| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,003 | 0 | A→G | 43.0% | 0.0 ‑3.0 ‑8.9 | 1547 | D218D (GAT→GAC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (315/349): ref base (463/418): total (778/769) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.08e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.18e-09 | ||||||||||
Only 100 of 1863 total aligned reads displayed.
GCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAT > NC_014034/221903‑222103
|
ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg > 1:3232752‑M1/62‑101 (MQ=255)
tcggatccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg > 1:3415051‑M1/54‑101 (MQ=255)
ccGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg < 1:1273344/101‑1 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg < 1:577681‑M1/50‑1 (MQ=255)
gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgggc < 1:1002062‑M1/51‑2 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 1:2107774‑M1/48‑1 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 2:1506095‑M1/52‑1 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 1:2501996‑M1/52‑1 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt < 2:4543974‑M1/61‑1 (MQ=255)
tCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 2:1099600/101‑1 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgggatcggtcgtctcc > 2:4019014‑M1/45‑96 (MQ=255)
cgggcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 1:135069‑M1/45‑101 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 2:431851‑M1/70‑1 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgctcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 1:3483390‑M1/37‑101 (MQ=255)
gccgtcggatcggtcgggtccgtgggatccGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 2:278931‑M1/31‑101 (MQ=255)
gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 2:2356309/1‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGgatcggcg < 2:2601130‑M1/69‑3 (MQ=255)
ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:1133834/101‑1 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGAt < 2:568295‑M1/79‑1 (MQ=255)
tcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg < 1:4510834‑M1/78‑1 (MQ=255)
tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg > 2:2058830/1‑101 (MQ=255)
gggCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGg < 1:3133588‑M2/101‑2 (MQ=255)
gggCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGg < 2:651949‑M2/101‑2 (MQ=255)
gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg < 2:2898036/101‑3 (MQ=11)
cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGCTCCGTCGGATCCGGGGGAGCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTTGGATCGGTgg > 2:3483178/11‑101 (MQ=11)
ggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg < 1:150902‑M1/80‑1 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgggg > 1:490616‑M1/21‑100 (MQ=255)
ggtccggaggatccgtcggctcagtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCAGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa < 2:2421331/93‑1 (MQ=11)
tcggtggtATCGGTTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 2:4366767/101‑1 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTGGGCGCCGCGGGGtc > 2:3414120/7‑101 (MQ=11)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAgcg > 2:3643353/6‑101 (MQ=11)
gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggg > 2:3837835/1‑100 (MQ=14)
ggggatcggtcgggttcgtgggagcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 1:4595084/99‑1 (MQ=14)
ggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtcg < 1:2963273/94‑1 (MQ=14)
ggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 1:4301284‑M1/94‑1 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGGCCGTGGGGTGGGTCGGGGCCGTggtgggggtcg > 2:2509603/2‑92 (MQ=11)
cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGAtcggtcg > 1:759595/1‑101 (MQ=255)
gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGat > 2:358152‑M2/2‑99 (MQ=255)
gtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGat > 1:1394421‑M2/2‑99 (MQ=255)
gtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGat > 2:4244936‑M2/2‑99 (MQ=255)
tcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc > 1:3028671/1‑101 (MQ=11)
cggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 2:1019090/101‑1 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGatcg > 1:2329145‑M2/1‑97 (MQ=255)
cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTCGGTGGGGGCGGTCggggcg > 2:1611777/1‑98 (MQ=11)
ggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCg < 1:2549881‑M1/94‑1 (MQ=255)
gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGCTcggg > 1:1997089/1‑98 (MQ=11)
tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGCTCGGCCGGCTCCGCGGGATCGGTCGGACCCGTCGGGTCGGTCGGGTCCgcg > 1:2619500/1‑99 (MQ=14)
tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtc < 2:1180631‑M2/101‑19 (MQ=255)
tcgggtccgtgggatcggtcgggtccatgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg < 1:2856035/101‑2 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcg < 2:3004407‑M2/101‑20 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCTGtgg > 1:3324314/1‑99 (MQ=11)
gggtccgtgggatgggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgg > 2:1996972‑M2/1‑81 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtagg > 2:2294778‑M2/1‑92 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtagg < 1:3588152‑M2/101‑10 (MQ=255)
gggtccgggggatcggtcgggtccgtgggctcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg < 2:93449/101‑1 (MQ=14)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggg > 2:3230208‑M2/1‑91 (MQ=255)
gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggga < 1:2186075‑M2/99‑11 (MQ=255)
atccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggat < 1:3806665‑M2/100‑12 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatc > 1:4197267‑M2/1‑89 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtg > 2:4650929/1‑100 (MQ=14)
tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatc < 2:1259185‑M2/101‑13 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcg < 1:1630305‑M2/101‑14 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcg < 2:2703809‑M2/101‑14 (MQ=255)
tgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggggtcgg < 2:1413406‑M2/100‑15 (MQ=255)
cgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtccg < 2:4112167/101‑3 (MQ=11)
cgtgggatcgggcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg < 1:2731124/101‑1 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg < 1:205874‑M2/101‑29 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgggcgg > 1:3994466/1‑101 (MQ=14)
gacgggctgggtcctttgggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggg < 2:3324112/93‑1 (MQ=11)
gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggt > 1:4668117‑M2/2‑81 (MQ=255)
atggggcgggtccgggggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt < 1:671760/95‑1 (MQ=11)
tcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtc > 1:835092‑M2/1‑80 (MQ=255)
tcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtc > 2:2202837‑M2/1‑80 (MQ=255)
ggggcggggccgtgggatgggtcggAGCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc < 1:172113/97‑1 (MQ=11)
gtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggggtcggtcgggtccgt < 1:1829014‑M2/101‑25 (MQ=255)
gtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGACCGggcgggtcagg > 2:1359750/1‑98 (MQ=11)
gtcgggtccgctggctccgtcggGTCCGTGGGCTCTGTCGGGGCCGTGCGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt < 2:488104/101‑1 (MQ=11)
ctcatatccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTACGTGGGATCGATCGGGTCCGTGGCATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGgtaggatccgt < 2:3941255/95‑1 (MQ=11)
tcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCGCTGGGGTCGGTCGGGGCCGTGGGGTCGgtcgggcccctg > 2:3716271/1‑98 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgg < 2:3131479‑M2/101‑27 (MQ=255)
gggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGggcgggtccgtggg > 2:4173667/1‑101 (MQ=11)
gatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg > 2:738460/3‑101 (MQ=11)
tccgtggtatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc > 2:1923158‑M2/1‑60 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtcggatc < 1:3892472‑M2/101‑31 (MQ=255)
ccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTAGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggccc > 1:4068714/1‑101 (MQ=11)
cgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg < 1:4137373‑M2/101‑33 (MQ=255)
gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt > 1:1192172/1‑101 (MQ=14)
gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggg < 2:2124443‑M2/101‑34 (MQ=255)
tgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTg > 1:2394857/1‑101 (MQ=11)
taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTg > 1:3683001/3‑101 (MQ=14)
gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggtcg < 1:944330‑M2/101‑36 (MQ=255)
gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg < 1:2288250/101‑3 (MQ=11)
atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtggggtccgtgggatcggtcgggg < 2:836570‑M2/101‑39 (MQ=255)
atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt > 1:1917072‑M2/1‑63 (MQ=255)
atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggat < 1:4422006‑M2/101‑50 (MQ=255)
tcggGTCCGTAGGATCCGTCGGGGCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:1719252/101‑1 (MQ=14)
cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgg > 2:4438724‑M2/1‑57 (MQ=255)
cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGGCGGGTCCGTCGGATAGGTCGGAtccgtgg > 1:4344723/1‑99 (MQ=11)
ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg < 1:1060138‑M2/101‑46 (MQ=255)
ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtggg > 2:1835161/1‑101 (MQ=11)
|
GCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAT > NC_014034/221903‑222103
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|