| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,823,740 | +C | 100% | intergenic (+25/‑148) | RCAP_rcc01687 → / → RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,823,740 | 1 | .→C | 100.0% | 52.6 | 158 | intergenic (+25/‑148) | RCAP_rcc01687/RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (93/47): ref base (0/18): total (93/65) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.32e-08 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.17e-01 | ||||||||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
CTATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.CCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCG > NC_014034/1823640‑1823833
|
ctATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.a.a > 2:3676700/1‑101 (MQ=255)
ctATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.a.a < 2:1382972/101‑1 (MQ=255)
ctATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.a.a > 2:501976/1‑101 (MQ=255)
tATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.c < 1:1024680/101‑1 (MQ=255)
aTGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.cc > 2:4291682/1‑101 (MQ=255)
aTGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.cc > 1:4527340/1‑101 (MQ=255)
tGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.ccc < 2:4385305/101‑1 (MQ=255)
gCGAGCCAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.cccc < 1:1111319/101‑2 (MQ=255)
gCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.cccc < 2:1608274/101‑2 (MQ=255)
cGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.ccccg > 2:1118355/1‑99 (MQ=255)
gAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGTCGCCTCGGAACGGGCGGTGAAGGGGGCGGGGGT.A.C.ccccgg > 1:453268/1‑98 (MQ=255)
gAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.ccccgg > 2:4467416/1‑98 (MQ=255)
aGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.ccccggc > 1:3091183/1‑97 (MQ=255)
aGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.ccccggc < 2:853608/101‑5 (MQ=255)
gCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.ccccggct < 2:4532068/101‑6 (MQ=255)
gCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.ccccggct > 2:3058398/1‑96 (MQ=255)
cAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGACGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTg > 1:1891671/1‑101 (MQ=255)
aaGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgc > 1:872790/1‑101 (MQ=255)
aaGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgc > 2:3733223/1‑101 (MQ=255)
cGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgccgc > 1:1434972/1‑101 (MQ=255)
cGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgccgc > 2:1340245/1‑101 (MQ=255)
cGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAAAGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgccgc < 1:2723097/101‑1 (MQ=255)
gggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTgccgcc < 1:2824338/101‑1 (MQ=255)
ggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGccgcc.g < 1:492158/101‑1 (MQ=255)
ggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGccgcc.g > 2:331582/1‑101 (MQ=255)
ggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGccgcc.g < 1:1752614/101‑1 (MQ=255)
gTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.gg > 1:1508051/1‑101 (MQ=255)
gggCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGtt > 2:3307977/1‑101 (MQ=255)
gggCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGtt > 2:3864315/1‑101 (MQ=255)
gcggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCg < 2:1798945/101‑1 (MQ=255)
gcggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCg > 1:717161/1‑101 (MQ=255)
cggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGc > 1:2434924/1‑101 (MQ=255)
cggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGc < 2:3090983/101‑1 (MQ=255)
ggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGcc > 1:1244835/1‑101 (MQ=255)
gcgATGTCAGCTATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCg < 2:1103680/101‑1 (MQ=255)
gcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCg > 2:2586587/1‑101 (MQ=255)
cgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCgg < 2:3996869/101‑1 (MQ=255)
gTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTcgg > 1:3634979/1‑101 (MQ=255)
cAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTcgggc < 1:2754762/101‑1 (MQ=255)
aGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTcgggcg > 1:1693665/1‑101 (MQ=255)
gCGATTCCGCCGCGTTCAAGCTGTTGAAGTTTGCCTCTTCGTAACGGGCGGTGAGGGGGCCGGGGGC.ATC.CCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTcgggcgg < 2:3599673/101‑1 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCgggcgggc > 2:4086238/1‑101 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCgggcgggc > 2:341659/1‑101 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCgggcgggc < 2:3467041/101‑1 (MQ=255)
gATTCCCCCGCGATCAATTTTTTGAATTTTGCCGGCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.ACC.CCC.GGTTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCgggcgggc < 1:371846/101‑1 (MQ=255)
tttCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGgcgggcgc < 2:2616628/101‑1 (MQ=255)
ttCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcg > 1:456401/1‑101 (MQ=255)
ttCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcg > 1:1414413/1‑101 (MQ=255)
ttCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcg > 1:2153050/1‑101 (MQ=255)
ttCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcg > 1:1448289/1‑101 (MQ=255)
cgccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcggg > 1:2840825/1‑101 (MQ=255)
gccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcgggc > 1:3168389/1‑101 (MQ=255)
cgcgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCtt < 2:1507950/101‑1 (MQ=255)
cgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTcc > 2:1624072/1‑101 (MQ=255)
cgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGGGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTcc < 1:563113/101‑1 (MQ=255)
aTCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCgg < 2:4472226/101‑1 (MQ=255)
tCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGc < 1:3485537/101‑1 (MQ=255)
cAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGcc > 2:2288778/1‑101 (MQ=255)
cAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGcc < 2:4318453/101‑1 (MQ=255)
aaGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGccc > 1:2174951/1‑100 (MQ=255)
aGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGc < 2:2786724/101‑1 (MQ=255)
tGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGc < 1:3339161/101‑1 (MQ=255)
tGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGA.A.A.CCC.CGCTTCCCCCGGGTCCGCGGGCCGGGCGGGGGGGGGCTTCC.GCCGCCGcc > 1:1848103/1‑101 (MQ=255)
gTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGCCGGAGAAGGGGCCGGGGGCAA.A.CCC.GGCTGCCGCC.GGCGCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTgac > 2:246082/1‑99 (MQ=255)
ttGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCt < 2:1190428/101‑1 (MQ=255)
ttGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTGCGGCCGCTGCCt < 1:2578098/101‑1 (MQ=255)
ttGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCt < 1:3862579/101‑1 (MQ=255)
tgcaaGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCt < 2:3243998/98‑1 (MQ=255)
tGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTa < 2:2237383/101‑1 (MQ=255)
tGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTa < 2:4290835/101‑1 (MQ=255)
tGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTa < 2:2712331/101‑1 (MQ=255)
gTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctg < 1:1570262/101‑1 (MQ=255)
gTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctg > 2:4510134/1‑101 (MQ=255)
ttGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgct > 1:659983/1‑101 (MQ=255)
gccgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctcc > 2:1990965/1‑101 (MQ=255)
ccgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccc < 1:1283597/101‑1 (MQ=255)
ccgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccc > 2:1051345/1‑101 (MQ=255)
cgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccct < 2:3168189/101‑1 (MQ=255)
cgcGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccg < 2:1870648/99‑1 (MQ=255)
cTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccg < 1:3423848/101‑1 (MQ=255)
cTCCTAGCGGGCGGTGATGGGGCCGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccg < 2:4268309/101‑1 (MQ=255)
gTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc < 2:2152926/101‑1 (MQ=255)
gTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCGGGTCGGGCGGTCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc > 2:1146236/1‑101 (MQ=255)
gaaCGGGCGGTGAAGGGGCGGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtccg < 2:782879/100‑1 (MQ=255)
aaCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGa > 2:471409/1‑101 (MQ=255)
aaCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGa > 2:2382432/1‑101 (MQ=255)
aCGGGCGGGGAAGGGGCGGGGGGC.A.ACCCC.GGCGGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAg < 1:4393271/101‑1 (MQ=255)
cGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGt > 1:3916756/1‑101 (MQ=255)
ggTGAAGGGGCGGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCgg < 1:2951939/101‑1 (MQ=255)
gTGAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGt < 2:2174827/101‑1 (MQ=255)
gAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCggggg > 2:3277113/1‑98 (MQ=255)
gAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGc > 1:1545867/1‑101 (MQ=255)
gAAGGGGCCGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGc > 1:1473361/1‑101 (MQ=255)
ggggCCGGGGGC.ACC.CCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCggg < 1:2050471/101‑1 (MQ=255)
ggCCGGGGGC.A.C.CCCGGGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGt < 1:4691833/101‑1 (MQ=255)
gggggggC.A.CCCCC.GGCTCCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCt < 1:1146322/99‑1 (MQ=255)
ccGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGGCt > 2:93895/1‑101 (MQ=255)
cGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTg < 2:3634750/101‑1 (MQ=255)
cGGGGGC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGGCTg > 1:2284946/1‑101 (MQ=255)
ggggC.A.ACCCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTgcg > 2:2891249/1‑101 (MQ=255)
|
CTATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGC.A.A.CCC.GGCTGCCGCC.GGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCG > NC_014034/1823640‑1823833
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 24 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|