| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,018 | 0 | C→G | 0.4% | 0.3 ‑0.3 ‑0.0 | 1544 | P213P (CCG→CCC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: E-value exceeds prediction threshold. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (5/4): ref base (723/810): total (729/815) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.43e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.24e-01 | ||||||||||
Only 100 of 1898 total aligned reads displayed.
GCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCG > NC_014034/221918‑222118
|
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cgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 2:1133912‑M1/51‑101 (MQ=255)
tCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg > 2:137943/1‑101 (MQ=255)
gatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg < 1:4167757‑M1/54‑1 (MQ=255)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg < 2:4575188‑M1/60‑1 (MQ=255)
ggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 2:3004558‑M1/58‑1 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 1:2195883‑M1/64‑1 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg > 1:1342926‑M1/44‑101 (MQ=255)
ggcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 1:4092984‑M1/43‑101 (MQ=255)
tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCgta > 2:3406057‑M1/42‑100 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg < 1:1063949‑M1/61‑1 (MQ=255)
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gggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 1:2519882‑M1/62‑1 (MQ=255)
gttccgttggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa > 2:2437734‑M1/39‑101 (MQ=255)
ggtccgggggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa > 2:7493‑M1/33‑101 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 2:363914‑M1/65‑1 (MQ=255)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 1:211535‑M1/68‑1 (MQ=255)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGCAGGGTCGGTGGGAtcggt < 2:2817004‑M1/68‑1 (MQ=255)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtcggtc > 1:817873‑M1/33‑101 (MQ=255)
cGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 1:138446/1‑101 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:997474‑M1/77‑1 (MQ=255)
ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:2581837/101‑1 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc < 2:418800‑M1/74‑1 (MQ=255)
tcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGACcgtgggatcggctgggcg < 1:2861935‑M1/74‑8 (MQ=255)
tGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGCGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc < 1:4017661/101‑1 (MQ=255)
cggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:1295018‑M1/75‑1 (MQ=255)
atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGTTCCCTGGGATCGGACGGATACGTggatt > 1:547116/8‑98 (MQ=11)
tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 2:1537371/101‑1 (MQ=255)
tccgggggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 2:1741241/95‑1 (MQ=11)
tccgggggatcggtcggaTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc > 1:205543‑M1/19‑101 (MQ=255)
cgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg < 2:3562121‑M1/85‑1 (MQ=255)
gtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 1:3848245‑M1/16‑101 (MQ=255)
gtgggatcgggccgttccgtgggatccgtcggctccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 2:1203505/98‑1 (MQ=11)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtccgtc < 1:3561128‑M2/99‑10 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtccgtc > 2:1449741‑M2/3‑92 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtg > 1:91755‑M2/3‑92 (MQ=255)
tcggATCGGTGGGACCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:2081917/101‑1 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGAtcggtgg > 1:3361959/2‑99 (MQ=11)
gggtcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggaTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg < 1:1819547/98‑1 (MQ=11)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGAtcggtcgg > 2:658852/1‑101 (MQ=11)
gagcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcgga < 1:3730332/98‑2 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGat < 2:1051122‑M2/101‑3 (MQ=255)
tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatc > 1:4466897‑M2/1‑98 (MQ=255)
tccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGAATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 1:4309850‑M1/92‑1 (MQ=255)
tggtcgggtccgtgggggccgtcggagccgggggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:2333623/100‑1 (MQ=11)
tggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTGGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc < 2:2368785/100‑1 (MQ=11)
gtctcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatcc > 2:2610845‑M2/4‑97 (MQ=255)
ggggcgggtgcgtgggttcgggggggtccgtgggagcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc < 1:3070349/97‑1 (MQ=11)
cggtgggacccgggggatgggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGGCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:3946449/92‑1 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtccgtcggatcc < 1:2657447‑M2/101‑16 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGatcg > 2:491734‑M2/1‑97 (MQ=255)
cggtcggcgccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:849055/101‑1 (MQ=11)
cggccgggtccgtgggaccggtcgggtccgtgggatCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:438966/101‑1 (MQ=11)
ccgtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCTGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:1910486/99‑1 (MQ=14)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCg > 2:4477258/1‑101 (MQ=14)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccg < 2:2228012‑M2/101‑6 (MQ=255)
gtggggtccgtgggatcggtcgggtcggtgggatcggtcGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt < 1:3474652/98‑1 (MQ=11)
gtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 1:4223082/7‑101 (MQ=11)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGt > 2:4051867/1‑101 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggattggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGgggtccgtgggatcggtcgg < 2:2900363‑M2/101‑21 (MQ=255)
gggtccgggggatcggtcgggtccgtgggctcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg < 2:93449/101‑1 (MQ=14)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggg > 2:3230208‑M2/1‑91 (MQ=255)
gtccgtcgggtcggtcgggtccgtgggatcggtctgGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 2:3832307/101‑1 (MQ=11)
ccgtgggatcggtgggttccgggggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 1:1002194/101‑1 (MQ=11)
ccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGTTGGAgcg > 2:2306093/1‑101 (MQ=14)
ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcg < 1:3643766‑M2/101‑14 (MQ=255)
cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTGGGGTCGGTGGGAgcgg > 2:2003629/1‑101 (MQ=14)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggt > 1:298178‑M2/1‑86 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGCtgggt > 2:1946119/1‑101 (MQ=11)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggt < 2:3714980‑M2/101‑16 (MQ=255)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggt < 1:2421115‑M2/101‑16 (MQ=255)
tgtgatgggtggtgtacgtcgcatcggcgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:4672237/98‑1 (MQ=2)
gggattggtcgtgttcgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 1:4716434/101‑1 (MQ=11)
gggatcgggcgggtccggcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgttcg < 2:3479188/101‑1 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc < 2:4119051/101‑1 (MQ=11)
ctcatatccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTACGTGGGATCGATCGGGTCCGTGGCATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGgtaggatccgt < 2:3941255/95‑1 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgg < 2:3131479‑M2/101‑27 (MQ=255)
cgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGCGGGATCGgtcgggtccgcgg > 1:3265328/1‑98 (MQ=11)
gggtccgtcggatcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg < 1:2746371/101‑1 (MQ=11)
ggtccgtcggatcggtcggATCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg > 2:1635955‑M2/1‑62 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtggggt < 1:4650731‑M2/101‑30 (MQ=255)
atccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggat > 1:4372920‑M2/2‑72 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatc < 1:638720‑M2/101‑31 (MQ=255)
gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggt > 1:4545452‑M2/1‑68 (MQ=255)
ggggatcggtcgggTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc > 1:1985319‑M2/2‑67 (MQ=255)
gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg > 2:1881419‑M2/1‑66 (MQ=255)
gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg < 1:2288250/101‑3 (MQ=11)
gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg < 2:425937/101‑3 (MQ=11)
aggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCAGTGGGGTCCGTCGGGGCCGTgt > 2:2141490/2‑100 (MQ=11)
ggtcgtATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg > 1:1708213‑M2/1‑60 (MQ=255)
gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgt < 1:717830‑M2/101‑43 (MQ=255)
gtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgg > 2:2730970/1‑98 (MQ=11)
tcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 1:1259275/101‑1 (MQ=14)
gggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 2:569602/4‑101 (MQ=14)
gtcCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggat < 1:3195328‑M2/100‑48 (MQ=255)
aTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGACCCGTGGGAtccggggggc > 2:4330189/1‑93 (MQ=11)
cggtgGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtcc > 2:2534889‑M2/3‑41 (MQ=255)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccg > 1:1611877‑M2/1‑40 (MQ=255)
tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc > 2:331941‑M2/1‑49 (MQ=255)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcgggtcc > 1:1180721‑M2/1‑32 (MQ=255)
|
GCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCG > NC_014034/221918‑222118
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 14 ≤
ATCG
< 22 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|