| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 2,177,289 | 2 bp→AT | 100% | coding (87‑88/990 nt) | rbsB ← | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 2,177,289 | 0 | T→A | 100.0% | 677.4 | 177 | T30S (ACA→TCA) | rbsB | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (102/75): ref base (0/0): total (102/75) | ||||||||||
| * | NC_014034 | 2,177,290 | 0 | A→T | 100.0% | 666.4 | 172 | C29* (TGT→TGA) | rbsB | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (98/73): ref base (0/0): total (99/73) | ||||||||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
CATAGGTCGAGGGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAA..GGGTT..G..GT..CGGTCTT.GTGTA.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.AGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.G.GCAGAGG.CCCCAACAGGGCCAG.TTGCGCATC > NC_014034/2177202‑2177374
||
cATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAt.cagacag > 1:2868463/1‑101 (MQ=255)
cATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAt.cagacag > 2:3982373/1‑101 (MQ=255)
cATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAt.cagacag > 2:829782/1‑101 (MQ=255)
aTAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAgg > 1:558420/1‑101 (MQ=255)
tAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAC.CAGACAGGc > 1:694670/1‑101 (MQ=255)
ggTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGccc < 2:3577674/101‑1 (MQ=255)
tCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCg < 1:870670/101‑1 (MQ=255)
tCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCg > 1:1447236/1‑101 (MQ=255)
tCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCg > 2:2959551/1‑101 (MQ=255)
agagCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGtt > 1:4425319/4‑101 (MQ=255)
agCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTc < 1:1691155/100‑1 (MQ=255)
gCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCg < 1:1022141/101‑1 (MQ=255)
gCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCg > 2:1073982/1‑101 (MQ=255)
cACGAGCGCCATTTCGGTCGCTTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..G..GTGGCGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCgg < 2:3701899/101‑1 (MQ=255)
aCCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGc < 2:2988381/101‑1 (MQ=255)
cAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCg < 2:2614858/101‑1 (MQ=255)
cAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCg < 2:2716622/101‑1 (MQ=255)
aGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.a < 2:2895388/101‑1 (MQ=255)
aGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.a > 2:2312113/1‑101 (MQ=255)
gCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aa < 1:940063/101‑2 (MQ=255)
cccATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aagc < 2:3940985/101‑4 (MQ=255)
cATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aagccg > 2:1112506/1‑96 (MQ=255)
aTCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAgccgc > 1:1092019/1‑101 (MQ=255)
aTCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAgccgc > 2:163918/1‑101 (MQ=255)
tctcGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAgccgcc > 2:784204/1‑101 (MQ=255)
ctcGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGccc < 1:395485/101‑1 (MQ=255)
tcGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGTCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGcccc > 2:1268592/1‑101 (MQ=255)
tcGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGcccc < 1:2260084/101‑1 (MQ=255)
gTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGc > 2:2505789/1‑101 (MQ=255)
tCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGcc > 2:2634286/1‑101 (MQ=255)
tCGACTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGcc < 1:317496/101‑1 (MQ=255)
cGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCa < 1:1248796/101‑1 (MQ=255)
cGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCa > 1:4163545/1‑101 (MQ=255)
cGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCa > 2:3436491/1‑101 (MQ=255)
gCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAg > 2:1492779/1‑101 (MQ=255)
gCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAg > 2:359033/1‑101 (MQ=255)
cccTTTGCCGAAGCCCCTTCCTTCATCCTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAg < 1:3445579/100‑1 (MQ=255)
cTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAgcg > 2:352646/1‑101 (MQ=255)
tttGCCGAAGCACCTTCCTTCGTCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAgcgc > 1:2536377/1‑101 (MQ=255)
tttGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAgcgc > 2:890825/1‑101 (MQ=255)
tttGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAgcgc > 1:102214/1‑101 (MQ=255)
ttGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGcgcg > 1:4118462/1‑101 (MQ=255)
tGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCgg > 1:1834930/1‑101 (MQ=255)
tGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCgg > 1:1961955/1‑101 (MQ=255)
gCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGa > 1:120847/1‑101 (MQ=255)
gCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGa > 2:4340517/1‑101 (MQ=255)
ccGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaa > 1:876619/1‑101 (MQ=255)
ccGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaa > 1:2580760/1‑101 (MQ=255)
cGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaaa > 2:3185090/1‑101 (MQ=255)
cGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaaa < 2:2807046/101‑1 (MQ=255)
gAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaaaa > 1:2684529/1‑101 (MQ=255)
gAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaaaa < 2:2086316/101‑1 (MQ=255)
aaGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAAc < 1:2722105/101‑1 (MQ=255)
aaGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAAc < 1:4362245/101‑1 (MQ=255)
aGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAA..GGGTTTGGT.GT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACg < 1:1781910/101‑1 (MQ=255)
gCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGc > 1:2937274/1‑101 (MQ=255)
aCCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCa > 2:4198614/1‑101 (MQ=255)
aCCTTCCTTCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCa > 2:2366269/1‑101 (MQ=255)
ccttccttCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.g < 1:3327607/101‑1 (MQ=255)
ccttccttCATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.g < 1:1937434/101‑1 (MQ=255)
cttccttcATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGACGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.g.g > 2:3437572/1‑101 (MQ=255)
ttccttcATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.g.gg > 2:317858/1‑100 (MQ=255)
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ccttcATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.g.ggca < 2:1050957/101‑4 (MQ=255)
ccttcATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.g.ggca > 2:2594256/1‑98 (MQ=255)
ccttcATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.g.ggca > 2:1360483/1‑98 (MQ=255)
ccttcATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.g.ggca < 1:212437/101‑4 (MQ=255)
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cATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAgg > 2:2454755/1‑101 (MQ=255)
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cATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAgg > 1:2567866/1‑101 (MQ=255)
cATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGCGAT.CAGACACGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.GAGCAGAgg > 2:2994687/1‑101 (MQ=255)
cATCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGCCTT.GGGGATCAGACACGCCCCGGTTTCGGACGAAGCCGCCCCCGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAgg > 2:3387666/1‑101 (MQ=255)
aTCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGCCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGG.c > 1:2880758/1‑101 (MQ=255)
tCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGG.cc > 2:3802831/1‑101 (MQ=255)
tCTTGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGG.cc > 1:4206135/1‑101 (MQ=255)
ttGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGG.cccc > 2:1250330/1‑101 (MQ=255)
ttGACG.AAAAAGGGGTT..GGTGT..CGGTCTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGG.cccc > 2:4120773/1‑101 (MQ=255)
aggggttggtgt..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGcc > 2:4254041/11‑101 (MQ=255)
aggggttgctgt..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGcc > 2:3299210/11‑101 (MQ=255)
ggggttggtgt..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGCCa < 1:3982629/92‑1 (MQ=255)
ggttggtgt..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.t > 1:3422098/8‑101 (MQ=255)
gttggtgt..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.tt > 2:2641597/7‑101 (MQ=255)
ttggtgt..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GAAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.ttt > 2:2422699/6‑100 (MQ=255)
tggtgt..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.tttg < 1:2673767/97‑3 (MQ=255)
tggtgt..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.tttg > 1:3614791/5‑99 (MQ=255)
tggtgt..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.tttg > 2:1528965/5‑99 (MQ=255)
ggtgt..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.tttgc > 2:1438379/4‑98 (MQ=255)
gtgt..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.tttgcg < 1:4229949/99‑5 (MQ=255)
tgt..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.tttgcgc > 1:665754/2‑96 (MQ=255)
tgt..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.tttgcgc > 1:2640338/2‑96 (MQ=255)
tgt..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.tttgcgc > 2:1447226/2‑96 (MQ=255)
gt..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGca > 2:2805215/1‑101 (MQ=255)
gt..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGca > 2:2463731/1‑101 (MQ=255)
t..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGcat < 2:2880550/101‑1 (MQ=255)
t..cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGcat < 2:597853/101‑1 (MQ=255)
cggtcTTGGTGAT.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGG.GCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGcatc < 1:3785310/101‑1 (MQ=255)
||
CATAGGTCGAGGGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACG.AAAA..GGGTT..G..GT..CGGTCTT.GTGTA.CAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.AGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.G.GCAGAGG.CCCCAACAGGGCCAG.TTGCGCATC > NC_014034/2177202‑2177374
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 21 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|