| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 3,504,126 | +G | 1.9% | intergenic (‑19/+64) | recO ← / ← RCAP_rcc03309 | DNA repair protein RecO/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 3,504,126 | 1 | .→G | 1.9% | 3.0 ‑3.4 ‑0.0 | 217 | intergenic (‑19/+64) | recO/RCAP_rcc03309 | DNA repair protein RecO/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (3/0): ref base (67/145): total (72/145) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.35e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.15e-01 | ||||||||||
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
TGGCCGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGCGTGCGG > NC_014034/3504026‑3504226
|
tGGCCGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.cc < 1:514464/101‑1 (MQ=255)
ggCCGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGGGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.GC..g > 1:4663670/1‑101 (MQ=255)
gCCGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..gg < 1:415312/101‑1 (MQ=255)
ccGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.GC..ggg > 2:1595877/1‑101 (MQ=255)
ccGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..ggg > 2:210852/1‑101 (MQ=255)
cGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..gggg < 2:2478994/101‑1 (MQ=255)
cGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..cggg > 2:2994520/1‑101 (MQ=255)
tGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAAGGG.CC..ggggg > 1:3918237/1‑101 (MQ=255)
tGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..gggggg > 2:685121/1‑100 (MQ=255)
tacacCTCGACAAGCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGttt < 1:3049413/100‑1 (MQ=255)
acacCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGtttt < 2:456815/101‑1 (MQ=255)
tCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGACGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGGAcc > 2:3137932/1‑101 (MQ=255)
aCAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCAccccc < 2:874022/101‑1 (MQ=255)
aCAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCAccccc < 1:231738/101‑1 (MQ=255)
cAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.TG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCg < 1:2701829/101‑1 (MQ=255)
aaTCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGGCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.GC..GGGGGGTTTGCACCCCCgg > 2:2157895/1‑101 (MQ=255)
aTCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCggg < 2:4387370/101‑1 (MQ=255)
ccGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.GC..GGGGGGTTTGCACCCCCGGGcccc > 1:2087389/1‑101 (MQ=255)
ccGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGcccc < 1:1678590/101‑1 (MQ=255)
ccGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCGGGcccc > 1:2961169/1‑101 (MQ=255)
cGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGTccccc < 1:3138132/101‑1 (MQ=255)
cGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGccccc < 2:2721726/101‑1 (MQ=255)
gAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGTAACCCCCGGCCCCCg > 2:1282900/1‑101 (MQ=255)
gAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCg < 2:1679548/101‑1 (MQ=255)
aGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGc < 2:1756378/101‑1 (MQ=255)
aGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGc < 1:483550/101‑1 (MQ=255)
gCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAAGGG.CC..GGGGGTTTTGACCCCCCGGGccccccc > 1:3384337/1‑99 (MQ=255)
cGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGata < 1:4177338/101‑1 (MQ=255)
gCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGatat < 1:2904487/101‑1 (MQ=255)
ccGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATAtt < 2:734209/101‑1 (MQ=255)
gTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTg < 1:567712/101‑1 (MQ=255)
gTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTg < 1:3241129/101‑1 (MQ=255)
tGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGa < 2:2647978/101‑1 (MQ=255)
tGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGa < 2:3908486/101‑1 (MQ=255)
gCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAg < 1:3722673/101‑1 (MQ=255)
gCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAg < 2:3912992/101‑1 (MQ=255)
aGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCCGGATATTTGAgga > 1:1476514/1‑100 (MQ=255)
ggCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCa < 1:221672/101‑1 (MQ=255)
gCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCaa < 2:1559822/101‑1 (MQ=255)
cGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAg < 1:1149085/101‑1 (MQ=255)
gggTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGTTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGa < 2:4318179/101‑1 (MQ=255)
ggTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGAt < 2:61472/101‑1 (MQ=255)
gTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATa < 1:810717/101‑1 (MQ=255)
gTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATa < 1:652438/101‑1 (MQ=255)
gTCGAAAGGATGGTGCCGCTGCCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CT..GTGGGTTTTGCCCCCCCCGGCCCCCCCACGGCGTTTGAGGGAAGATa > 2:4475234/1‑101 (MQ=255)
tCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTTCACCCCCCGGCCCCCGCAGGGTATTTGAGGCAAGATaa > 1:4285020/1‑101 (MQ=255)
cGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCAACCCCCGGCCCCCCCAGGATATTTTAGGCAAGATaaa > 1:1036740/1‑101 (MQ=255)
aaaGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCCGGCCCCCGCCGGATATTTGAGGCAAGATaaaaa > 2:2623981/1‑100 (MQ=255)
aGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCGGGCCCCCCCAGGGTATTTTAGGCAAGATAAAAggg > 2:4133393/1‑99 (MQ=255)
ggATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GGCCC..GGGGGGTTTGCCCCCCCGGGCCCCC.CCCGATCTTTTACGCAAGAAaaaaagga > 1:4364705/1‑97 (MQ=255)
gATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGaa > 2:2369378/1‑101 (MQ=255)
gATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGaa < 1:403702/101‑1 (MQ=255)
gATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGaa < 1:1544992/101‑1 (MQ=255)
gATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCGGGCCCCCCCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGAGaa > 1:763101/1‑101 (MQ=255)
aTGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGaaa < 2:1446934/101‑1 (MQ=255)
aTGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGaaa < 2:2796997/101‑1 (MQ=255)
tGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAg < 1:1282991/101‑1 (MQ=255)
ggTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..CGGGGGTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTTAGGCAAGATAAAAGCGAAAGc > 2:3735052/1‑101 (MQ=255)
gTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CCG.GGGGGGTTTGACCCCCCGGGCCCCCCCGGGGACTTTGGGGCAAAAAaaaaagaaaaac > 1:4400896/1‑93 (MQ=255)
tGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCg < 2:3475617/101‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCg < 1:3551517/101‑1 (MQ=255)
cTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTc < 2:521707/101‑1 (MQ=255)
cTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTc > 2:3407945/1‑101 (MQ=255)
gTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CCG.GGGGGTTTTGACCCCCCGGGCCCCC.CCGGGTATTTTGGGCCAGAAAAAAAAGAAAACCcggggccg > 2:198177/1‑97 (MQ=255)
tCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CCCGGGGGGTTTTTCCCCCCCGCCCCCCCCCGGGGTTTTTGGGGAAAAAAAAAAGAAAAACCGggggcgg > 2:902500/1‑98 (MQ=255)
ttGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCt > 1:2136140/1‑101 (MQ=255)
ttGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCt < 1:1442402/101‑1 (MQ=255)
tGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GGCCC..GGGGGTTTTTGCCCCCCGGGCCCCCCCCGGAAATTTTGGGGAAAAAAAAAAGAAAACCCgggggtggcct > 1:3796413/1‑94 (MQ=255)
tGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCtt < 2:3249247/101‑1 (MQ=255)
cAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCa < 1:4382080/101‑1 (MQ=255)
cAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGACTTTCa > 1:3849301/1‑101 (MQ=255)
aGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAg < 2:289635/101‑1 (MQ=255)
aGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAg < 1:4547637/101‑1 (MQ=255)
gTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGt < 2:1816455/101‑1 (MQ=255)
tCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTc < 2:530357/101‑1 (MQ=255)
ccATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTcc < 2:3599392/101‑1 (MQ=255)
ggTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCt < 2:2036639/101‑1 (MQ=255)
ggTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCt < 2:3831259/101‑1 (MQ=255)
ggTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGGTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGGTATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGGCAGTCTTTCAGTCCGTCt > 1:2836383/1‑101 (MQ=255)
gCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCa < 1:2417179/101‑1 (MQ=255)
gCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCa < 2:3706454/101‑1 (MQ=255)
gCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCa < 1:3079950/101‑1 (MQ=255)
gCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCa < 2:1018551/101‑1 (MQ=255)
gCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCa < 1:3447572/101‑1 (MQ=255)
cccGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTGTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCAt < 2:2176332/101‑1 (MQ=255)
gTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCa < 2:4337689/101‑1 (MQ=255)
gACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGa < 1:4580845/101‑1 (MQ=255)
cGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAg > 2:2284821/1‑101 (MQ=255)
gAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGc < 2:1474435/101‑1 (MQ=255)
gAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGc < 2:1218500/101‑1 (MQ=255)
gAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGc < 2:1887063/101‑1 (MQ=255)
aa.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGCg > 2:2851780/1‑101 (MQ=255)
a.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGCgg > 1:1540575/1‑100 (MQ=255)
a.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGCGt < 2:1403777/101‑1 (MQ=255)
a.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGCGt < 2:4635738/101‑1 (MQ=255)
gg.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGCGTg < 1:2646177/101‑1 (MQ=255)
g.CC..GGGGGTTTTGCCCCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGCGTGc < 1:2369511/101‑1 (MQ=255)
g.CC..GGGGGTTTTGCCCCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGCGTGc < 2:3090670/101‑1 (MQ=255)
cc..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGCGTGCg < 1:1842266/101‑1 (MQ=255)
c..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGCGTGCgg < 1:4213757/101‑1 (MQ=255)
|
TGGCCGTGAACACCTCGACAATCGCCGAGCTTTCGCCGTGCAGGCGGGTCGAAAGGATGGTGCCGCTGTCTTGCCAGTCCATGGTGCCCGTGACGAA.GG.CC..GGGGGTTTTGCACCCCCGGGCCCCCGCAGGATATTTGAGGCAAGATAAAAGCGAAAGCCGGGGTCAGTCTTTCAGTCCGTCTTCATCCAGAAGCGTGCGG > NC_014034/3504026‑3504226
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 17 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|