| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,395,426 | +T | 5.7% | intergenic (+238/‑693) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,395,426 | 1 | .→T | 5.7% | 37.0 ‑1.5 ‑0.5 | 194 | intergenic (+238/‑693) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (4/7): ref base (102/81): total (106/88) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.30e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.18e-01 | ||||||||||
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
GCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATC > NC_014034/1395326‑1395526
|
cAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.a < 1:2718479/101‑1 (MQ=255)
cAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.a > 1:1431060/1‑101 (MQ=255)
cAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.a > 2:4648326/1‑101 (MQ=255)
cAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcgggg.a > 1:1240469/1‑101 (MQ=255)
aaTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGCGGGGGGTCGAAACTGCACCGCTTGGCCCCGCcggtggccggtgtt > 1:2891482/1‑99 (MQ=255)
aTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCggtgatcggtg.atc > 1:1777387/1‑101 (MQ=255)
tttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCa < 2:4181581/101‑1 (MQ=255)
tttccccGGCTGGTCCGGGGGTTTCGGAACGGGAGTCGCCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCa < 1:122525/96‑1 (MQ=25)
ttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAg < 2:2822575/101‑1 (MQ=255)
ttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAg > 1:1576605/1‑101 (MQ=255)
ttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAg < 1:3222068/101‑1 (MQ=255)
ttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAg > 2:4028171/1‑101 (MQ=255)
acacCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGGG.ATCAGCg > 2:2692648/1‑101 (MQ=255)
cacCGTCTGGTGAGGGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATCGAAGCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCgg < 2:3269012/101‑1 (MQ=38)
ccGTCTGGTCAGCGTGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTc < 2:3118557/101‑1 (MQ=255)
ccGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTc < 1:499883/101‑1 (MQ=255)
cGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCg > 2:1526228/1‑101 (MQ=255)
gTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGc < 2:901034/101‑1 (MQ=255)
gTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGc > 1:1542723/1‑101 (MQ=255)
gTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGc > 1:1128238/1‑101 (MQ=255)
tCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCt < 2:3014691/101‑1 (MQ=255)
tCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCt < 1:1888895/101‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTccc < 1:3285908/101‑1 (MQ=255)
gTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcccc > 2:859224/1‑101 (MQ=255)
tCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTccccc < 1:1565066/101‑1 (MQ=255)
tCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTccccc < 2:2449562/101‑1 (MQ=255)
aGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCcg > 1:4362631/1‑101 (MQ=255)
gggTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCgg > 1:946309/1‑101 (MQ=255)
gTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCgggg < 2:3851517/101‑1 (MQ=255)
ttACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCggggg > 2:3899445/1‑101 (MQ=255)
tACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc > 2:4307418/1‑101 (MQ=255)
tACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc > 2:210988/1‑101 (MQ=255)
aCGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCg > 2:1658087/1‑101 (MQ=255)
gAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg < 1:1745134/101‑1 (MQ=255)
gAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg < 1:3805763/101‑1 (MQ=255)
gAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGGG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg > 1:3764686/1‑101 (MQ=255)
caaccGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg < 2:2555237/97‑1 (MQ=255)
tcaacactgTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt > 1:1142741/9‑101 (MQ=2)
aaaCGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGGGATCGGGG.ATCAGCGGGCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg > 1:1392815/1‑101 (MQ=255)
aaCGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 2:4427497/101‑1 (MQ=255)
aCGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGGGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGaa > 2:839720/1‑100 (MQ=255)
tgTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAct < 2:364363/100‑2 (MQ=2)
aGTCG.CCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 1:403347/101‑1 (MQ=255)
gTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc > 2:2404470/1‑101 (MQ=255)
tCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa > 1:3556467/1‑101 (MQ=255)
tCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa > 1:1952128/1‑101 (MQ=255)
cG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 1:678747/1‑101 (MQ=255)
cG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 1:2278449/1‑101 (MQ=255)
g.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATc > 2:4056848/1‑101 (MQ=255)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgc > 2:4343137/1‑101 (MQ=255)
cccccccGCGGGGGCGTNGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgc < 2:1542622/100‑1 (MQ=255)
cccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgccg < 1:2376186/101‑1 (MQ=255)
cccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGGCGCTCCCCCCCCGGGGGCGAGGAGCGAAACATcgccg > 2:4262527/1‑101 (MQ=39)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgccgc < 1:1042531/101‑1 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCttt < 2:4602113/101‑1 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCttt < 1:4162914/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTg < 1:2125642/101‑1 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGGCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTCGATCGAAACATCGCCTCCTTggg > 2:1805213/1‑100 (MQ=38)
ggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCg > 2:2538927/1‑101 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCgg < 2:3446393/101‑1 (MQ=255)
ggCGTGTATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGt < 2:3491787/101‑1 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGt > 1:3108544/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGt > 1:1904689/1‑101 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTc > 2:292233/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGa > 2:2910573/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc < 2:1169461/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc > 2:4190470/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAg > 1:4496414/1‑101 (MQ=255)
aTCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAgg > 1:1601440/1‑101 (MQ=255)
cGAAACTGCCCCCGCGGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ACCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCt < 1:3304601/101‑1 (MQ=255)
gAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTg > 1:2466069/1‑101 (MQ=255)
aaaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTgg > 2:1999207/1‑101 (MQ=255)
aaaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTgg < 2:805090/101‑1 (MQ=255)
aaaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTgg < 1:261324/101‑1 (MQ=255)
aaaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTgg < 2:3598960/101‑1 (MQ=255)
aCTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTa < 1:2939327/101‑1 (MQ=255)
aCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTa < 2:2031517/101‑1 (MQ=255)
aCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTa > 1:87160/1‑101 (MQ=255)
tGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGGAAc > 1:4724104/1‑101 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg > 2:472824/1‑101 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg > 2:100228/1‑101 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGc > 1:3366984/1‑101 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGc < 2:1941668/101‑1 (MQ=255)
cTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGGAACGTGTCGCt > 2:4518900/1‑101 (MQ=255)
tGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTc > 1:3916197/1‑101 (MQ=255)
tGGCCCTGCCGGTGATCGGTA.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTc < 2:119426/101‑1 (MQ=255)
gCCCTGGCGGGGATCGGTG.ATCAGCGGTCCCTCCCCCCGCGGGGCCGCGGCTCGGAACATGGCCGCTTTGGCGGTCGACATCCTGGGGACgtgcgcgtccc > 2:236239/1‑93 (MQ=255)
gCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccc < 1:4690757/101‑1 (MQ=255)
gCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccc < 1:79447/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc < 2:1240379/101‑1 (MQ=255)
tGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccccccc > 2:2491608/1‑100 (MQ=255)
tGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcg > 2:3207878/1‑101 (MQ=255)
tGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGCAACGTGTCGCTCCCCCcg > 1:1706350/1‑101 (MQ=255)
cggtgatcggtg.atCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgg > 2:2184999/1‑101 (MQ=255)
gtgatcggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgggg < 1:3381087/101‑1 (MQ=255)
tgatcggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCggggg < 1:295225/101‑1 (MQ=255)
gatcggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc > 1:1805842/1‑101 (MQ=255)
gatcggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc < 1:3692393/101‑1 (MQ=255)
ggtg.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg < 2:568243/101‑1 (MQ=255)
g.atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:3764451/101‑1 (MQ=255)
|
GCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATC > NC_014034/1395326‑1395526
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|