0/0): total (83/79) | ||||||||||
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
GAGCGGCAGACCGAGAAGCTTCTGACCATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGATACGCGGGGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACCGGCCGGCATGCTGGA.GG.A.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGCTGGCCGAGG > NC_014034/1797025‑1797220
||
cAGACCGAGAAGCTTCTGACCATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAAcgcgccgc > 1:3203572/1‑100 (MQ=255)
gACCGAGAAGCTTCTGACCATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAAcgcgccgcga > 1:1864249/1‑98 (MQ=255)
gACCGAGAAGCTTCTGACCATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAAcgcgccgcga > 2:436363/1‑98 (MQ=255)
aCCGAGAAGCTTCTGACCATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAAcgcgccgcgat < 2:1933326/101‑5 (MQ=255)
ccGAGAAGCTTCTGACCATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAAcgcgccgcgatg < 1:1478463/101‑6 (MQ=255)
gagaAGCTTCTGACCATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAAcgcgccgcggtgct > 1:1881756/1‑94 (MQ=255)
gaAGCTTCTGACCATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTgg > 1:1916080/1‑101 (MQ=255)
aaGCTTCTGACCATTGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTgga > 1:1400956/1‑101 (MQ=255)
gCTTCTGACCATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTgga.gg > 1:2391106/1‑101 (MQ=255)
gCTTCTGACCATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTgga.gg < 1:86483/101‑1 (MQ=255)
ctccTGACCATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGTTgga.gg.a < 2:2046881/98‑1 (MQ=255)
cTTCTGACCATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTgga.gg.a > 1:1975036/1‑101 (MQ=255)
tCTGACCATCGTCGGCGCGCTGATCTGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTgga.gg.aac > 2:2850265/1‑99 (MQ=255)
tCTGACCATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTgga.gg.aac > 1:3483883/1‑99 (MQ=255)
cTGACCATCGTCGGCACGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTgga.gg.aaca < 2:3320154/101‑4 (MQ=255)
tGACCATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTgga.gg.aacag > 2:3692171/1‑97 (MQ=255)
ccATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTc < 2:1295152/101‑1 (MQ=255)
cATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTcc < 1:3779603/101‑1 (MQ=255)
cATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTcc < 1:1127022/101‑1 (MQ=255)
cATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTcc > 2:4318100/1‑101 (MQ=255)
cATCGTCGGCGCCCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTcc < 2:2924446/101‑1 (MQ=255)
aTCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCcg < 2:3839755/101‑1 (MQ=255)
cgtcgGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCcgcg < 1:626017/101‑1 (MQ=255)
cgtcgGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCcgcg > 1:3250018/1‑101 (MQ=255)
gtcgGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGa > 1:2635065/1‑101 (MQ=255)
gtcgGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGa > 1:3311547/1‑101 (MQ=255)
gtcgGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGa > 1:1243791/1‑101 (MQ=255)
ggCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCg < 2:1525759/101‑1 (MQ=255)
gcgcTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCAc > 1:2726472/1‑101 (MQ=255)
gcgcTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCAc > 2:1193576/1‑101 (MQ=255)
gcTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCAccc < 2:1470003/101‑1 (MQ=255)
gcTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCAccc < 1:3692424/101‑1 (MQ=255)
gcTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCAccc > 1:2738780/1‑101 (MQ=255)
gcTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCAccc > 2:4034200/1‑101 (MQ=255)
cTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCcg > 2:4380618/1‑101 (MQ=255)
cGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCt > 2:4433370/1‑101 (MQ=255)
cGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCt > 2:3572580/1‑101 (MQ=255)
gCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGGGCAGTTCGAACGCGGCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGGCCGCGGCCGCACCCGCGATCTg > 1:1510226/1‑101 (MQ=255)
ccATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCTCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTgg < 2:2270069/101‑1 (MQ=255)
cATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGa > 1:384103/1‑101 (MQ=255)
cATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGa > 1:1617272/1‑101 (MQ=255)
cATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGa < 2:2934367/101‑1 (MQ=255)
cATGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGa < 2:3192407/101‑1 (MQ=255)
aTGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGaa > 2:644236/1‑101 (MQ=255)
aTGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGaa < 2:1052184/101‑1 (MQ=255)
tGCCGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAAc < 1:95256/101‑1 (MQ=255)
ccGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGAGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GG.AGCAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACgg > 1:1162563/1‑101 (MQ=255)
cGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACggg > 1:1849921/1‑101 (MQ=255)
cGAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACggg > 2:1159765/1‑101 (MQ=255)
gAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGgc > 2:4020095/1‑101 (MQ=255)
gAGGAAACCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGgc < 2:1253846/101‑1 (MQ=255)
aaCCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGCTGCTGGAGGG.A.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGAACTGGAACGGGCGCTCg > 1:2992516/1‑101 (MQ=255)
aaCCCCCGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCg > 1:2177697/1‑101 (MQ=255)
cccccGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGAt < 2:1013838/101‑1 (MQ=255)
cccccGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGAt < 1:271368/101‑1 (MQ=255)
cccccGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGAt > 2:3062129/1‑101 (MQ=255)
ccccGACGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATc < 2:616611/101‑1 (MQ=255)
cccGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCt < 2:3634666/101‑1 (MQ=255)
cccGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCt < 1:3122517/101‑1 (MQ=255)
ccGAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTg < 2:1381715/101‑1 (MQ=255)
gAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCt > 2:915853/1‑101 (MQ=255)
gAGGAT.CGCGGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCt > 1:794858/1‑101 (MQ=255)
ggatcgcgGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GG.AGCAGGTCCGCGACCGCTCCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCa < 2:1162472/97‑1 (MQ=255)
ggagcgcgGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCa < 2:1925816/97‑1 (MQ=255)
gatcgcgGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCaa < 2:1839151/98‑1 (MQ=255)
gatcgcgGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCaa < 1:4393258/98‑1 (MQ=255)
gatcgcgGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCaa < 2:3933179/98‑1 (MQ=255)
atcgcgGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAAt > 2:3891829/3‑101 (MQ=255)
agcgGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGc > 2:1623212/2‑101 (MQ=255)
cgGCGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCt > 2:349111/1‑101 (MQ=255)
ggcgccgccTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTc < 1:155634/98‑1 (MQ=255)
ggcgccgccTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTc > 2:2968787/4‑101 (MQ=255)
ggcgccgccTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTc < 1:876444/98‑1 (MQ=255)
ggcgccgccTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTc < 2:2726282/98‑1 (MQ=255)
gcgccgccTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCg < 2:1099769/99‑1 (MQ=255)
ccgccTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAAt < 2:2737315/101‑1 (MQ=255)
cgccTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAAGTCCTCGAAtt > 1:3600733/1‑100 (MQ=255)
gccTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATgc < 2:294530/101‑1 (MQ=255)
gccTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATgc < 2:3542828/101‑1 (MQ=255)
ccTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATgcg < 1:3886210/101‑1 (MQ=255)
cTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATgcgc > 1:1955556/1‑101 (MQ=255)
cTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATgcgc < 1:3149567/101‑1 (MQ=255)
cTGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATgcgc > 1:1954287/1‑101 (MQ=255)
tGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGcgcg > 2:3381014/1‑101 (MQ=255)
tGGGTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGcgcg > 1:2469488/1‑101 (MQ=255)
ggTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGc > 1:4317308/1‑101 (MQ=255)
gTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGCt < 1:4322269/101‑1 (MQ=255)
gTGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGCt < 2:2469548/101‑1 (MQ=255)
tGCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCCGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGCTg > 2:153189/1‑101 (MQ=255)
gCAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGCTgg < 1:2125651/101‑1 (MQ=255)
cAGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGCTGGc > 1:4273511/1‑101 (MQ=255)
aGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGCTGGcc < 1:149037/101‑1 (MQ=255)
aGTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGCTGGcc < 2:959681/101‑1 (MQ=255)
gTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGCTGGCCg > 2:3458910/1‑101 (MQ=255)
gTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGCTGGCCg < 2:836556/101‑1 (MQ=255)
gTTCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGCTGGCCg < 1:3572828/101‑1 (MQ=255)
ttCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGCTGGCCGa < 2:4281291/101‑1 (MQ=255)
ttCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGCTGGCCGa < 1:995465/101‑1 (MQ=255)
ttCGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGAGATCTGGAAAGGGCGATCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGCTGGGCGa > 1:409164/1‑101 (MQ=255)
cGAACGCGCCGCGATGCTGGA.GGAA.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGCTGGCCGAgg < 1:4246630/101‑1 (MQ=255)
||
GAGCGGCAGACCGAGAAGCTTCTGACCATCGTCGGCGCGCTGATCCGCCATGCCGAGGAAACCCCCGAGGATACGCGGGGCCGCCTGGGTGCAGTTCGAACCGGCCGGCATGCTGGA.GG.A.CAGGTCCGCGACCGCACCCGCGATCTGGAACGGGCGCTCGATCTGCTCAATGCCTCGAATGCGCGGCTGGCCGAGG > NC_014034/1797025‑1797220
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 21 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|