Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,397,690 | 1 | .→G | 1.3% | 1.3 ‑2.2 ‑0.1 | 239 | coding (1572/1578 nt) | RCAP_rcc01307 | hypothetical protein |
Rejected: E-value exceeds prediction threshold. | ||||||||||
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (3/0): ref base (114/122): total (117/122) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.16e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.71e-01 |
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
GATCGAAACATCCGCGGATCGGCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGCGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGA > NC_014034/1397590‑1397790
gATCGAAACATCCGCGGATCGGCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTtgttctgttc < 1:1734896/101‑1 (MQ=255)
gATCGAAACAGCCGCGGATCGGCGTGCCCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTtgttctgttc < 1:340940/101‑1 (MQ=255)
aTCGAAACATCCGCGGATCGGCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTcc < 1:1839244/101‑1 (MQ=255)
tCGAAACATCCGCGGATCGGCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCg < 2:1598625/101‑1 (MQ=255)
cGAACCATCCGCGGACGGGCGCGCCCCGCCCCCCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCgg < 2:1376797/101‑1 (MQ=37)
cGAAACATCCGCGGATCGGCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCgg > 1:2998738/1‑101 (MQ=255)
cGAAACATCCGCGGATCGGCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCgg > 1:3790830/1‑101 (MQ=255)
gAAACATCCGCGGATCGGCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGt > 1:1104671/1‑101 (MQ=255)
aaaCATCCCCGGATCGGCGTGCCCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTa < 1:2014590/101‑1 (MQ=255)
aataTCCGCGGATCGGCGTGCCCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTaa < 2:3187934/98‑1 (MQ=255)
aCATCCGCGGATCGGCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAAc < 1:530291/101‑1 (MQ=255)
cATCCGCGGATCGGCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACa > 2:4380967/1‑101 (MQ=255)
cATCCGCGGATCGGCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACa < 1:387954/101‑1 (MQ=255)
aTCCGCGGATCGGCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAg > 1:4046545/1‑101 (MQ=255)
aTCCGCGGATCGGCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAg < 1:787004/101‑1 (MQ=255)
cgcgGATCGGCGTGCCCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTc < 1:1802893/101‑1 (MQ=255)
gcgGAGCGGCGTGCCCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCg < 2:4141777/101‑1 (MQ=255)
gcgGACCGGCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCg < 2:2106573/101‑1 (MQ=255)
gATCGGCGTGCCCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTc < 2:1850421/101‑1 (MQ=255)
tCGGCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTccc < 1:3605790/101‑1 (MQ=255)
tCGGCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTccc > 2:4623136/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTccccc > 1:448505/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTccccc < 2:347551/101‑1 (MQ=255)
ggCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTccccc > 1:3329528/1‑101 (MQ=255)
gCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTcccccc > 2:718283/1‑101 (MQ=255)
cGTGCCCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCcg < 2:3632136/101‑1 (MQ=255)
cGTGCCCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCcg < 2:1104585/101‑1 (MQ=255)
gTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCcgc > 2:2855333/1‑101 (MQ=255)
gACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGCCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCgg > 1:2874711/1‑101 (MQ=255)
ccgccccgccCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCggggg > 1:3677046/1‑99 (MQ=255)
ccgccccgccCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCggggg > 2:193298/1‑99 (MQ=255)
cgccccgcccATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGgggc > 2:4520541/1‑101 (MQ=255)
cgccccgcccATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGgggc > 1:671691/1‑101 (MQ=255)
cgccccgcccATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGgggc < 1:1139997/101‑1 (MQ=255)
gccccgcccATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGggcg > 1:1402314/1‑101 (MQ=255)
ccgcccATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg > 2:1264545/1‑101 (MQ=255)
cgcccATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa > 1:2424206/1‑101 (MQ=255)
cccATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:1713759/101‑1 (MQ=255)
ccATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 2:2941442/1‑101 (MQ=255)
aTCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 1:3104802/101‑1 (MQ=255)
tCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 1:252299/101‑1 (MQ=255)
gcagTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 2:2578687/4‑101 (MQ=255)
cGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGCGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGCGGCTCGAAAc > 2:4279836/1‑101 (MQ=38)
tCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTg > 2:3782883/1‑101 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGt > 1:432430/1‑101 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGt > 2:3571476/1‑101 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGa < 1:2236546/101‑1 (MQ=255)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGAcg < 2:4687598/101‑1 (MQ=255)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGAcg < 2:4330194/101‑1 (MQ=255)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGAcgc < 2:593001/101‑1 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCtc > 1:2330845/1‑101 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCtca > 1:1886803/1‑101 (MQ=255)
ggggCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCtcat > 1:4241214/1‑101 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTATGACGCGCtcatc > 2:1048774/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCtcatca < 2:3337968/101‑1 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCtcatca > 2:3853719/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCtcatca < 2:760989/101‑1 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCtcatca < 2:2698230/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGc < 1:1563406/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGc < 1:2743312/101‑1 (MQ=255)
gTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCa < 2:4591562/101‑1 (MQ=255)
gATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGt > 2:3712873/1‑101 (MQ=255)
aTCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTc > 2:911010/1‑101 (MQ=255)
tCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCa > 1:2107309/1‑101 (MQ=255)
tCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCa > 2:406688/1‑101 (MQ=255)
tCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCa > 2:3275779/1‑101 (MQ=255)
tCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGATCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCa < 1:1929677/101‑1 (MQ=255)
cGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCaa < 1:2941618/101‑1 (MQ=255)
cGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCaa > 2:301536/1‑101 (MQ=255)
cGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCaa < 1:4381214/101‑1 (MQ=255)
gAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAg > 2:4439281/1‑101 (MQ=255)
aaaCTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGa > 1:1192813/1‑101 (MQ=255)
aaCTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGAt > 2:868610/1‑101 (MQ=255)
aaCTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGAt < 1:3028303/101‑1 (MQ=255)
cTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAATATTc < 2:2350712/101‑1 (MQ=255)
tACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCa < 1:3436790/101‑1 (MQ=255)
tACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCa < 1:3995174/101‑1 (MQ=255)
aCAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAg > 1:2639383/1‑101 (MQ=255)
aCAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAg > 1:4188060/1‑101 (MQ=255)
agagTTCCGGTCTTGTTCTTTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTc > 1:1324559/1‑101 (MQ=255)
tCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTcc < 2:2874535/101‑1 (MQ=255)
cGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTcccc < 1:868684/101‑1 (MQ=255)
cGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTcccc < 2:2794842/101‑1 (MQ=255)
cGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTcccc > 1:2920589/1‑101 (MQ=255)
ggTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTccccc > 2:3063136/1‑101 (MQ=255)
ggTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTccccc < 1:4744324/101‑1 (MQ=255)
gTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTcccccc < 2:3422308/101‑1 (MQ=255)
gTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTcccccc > 2:2825207/1‑101 (MQ=255)
gTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCCCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTcccccc < 1:3984730/101‑1 (MQ=255)
cTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTCCCCCcgc > 1:3347232/1‑101 (MQ=255)
tgttctgttcCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCANCACGTCAAGATTCAGTCGCTCCCCCCGCgg > 1:957209/1‑101 (MQ=255)
gttctgttcCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTCCCCCCGCggg < 1:4118332/101‑1 (MQ=255)
tctgttcCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTCCCCCCGCggggg > 1:735299/1‑101 (MQ=255)
cttttcCGGGAACAGGTCCCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc < 2:1886691/98‑1 (MQ=38)
ctgttcCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc > 2:3227849/1‑101 (MQ=255)
tgttcCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCg > 1:901161/1‑101 (MQ=255)
tgttcCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCg > 1:1612400/1‑101 (MQ=255)
gttcCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGt < 2:735225/101‑1 (MQ=255)
ttcCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg < 1:1264636/101‑1 (MQ=255)
tcCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg > 2:2028476/1‑101 (MQ=255)
GATCGAAACATCCGCGGATCGGCGTGACCCGCCCCGCCCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACAGAGTTCCGGTCTTGTTCTGTTCCGGTAACAGGTCGCTCCCCCCGCGGGCGCGTGGATCGAAACTTGTCTGACGCGCTCATCAGCACGTCAAGATTCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGA > NC_014034/1397590‑1397790
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|